[發明專利]一種進行固相PCR反應的自動化微流工作站及方法在審
| 申請號: | 201610061168.2 | 申請日: | 2016-01-28 |
| 公開(公告)號: | CN105505766A | 公開(公告)日: | 2016-04-20 |
| 發明(設計)人: | 張一桐;李鵬鑫;張祥林;胡秋萍;于丹;陳勇 | 申請(專利權)人: | 上海美吉逾華生物醫藥科技有限公司 |
| 主分類號: | C12M1/38 | 分類號: | C12M1/38;C12N15/10 |
| 代理公司: | 上海漢聲知識產權代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
| 地址: | 201023 上海市浦東新*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 進行 pcr 反應 自動化 工作站 方法 | ||
1.一種自動進行固相PCR反應的微流工作站,所述工作站包括:
至少一個微流控芯片,芯片含有一個或多個獨立的反應通道,每一反應通道包括進出口、 一個或多個串聯或并聯的反應腔室和/或流道,反應腔室底面錨定有寡核苷酸序列,以進行 固相PCR擴增和/或固相單堿基延伸反應;
液路系統,以控制引入不同反應試劑溶液流至對應的反應腔室;
溫控裝置,以控制調節所述反應腔室內的溫度;
控制系統,其連接上述液路系統和溫控裝置,用于控制液路系統和溫控裝置,在微流控 芯片的反應腔室內進行的固相PCR擴增和固相單堿基延伸反應,并包括變性-洗脫反應和洗 脫-變性反應。
2.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片包括上蓋、反應 通道和基底,上蓋設有反應通道的進出口,基底進行刻蝕挖槽成反應通道,通道長度為 2-8cm,深度為50um-200um,寬度為0.5mm~3mm,單個反應通道的反應體系總體積為 5ul~20ul。
3.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片包括上蓋、通道 柵欄和基底,上蓋設有反應通道的進出口,上蓋-通道柵欄-基底的“三明治結構”形成多個 獨立的反應通道。
4.根據權利要求2和3所述的微流控芯片,其特征在于,通過對分層結構的鍵合封裝, 形成可進出流通的封閉反應腔室。
5.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片材質為包括金屬、 玻璃、硅片和聚合物的至少一種或組合組成,其容納流體的有效結構至少在一個維度上為微 米級尺度,微流控芯片處于多個的狀態下,各個微流控芯片分別獨立與控制系統連接。
6.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述微流控芯片的固相襯底為平 面結構,可錨定高密度的一種或多種寡核苷酸序列,所述固相襯底平鋪錨定寡核苷酸序列是 通過羧基/醛基/環氧基-氨基、鏈霉親和素-生物素在內的多種化學修飾中的至少一種完成。
7.根據權利要求6所述的微流工作站,其特征在于,所述錨定在芯片通道底面的寡核 苷酸序列是PCR擴增所需的反向引物。
8.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述的固相單堿基延伸反應包括 發生一個或多個退火-延伸反應。
9.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述溫控裝置設置在芯片反應腔 室的底面。
10.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述液路系統包括設置各種所述 試劑的容器、與反應通道相連的通路及控制閥,所述試劑包括用于PCR擴增的正向引物/單 堿基延伸引物、脫氧核糖核苷三磷酸/雙脫氧核糖核苷三磷酸、反應酶、反應緩沖液和清洗 緩沖液在內,控制系統與此控制閥相連接,以控制閥門的開關或通路流量的大小。
11.根據權利要求1所述的微流工作站,其特征在于,所述控制系統包括電力提供裝置、 控制器、采集器、顯示裝置和/或輸出裝置,電力提供裝置給微流工作站提供電力,控制器 連接采集器,顯示裝置和/或輸出裝置,并連接液路系統和溫控裝置。
12.一種基于權利要求1所述的基于微流控芯片實現固相PCR反應的方法,其特征在 于,包括以下步驟:
A:在微流控芯片的每一反應通道的固相襯底上發生固相PCR擴增反應;
B:在經過變性處理及洗脫后,目標單鏈DNA片段固定在固相襯底;
C:進行固相單堿基延伸反應,并對延伸產物進行提純分離。
13.根據權利要求12所述的方法,其特征在于,步驟A進一步包括:
控制系統將含有PCR反應液、dNTP、DNA模板/全血、正向引物在內的混合液由液路系 統引入固相襯底錨定連接有反向引物的反應腔室,
控制系統控制溫控系統在經過若干次的變性、退火、延伸后生成含有反向引物的目標單 鏈DNA和含有正向引物的互補單鏈DNA,兩條單鏈DNA可互補生成雙鏈DNA,并通過反向 引物固定在通道底面。
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