[發明專利]檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒及方法在審
| 申請號: | 201610045714.3 | 申請日: | 2016-01-22 |
| 公開(公告)號: | CN105624293A | 公開(公告)日: | 2016-06-01 |
| 發明(設計)人: | 何勝祥;管俊杰;劉代新;李昂 | 申請(專利權)人: | 上海同科生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海精晟知識產權代理有限公司 31253 | 代理人: | 杜蔚瓊 |
| 地址: | 200092 上海市楊*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 hla 5801 等位基因 多色 熒光 pcr 試劑盒 方法 | ||
1.一種檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于,包括:
檢測基因HLA-B*5801的兩個正向引物、兩個反向引物及三個檢測探針的檢測引物探針 組合,包括檢測內參基因的一個正向引物、一個反向引物及一個內控探針的內控引物探針。
2.如權利要求1所述的檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于:
其中,檢測基因HLA-B*5801的第一正向引物F1為:HLA-B*5801F1:5’- GGCGGGTCTCAGCCCCTCCTCG-3’,
第一反向引物R1為:HLA-B*5801R1:5’-CCCACTGCCCCTGGTACCCGCGC-3’。
3.如權利要求1所述的檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于:
其中,檢測引物探針包括:第一檢測探針:5’-FAM-ACACGGAACATGAAGGCCTCCGC-BHQ2- 3’。
4.如權利要求1所述的檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于:
檢測引物探針包括:第二檢測探針:5’-JOE-TCGGGCCCCAGGTCGCAGCCATA-BHQ2-3’。
5.如權利要求1所述的檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于:
檢測引物探針包括:第三檢測探針:5’-CY5-CTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGGT-BHQ2-3’。
6.如權利要求1所述的檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于:
其中,檢測基因HLA-B*5801的第二正向引物F2為:5’-TTCTGACTCTTCCCATCAGACC-3’,
第二反向引物R2為:5’-CCCTCCTTACCCCATCTCAGG-3’。
7.如權利要求1所述的檢測HLA-B*5801等位基因的多色熒光PCR試劑盒,其特征在于:
其中,檢測內參基因的正向引物為:5’-CATTCTAAACTGTACCCTGTTACT-3’;
檢測內參基因的反向引物為:5’-GCCACACTGAGTGAGCTGCACTG-3’;
檢測內參基因的檢測探針為:5’-ROX-CCTTCCTATGACATGAACTTAACC-BHQ2-3’。
8.一種檢測HLA-B*5801等位基因的方法,其特征在于,包括如下步驟:
第一步:準備待檢測DNA
第二步:PCR反應體系配制
在熒光PCR專用管內按照下列配方配制PCR反應體系:
PCR反應液,25μl;基因組DNA,約100ng;ddH2O,加至50μl;
第三步:上機檢測
按照下列步驟設置溫度循環及信號采集程序:
溫度為95℃,時間為3分鐘;再次依照以下程序運行40個循環,變性:溫度為95℃,時間 為15秒,退火:溫度為60℃,時間為20秒,延伸:溫度為72℃,時間為30秒。
第四步:分析結果
在第三步中所述的PCR反應體系及溫度循環條件下,在內控信號形成正常對數擴增“S” 型曲線的前提下,觀察反應體系內特異性檢測熒光信號是否都形成對數擴增“S”型曲線,若 都形成“S”型曲線則該待檢DNA樣本為HLA-B*5801等位基因的陽性。
9.如權利要求8所述的多色熒光PCR檢測HLA-B*5801等位基因的方法,其特征在于:
其中,所述PCR反應液包含PCR反應的緩沖液、鎂離子、dNTP、核酸聚合酶,以及如權利要 求2-7中所述的正向引物、反向引物和探針。
10.如權利要求8所述的多色熒光PCR檢測HLA-B*5801等位基因的方法,其特征在于:
第一步中,待檢測DNA濃度應不小于50ng/μl;OD260nm/OD280nm在1.7~2.0之間。
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