[發明專利]一種與小麥株型和產量相關基因TaGDRG-2A分子標記及其應用

有效

• 申請號: 201610031028.0
• 申請日: 2016-01-18
• 公開（公告）號: CN105463118B
• 公開（公告）日: 2018-09-14
• 發明（設計）人: 景蕊蓮;李波;毛新國;昌小平;李昂;王景一
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院作物科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;白艷

1.一種鑒定或輔助鑒定小麥株高和/或分蘗數和/或產量性狀的方法，是檢測待測小麥的基因型為Hap-2A-1基因型、Hap-2A-2基因型還是Hap-2A-3基因型，

基因型為Hap-2A-2的待測小麥和基因型為Hap-2A-3的待測小麥的株高均低于基因型為Hap-2A-1的待測小麥；

基因型為Hap-2A-2的待測小麥和基因型為Hap-2A-3的待測小麥的分蘗數均低于基因型為Hap-2A-1的待測小麥；

基因型為Hap-2A-2的待測小麥和基因型為Hap-2A-3的待測小麥的產量均高于基因型為Hap-2A-1的待測小麥；

所述Hap-2A-1基因型為TaGDRG-2A基因第117位脫氧核糖核苷酸為T，且第900位脫氧核糖核苷酸為C、且第2096位脫氧核糖核苷酸為C、且第2205位脫氧核糖核苷酸為G，且第2637位脫氧核糖核苷酸為C的純合體；

所述Hap-2A-2基因型為TaGDRG-2A基因第117位脫氧核糖核苷酸為T，且第900位脫氧核糖核苷酸為T、且第2096位脫氧核糖核苷酸為C、且第2205位脫氧核糖核苷酸為G，且第2637位脫氧核糖核苷酸為C的純合體；

所述Hap-2A-3基因型為TaGDRG-2A基因第117位脫氧核糖核苷酸為C，且第900位脫氧核糖核苷酸為T、且第2096位脫氧核糖核苷酸為T、且第2205位脫氧核糖核苷酸為A，且第2637位脫氧核糖核苷酸為T的純合體。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于：所述檢測待測小麥的基因型為Hap-2A-1基因型、Hap-2A-2基因型還是Hap-2A-3基因型的方法為A)或B)：

A)直接測序；

B)用能夠擴增含有小麥TaGDRG-2A基因第900位脫氧核糖核苷酸和第2637位脫氧核糖核苷酸的引物擴增所述待測小麥基因組DNA，得到PCR擴增產物，用限制性內切酶酶切所述PCR擴增產物，得到酶切產物，根據所述酶切產物確定待測小麥的基因型為Hap-2A-1基因型、Hap-2A-2基因型還是Hap-2A-3基因型。

3.根據權利要求2所述的方法，其特征在于：所述能夠擴增含有小麥TaGDRG-2A基因第900位脫氧核糖核苷酸和第2637位脫氧核糖核苷酸的引物為成套引物A：

所述成套引物A由引物對A和引物對B組成；

所述引物對A由序列2所示的單鏈DNA分子和序列3所示的單鏈DNA分子組成；

所述引物對B由序列4所示的單鏈DNA分子和序列5所示的單鏈DNA分子組成；

所述限制性內切酶為限制性內切酶ScaⅠ和限制性內切酶NheⅠ；

所述B)包括如下步驟：以待測小麥的TaGDRG-2A基因為模板，分別采用所述引物對A和所述引物對B進行擴增，分別得到PCR擴增產物A和PCR擴增產物B；再用限制性內切酶ScaⅠ酶切所述PCR擴增產物A，得到酶切產物S，且用限制性內切酶NheⅠ酶切所述PCR擴增產物B，得到酶切產物N；

根據酶切產物判斷待測小麥的基因型，方法如下：

若酶切產物S僅含有大小為271bp的條帶，則待測小麥的基因型為Hap-2A-1基因型；

若酶切產物S僅含有大小為246bp和25bp的條帶，且酶切產物N僅含有大小為540bp的條帶，則待測小麥的基因型為Hap-2A-2基因型；

若酶切產物S僅含有大小為246bp和25bp的條帶，且酶切產物N僅含有大小為367bp和173bp的條帶，則待測小麥的基因型為Hap-2A-3基因型。

4.檢測待測小麥TaGDRG-2A基因第117位、第900位、第2096位、第2205位和/或第2637位脫氧核糖核苷酸的基因型的物質在鑒定或輔助鑒定小麥株高和/或分蘗數和/或產量相關性狀中的應用；

或檢測待測小麥TaGDRG-2A基因第117位、第900位、第2096位、第2205位和/或第2637位脫氧核糖核苷酸的基因型的物質在制備鑒定或輔助鑒定小麥株高和/或有效分蘗數和/或產量相關性狀的產品中的應用。