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[發(fā)明專(zhuān)利]一種用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)分類(lèi)和鑒定的引物及其制備方法和應(yīng)用在審

專(zhuān)利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 201610101978.6 申請(qǐng)日: 2016-02-24
公開(kāi)(公告)號(hào): CN105525028A 公開(kāi)(公告)日: 2016-04-27
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 王剛;黃敏;黃波;張經(jīng)常 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: 西北農(nóng)林科技大學(xué)
主分類(lèi)號(hào): C12Q1/68 分類(lèi)號(hào): C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京方圓嘉禾知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11385 代理人: 董芙蓉
地址: 712100 陜*** 國(guó)省代碼: 陜西;61
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 用于 昆蟲(chóng) 分類(lèi) 鑒定 引物 及其 制備 方法 應(yīng)用
【說(shuō)明書(shū)】:

技術(shù)領(lǐng)域

發(fā)明屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑蠅)分類(lèi) 和鑒定的引物及其制備方法和應(yīng)用。

背景技術(shù)

蚋蟲(chóng),屬雙翅目長(zhǎng)角亞目蚋科(Simulidae),俗稱(chēng)黑蠅(blackfly)、駝背(挖背) 和刨錛。古代又稱(chēng)蜹,是醫(yī)學(xué)昆蟲(chóng)中呈世界性分布的一個(gè)重要類(lèi)群。它不但騷 擾吸血,侵襲人畜,而且是人類(lèi)和禽畜類(lèi)多種疾病的傳播媒介,其中包括人盤(pán) 尾絲蟲(chóng)病(Onchocerciasis)、畜類(lèi)盤(pán)尾絲蟲(chóng)病和由歐氏曼森線蟲(chóng)(Mansoneila Ozzanli)引起的曼森絲蟲(chóng)病及禽鳥(niǎo)住白細(xì)胞蟲(chóng)病(Leucocytozoonsis)等疾病。由于 蚋具群舞習(xí)性,成群地在人頭部飛行騷擾,可引起人情緒波動(dòng),表現(xiàn)為煩躁不 安、易激怒等。由于蚋類(lèi)個(gè)體較小且種間形態(tài)差異較小,在昆蟲(chóng)分類(lèi)界是分類(lèi) 學(xué)一大挑戰(zhàn),形態(tài)分類(lèi)局限于國(guó)內(nèi)極少數(shù)專(zhuān)家,不能全面快速地進(jìn)行種類(lèi)鑒別, 對(duì)是否攜帶河盲癥、盤(pán)尾絲蟲(chóng)病原的蚋的分布也不能做出識(shí)別,不能有效地做 出預(yù)警與分析,不能對(duì)防治措施的有效制定提供基本信息及數(shù)據(jù)。

現(xiàn)有針對(duì)蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑蠅)分類(lèi)和鑒定的引物如COI等在種間表現(xiàn)良好但 在種下表現(xiàn)較差,其他引物如ND4,ITS等也存在應(yīng)用范圍有限,使用效果較 差,操作比較繁瑣等缺點(diǎn)。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑蠅)分類(lèi)和鑒定的引物及其 制備方法和應(yīng)用,旨在解決現(xiàn)有針對(duì)蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑蠅)分類(lèi)和鑒定的引物,應(yīng) 用范圍有限,使用效果較差,操作繁瑣的問(wèn)題。

本發(fā)明是這樣實(shí)現(xiàn)的,一種用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)分類(lèi)和鑒定的引物,所述用于蚋 類(lèi)昆蟲(chóng)分類(lèi)和鑒定的引物序列:

SEQIDNO:1TATGTACTACCATGAGGACAAATATC

SEQIDNO:2AGCAAATAAAAAATATCATTC。

進(jìn)一步,所述用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)分類(lèi)和鑒定的引物片段370bp。

本發(fā)明的另一目的在于提供一種所述用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)分類(lèi)和鑒定的引物的制 備方法,所述制備方法包括以下步驟:

步驟一,總DNA的提取,采用試劑盒法,用100μL洗脫液溶解提取的樣 品,采用核酸滴定儀測(cè)定提取DNA的濃度及純度,進(jìn)行樣品檢測(cè)或者置于-20℃ 保存、備用;

步驟二,引物篩選,選出備選上游引物13條,下游引物13條,引物序列 SEQIDNO:1與SEQIDNO:2的組合;

步驟三,以所得基因組DNA為模板,利用上述兩對(duì)引物對(duì)基因組DNA中 的線粒體cytb基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增;

步驟四,取適量的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果,經(jīng)溴化乙錠染色 后于紫外燈下觀察,兩對(duì)引物擴(kuò)增的片段大小分別為400bp,將得到的特異性 產(chǎn)物測(cè)序,利用Chromas2.4軟件讀取測(cè)序結(jié)果。

進(jìn)一步,所述PCR反應(yīng)體系和條件為:PCR反應(yīng)體系為25μL,含2×PCR Mastermix12.5μL,正/反向引物各3μL,DNA模板2μL,含20~50ng DNA,ddH2O補(bǔ)足25μL;

PCR反應(yīng)條件為:94℃下預(yù)變性2min;而后35個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括 94℃變性30s,41-51℃退火30s,72℃延伸30s;最后72℃延伸5min。

進(jìn)一步,所述蚋類(lèi)分子鑒定引物的使用方法,使用1%瓊脂糖電泳檢測(cè)。

本發(fā)明提供的用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑蠅)分類(lèi)和鑒定的引物及其制備方法和應(yīng) 用,引物cytb組合來(lái)自于ChrisSimon1994,上下游為自己組合,在現(xiàn)有技術(shù)中 引物未被使用也未被應(yīng)用于蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑蠅)分類(lèi)中去,未見(jiàn)相關(guān)蚋類(lèi)昆蟲(chóng)(黑 蠅)鑒定文章使用過(guò)此引物;本發(fā)明的引物片段約370bp,易擴(kuò)增,在不同種間 的表現(xiàn)良好,相較其他引物,對(duì)于種下分化的表現(xiàn)要優(yōu)異一些;比應(yīng)用于蚋類(lèi) 昆蟲(chóng)(黑蠅)的其他cytb引物比要適用范圍更廣。

本發(fā)明運(yùn)用此引物技術(shù)與現(xiàn)有技術(shù)相比具有:

1、結(jié)果準(zhǔn)確可靠:已經(jīng)對(duì)采自中國(guó)的8種蚋蟲(chóng)進(jìn)行鑒定驗(yàn)證,結(jié)果的可靠 性具有充分的保證。

2、操作簡(jiǎn)便:應(yīng)用本發(fā)明方法,鑒定蚋類(lèi)昆蟲(chóng),一般的普通實(shí)驗(yàn)人員即可 完成,不需要專(zhuān)業(yè)的形態(tài)學(xué)鑒定知識(shí)。

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