[發明專利]鑒定香港巨牡蠣、有明牡蠣、太平洋牡蠣及其雜交種的微衛星引物和鑒定方法有效
| 申請號: | 201610098732.8 | 申請日: | 2016-02-23 |
| 公開(公告)號: | CN105624307B | 公開(公告)日: | 2020-02-14 |
| 發明(設計)人: | 馬海濤;喻子牛;肖述;張揚;李軍 | 申請(專利權)人: | 中國科學院南海海洋研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 44001 廣州科粵專利商標代理有限公司 | 代理人: | 劉明星 |
| 地址: | 510301 *** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鑒定 香港 牡蠣 太平洋 及其 雜交種 衛星 引物 方法 | ||
1.一種香港巨牡蠣、有明牡蠣、太平洋牡蠣及其雜交種的鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟:
提取牡蠣樣品的基因組DNA,以該基因組DNA作為模板,用微衛星引物進行PCR擴增,PCR產物進行凝膠電泳,然后分型判定;
如果PCR產物,若在308bp~347bp區間內出現1~2條條帶,則該牡蠣樣品為香港巨牡蠣,出現1條條帶說明該個體為純合子,出現2條條帶則說明該個體為雜合子;若在362bp~422bp區間內出現1~2條條帶,則該牡蠣樣品為有明牡蠣,出現1條條帶說明該個體為純合子,出現2條條帶則說明該個體為雜合子;若在206bp~242bp區間內出現1~2條條帶,則該牡蠣樣品為太平洋牡蠣,出現1條條帶說明該個體為純合子,出現2條條帶則說明該個體為雜合子;如果PCR產物同時在308bp~347bp區間和362bp~422bp區間內各出現1條帶,即同時擁有親本的1條特異性條帶的個體為香港巨牡蠣與有明牡蠣雜交子一代;如果PCR產物同時在308bp~347bp區間和206bp~242bp區間內各出現1條帶,即同時擁有親本的1條特異性條帶的個體為香港巨牡蠣與太平洋牡蠣雜交子一代;如果PCR產物同時在362bp~422bp區間和206bp~242bp區間內各出現1條帶,即同時擁有親本的1條特異性條帶的個體為有明牡蠣與太平洋牡蠣雜交子一代;
所述的微衛星引物為:
F:5’-CGACTGGTGGGAGTTTCTGAC-3’;
R:5’-GCCGCTTCTATCTCCTTTGC-3’。
2.根據權利要求1所述的鑒定方法,其特征在于,所述的以該基因組DNA作為模板,用權利要求1所述的微衛星引物進行PCR擴增,其PCR反應體系為:DNA模板50ng,Buffer 10mM,微衛星引物F和微衛星引物R各0.2mM,dNTP 0.2mM,Mg2+2.0Mm,Taq DNA聚合酶1U,用滅菌水補足25μL;反應程序為:94℃預變性5min;94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸1min,30個循環;72℃延伸10min。
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