[發明專利]一種心腦血管疾病文庫構建的試劑盒、方法及其應用在審
| 申請號: | 201610094510.9 | 申請日: | 2016-02-19 |
| 公開(公告)號: | CN105648067A | 公開(公告)日: | 2016-06-08 |
| 發明(設計)人: | 陳勇;劉冬梅;王玲 | 申請(專利權)人: | 北京樂普基因科技股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/10;C40B50/06 |
| 代理公司: | 北京品源專利代理有限公司 11332 | 代理人: | 鞏克棟;侯瀟瀟 |
| 地址: | 100176 北京市大興區北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 腦血管 疾病 文庫 構建 試劑盒 方法 及其 應用 | ||
1.一種心腦血管疾病文庫構建的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括針對ACTA2, CACNA2D1,DSC2,DSG2,DSP基因突變的檢測探針。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述檢測探針的核苷酸序列包含如SEQ IDNO.1-24所示的片段;
優選地,所述SEQIDNO:1-5所示的序列是用于檢測ACTA2基因突變的檢測探針;
優選地,所述SEQIDNO:6-9所示的序列是用于檢測CACBA2D1基因突變的檢測探針;
優選地,所述SEQIDNO:10-14所示的序列是用于檢測DSC2基因突變的檢測探針;
優選地,所述SEQIDNO:15-18所示的序列是用于檢測DSG2基因突變的檢測探針;
優選地,所述SEQIDNO:19-24所示的序列是用于檢測DSP基因突變的檢測探針。
3.根據權利要求1或2所述的試劑盒,其特征在于,所述檢測探針標記有鏈霉親合素。
4.根據權利要求1-3中任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括針對 ACTA2,CACNA2D1,DSC2,DSG2,DSP基因突變檢測的封閉引物;
優選地,所述檢測封閉引物的核苷酸序列包含如SEQIDNO.25-44所示的片段。
5.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述封閉探針以排列組合的方式隨機配 對成96種組合形式的雜交文庫。
6.根據權利要求1-5中任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括:捕獲磁 珠懸浮液、PCR擴增引物和基因組DNA建庫試劑;優選地,所述捕獲磁珠懸浮液標記有生物 素;
優選地,所述PCR擴增引物是常規引物,所述PCR擴增引物包括正向引物和反向引物;
優選地,所述常規引物的核苷酸序列包含如SEQIDNO.1-2所示的片段。
優選地,所述PCR擴增引物的濃度為0.01-0.1mM,優選為0.02-0.5mM。
7.根據權利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述基因組DNA建庫試劑包括:0.02- 0.2MTris-HCl緩沖液、100-500μg/mLTaqDNA聚合酶、0.01-0.1M堿基A和0.1-0.5M接頭;
優選地,所述PCR擴增引物與所述接頭特異性結合。
8.一種利用如權利要求1-7中任一項所述的試劑盒用于構建心腦血管疾病高通量測序 文庫的方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)取待測樣品DNA片段化后加入建庫試劑孵育反應,構建測序文庫;
2)取構建好的文庫加入所述擴增引物進行PCR擴增反應;
3)取PCR擴增產物與所述檢測探針、檢測封閉引物混合,雜交孵育;
4)將雜交后的文庫與所述捕獲磁珠懸浮液混合孵育,捕獲雜交的文庫并洗滌;
5)將捕獲的雜交文庫中再加入所述擴增引物,進行PCR擴增并純化產物。
9.根據權利要求8所述的方法,其特征在于,步驟(1)所述的待測樣品為外周血、指尖血 或唾液中的任意一種或至少兩種的混合物。
10.一種如權利要求1-7中任一項所述的試劑盒、或權利要求8或9所述的方法用于檢測 心腦血管疾病的應用。
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