[發明專利]同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法在審
| 申請號: | 201610016285.7 | 申請日: | 2016-01-12 |
| 公開(公告)號: | CN105543367A | 公開(公告)日: | 2016-05-04 |
| 發明(設計)人: | 趙勇;肖莉莉;張昭寰;婁陽;杜蘇萍;潘迎捷 | 申請(專利權)人: | 上海海洋大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/63;C12R1/42 |
| 代理公司: | 上海伯瑞杰知識產權代理有限公司 31227 | 代理人: | 曹莉 |
| 地址: | 201306 上*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 同時 定量 南美 對蝦 中兩種 致病菌 方法 | ||
1.一種同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法,其特征在于,所述 方法包括如下步驟:
S1、將疊氮溴化丙錠母液加入待測的南美白對蝦蝦液勻漿中,獲得疊氮溴化 丙錠-樣品混合液;暗處理后曝光,高速離心,收集菌體;
S2、對所述菌體進行DNA提取;
S3、以提取得到的DNA為模板,以副溶血性弧菌的tlh基因和沙門氏菌的 orgC基因作為靶基因,進行多重熒光定量PCR擴增反應,輸出相應的循環閾值;
S4、將所述循環閾值分別與副溶血性弧菌標準曲線、沙門氏菌標準曲線進行 對照,獲得副溶血性弧菌和沙門氏菌的活菌濃度。
2.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S1中,所述疊氮溴化丙錠母液的制備包括:每1mg疊氮溴化 丙錠溶解于980μLddH2O中獲得2mM的母液,并于-20℃下避光保存。
3.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S1中,所述南美白對蝦蝦液勻漿是在每225ml蛋白胨水中加 入25g生鮮南美白對蝦,均質處理2~5min而得。
4.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S1中,所述疊氮溴化丙錠-樣品混合液中疊氮溴化丙錠的濃度 為100μM,暗處理的時間為15~20min,曝光的時間為15~20min。
5.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S2中,所述提取是按照天根細菌基因組DNA提取試劑盒的說 明書進行的。
6.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S3中,所述多重熒光定量PCR擴增反應采用的副溶血性弧菌 正引物的序列如SEQIDNO.1所示,副溶血性弧菌反引物的序列如SEQIDNO.2 所示,沙門氏菌正引物的序列如SEQIDNO.3所示,沙門氏菌反引物的序列如 SEQIDNO.4所示。
7.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S3中,所述多重熒光定量PCR擴增反應中,副溶血性弧菌探 針標記FAM作為報告基團,其序列如SEQIDNO.5所示;沙門氏菌探針標記HEX 作為報告基團,其序列如SEQIDNO.6所示。
8.根據權利要求1、6或7所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的 方法,其特征在于,所述多重熒光定量PCR擴增反應體系為每20μL,包括2μ L10×PCRBuffer、1.2μL濃度為50mM的MgSO4溶液、0.5μL濃度為10mM 的dNTPsmix溶液、0.2μL濃度為5U/μL的TaqDNA聚合酶、0.5μL濃度 為10μM的副溶血性弧菌正引物和反引物、0.5μL濃度為10μM的沙門氏菌 正引物和反引物、0.2μL濃度為10μM的副溶血性弧菌探針、0.2μL濃度為 10μM的沙門氏菌探針、DNA模板1μL以及ddH2O12.7μL。
9.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,所述多重熒光定量PCR擴增反應的條件為:95℃預變性2min,95℃ 變性15s,60℃退火1min,進行40個循環。
10.根據權利要求1所述的同時定量南美白對蝦中兩種致病菌活菌的方法, 其特征在于,步驟S4中,所述副溶血性弧菌標準曲線是以已知副溶血性弧菌活 菌濃度的南美白對蝦蝦液勻漿為對象,利用其菌落計數的結果和多重熒光定量 PCR輸出的Ct值構建的標準曲線;所述沙門氏菌標準曲線是以已知沙門氏菌活 菌濃度的南美白對蝦蝦液勻漿為對象,利用其菌落計數的結果和多重熒光定量 PCR輸出的Ct值構建的標準曲線。
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