[發明專利]一種牡蠣皰疹病毒不同變異株的巢式PCR檢測方法在審
| 申請號: | 201610052695.7 | 申請日: | 2016-01-26 |
| 公開(公告)號: | CN105543415A | 公開(公告)日: | 2016-05-04 |
| 發明(設計)人: | 白昌明;王崇明;高文輝;汪清晨;史杰;張慶利 | 申請(專利權)人: | 中國水產科學研究院黃海水產研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 青島海昊知識產權事務所有限公司 37201 | 代理人: | 曾慶國 |
| 地址: | 266071 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 牡蠣 皰疹病毒 不同 變異 pcr 檢測 方法 | ||
1.一種檢測牡蠣皰疹病毒的巢式PCR引物組,其特征在于,所述的 引物組的信息如下:
Pol-F:5'-GATTTCAACTCGCAATACC-3'、
Pol-R:5'-GGCAGACACAGATTCCACA-3'、
nPol-F:5'-GTGTTTCTACATTGCTGG-3'、
nPol-R:5'-CTGTTGGCGTTGACCTTC-3'。
2.權利要求1所述的巢式PCR引物組在制備檢測牡蠣皰疹病毒的制 品中的應用。
3.一種檢測牡蠣皰疹病毒的方法,其特征在于,所述的方法使用權 利要求1所述的巢式PCR引物組。
4.如權利要求3所述的方法,其特征在于,所述的方法首先從待檢 測樣品中制備反應模板,并配制巢式PCR反應體系,然后通過巢式PCR 反應程序對反應模板進行擴增,最后根據PCR產物瓊脂糖凝膠電泳是否產 生目的條帶對檢測結果進行判斷,如果顯示目的條帶則表示該樣品的牡蠣 皰疹病毒檢測結果為陽性。
5.如權利要求4所述的方法,包含有如下的步驟:
1)基因組DNA提取:采用普通動物組織的DNA提取方法,從待檢 測的樣品中提取DNA;
2)第一輪PCR擴增:
以步驟1)中得到的樣本DNA為模板,采用Pol-F/Pol-R引物,經PCR 擴增得到第一輪PCR擴增產物;
3)第二輪PCR擴增:
以第一輪PCR擴增產物10倍稀釋物為模板,采用nPol-F/nPol-R引 物,經PCR擴增得到第二輪PCR擴增產物;
4)PCR擴增產物檢測:
取第二輪PCR擴增產物進行電泳,如存在386bp的特異性條帶,則 確定所檢測的樣本被OsHV-1所感染。
6.如權利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步驟2)所用PCR 反應體系為:DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,10×PCRbuffer5.0μL,dNTPs (2.5mmol/L)4.0μL,Mg2+(25mmol/L)4.0μL,上下游引物(10.0μmol/L) 各2.0μL,DNA模板2.0μL,另外加超純水30.6μL補齊到50μL的反應體 系。
7.如權利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步驟2)所用PCR 反應程序為:首先94℃預變性5min;然后94℃變性30s,53℃變性30 s,72℃延伸45s,35個循環;最后72℃延伸10min,4℃保存。
8.如權利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步驟3)所用PCR 反應體系為:DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,10×PCRbuffer5.0μL,dNTPs (2.5mmol/L)3.0μL,Mg2+(25.0mmol/L)3.0μL,上下游引物(10.0μmol/L) 各2.0μL,DNA模板2.0μL,另外加超純水32.6μL補齊到50μL的反應體 系。
9.如權利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步驟3)所用PCR 反應程序為:首先94℃預變性5min;然后94℃變性30s,51℃變性30 s,72℃延伸45s,25個循環;最后72℃延伸10min,4℃保存。
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