[發明專利]SSR與SNP兩種分子標記配合使用進行玉米輔助高效育種的方法

有效

• 申請號: 201610065777.5
• 申請日: 2016-01-29
• 公開（公告）號: CN105603083B
• 公開（公告）日: 2019-12-17
• 發明（設計）人: 趙久然;宋偉;王鳳格;田紅麗;易紅梅;葛建镕;李瑞媛;王元東;段民孝;趙衍鑫;張如養;李春輝
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;A01H1/04;A01H1/02
• 代理公司: 11002 北京路浩知識產權代理有限公司
• 代理人: 王文君

本發明涉及SSR與SNP兩種分子標記配合使用進行玉米輔助高效育種的方法，其是以玉米自交系京SD127為供體親本，京SD121為輪回親本，通過回交轉育獲得BC₁F₁代群體，利用6個SSR標記和104個SNP標記對BC₁F₁代群體進行背景選擇，篩選背景回復率高的單株，以加快玉米自交系京SD121的改良速度。通過比較SSR和SNP標記的背景選擇結果，兩種標記呈中等程度相關。因此，可以在回交早代將SSR和SNP標記結合使用進行背景選擇，從而實現大群體嚴選擇，提高選擇效率。

技術領域

本發明涉及分子生物學及遺傳育種領域，具體地說，涉及SSR與SNP兩種分子標記配合使用進行玉米輔助高效育種的方法。

背景技術

玉米常規育種是通過表型觀察選擇目標個體，不但依賴育種家的經驗，而且常常受到基因型和環境互作的影響，很難選擇到理想的基因型。分子標記輔助選擇是將分子標記應用于作物品種改良過程中進行選擇的一種輔助手段，主要包括對目標性狀的前景選擇和對遺傳背景的背景選擇。在回交轉育過程中利用分子標記輔助背景選擇，可以顯著加快背景回復的速度，縮短育種時間。

適用于背景選擇的分子標記需要滿足3個基本條件：簡單、快捷和低成本。SSR和SNP是目前在玉米遺傳育種中應用最為廣泛的兩種分子標記，二者各有優缺點。以PCR為基礎的SSR標記具有多態性高、操作簡單、重復性好等優點，但是難以實現位點的高通量。以序列為基礎的SNP標記分布密度高、遺傳穩定性好、易于實現高通量、自動化分析，但是檢測成本相對較高。本發明分別利用SSR和SNP標記對玉米回交轉育群體材料進行遺傳背景分析，比較兩種標記在分子標記輔助背景選擇上的應用效果，為今后開展相關工作提供有益參考。

發明內容

本發明的目的是提供SSR與SNP兩種分子標記配合使用進行玉米輔助高效育種的方法。

為了實現本發明目的，本發明的SSR與SNP兩種分子標記配合使用進行玉米輔助高效育種的方法，其是以玉米自交系京SD127為供體親本，京SD121為輪回親本，通過回交轉育獲得BC₁F₁代群體，利用6個SSR標記和104個SNP標記對BC₁F₁代群體進行背景選擇，篩選背景回復率高的單株。

其中，6個SSR標記的信息以及104個SNP標記的信息分別見表1和表2。

表1 6個SSR標記的信息

表2 104個SNP標記的信息

其中，N為A、T、G或C。

具體包括如下步驟：

1)提取待測植株的基因組DNA；

2)以待測植株的基因組DNA為模板，利用擴增所述SSR標記的引物，進行PCR擴增反應；

3)檢測PCR擴增產物。

優選地，步驟1)中采用CTAB法提取玉米的基因組DNA，待發苗后，取3～5葉期的葉片用于DNA提取。