[發(fā)明專利]一種提取古代生物骨骼DNA的裂解液及方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610014145.6 | 申請日: | 2016-01-08 |
| 公開(公告)號: | CN105420229B | 公開(公告)日: | 2018-07-17 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 李志遠;馬文波;鄧思浩;李彩月;陳旦;劉亮 | 申請(專利權(quán))人: | 中南大學 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 長沙市融智專利事務所 43114 | 代理人: | 袁靖 |
| 地址: | 410083 湖南*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 裂解液 骨骼 蛋白酶K 擴增效果 去蛋白液 高純度 離心柱 漂洗液 再利用 對骨 裂解 配方 | ||
本發(fā)明公開了一種提取古代生物骨骼DNA的裂解液及方法。所述裂解液配方:pH8.5Tris?HCl,10mM;EDTA,10?15mM;SDS,1.0?1.5wt%;NaCl,150mM;蛋白酶K,0.3?0.5mg/ml。通過將SDS、EDTA和蛋白酶K的組分分別提高,可明顯提高新裂解液對骨組織的裂解程度。同時在使用時再利用去蛋白液,DNA漂洗液處理,以及DNA離心柱法可明顯減少DNA樣品中的雜質(zhì)成分,有利于提高PCR的擴增效果,從而有助于獲取高純度古代生物骨骼的DNA。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物DNA提取技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種提取古代生物骨骼DNA的裂解液及方法。
背景技術(shù)
從古代生物骨骼中提取DNA對于探索古代生物的生命奧秘以及人類文明的發(fā)展具有重要意義。骨骼是一種比較特殊的生物檢測材料,因為外部有堅硬的保護組織,所以相對于生物體的其他組織臟器器官的降解比較慢。因此,對于高度腐化的樣本來說,骨骼是進行DNA檢測的有效檢測材料之一。由于受周圍環(huán)境中核酸酶和微生物的作用,古代生物骨骼中的DNA鏈會發(fā)生斷裂、缺失甚至降解,不易獲得足夠的DNA樣本。因此,目前尚需尋找一種更有效的DNA提取方法,為最大程度地提取和保存陳舊骨骼中的DNA。
由于骨骼組織異常堅固,提取DNA較其他軟組織困難。而現(xiàn)有的一些舊方法存在組織裂解不完全,DNA丟失較多,同時獲取的樣本含雜質(zhì)太多,苯酚/氯仿法對人體毒性大,即便脫鈣法也存在占用時間太長等缺點。本發(fā)明提供了一種新的骨組織DNA提取液,無需脫鈣處理和利用苯酚/氯仿,通過提高舊方法裂解液中SDS、EDTA和蛋白酶K的組分,增強裂解液對骨組織的裂解程度,使骨組織裂解更充分。骨骼裂解離心后,再將上清液利用異丙醇、去蛋白液,DNA漂洗液等處理,借助離心柱可更大程度地獲取高純度古代生物骨骼的DNA。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一種提取古代生物骨骼DNA的裂解液及方法。該裂解液及配套使用的方法能夠使得組織裂解完全,獲取的樣本雜質(zhì)少,更大程度地獲取高純度古代生物骨骼的DNA,而且使用環(huán)境無毒、操作簡便,時間短、效率高。
一種提取古代生物骨骼DNA的裂解液,所述裂解液配方是在去離子水中溶解:pH8.5Tris-HCl,10mM;EDTA,10-15mM;SDS,1.0-1.5wt%;NaCl,150mM;蛋白酶K,0.3-0.5mg/ml。
所述裂解液優(yōu)選配方是在去離子水中溶解:pH8.5Tris-HCl,10mM;EDTA,15mM;SDS,1.5wt%;NaCl,150mM;蛋白酶K,0.5mg/ml。
利用所述的裂解液提取古代生物骨骼DNA的方法,包括以下步驟:
1)剪取一小塊出土的古代人骨骼,將其碾碎,稱取0.3-0.4g放入1.5ml的EP管中;
2)加入250-300μl的裂解液,55-57℃孵育12–16h;
3)12000rpm離心10-15min,取200-250μl上清液入新EP管,按照體積比1:1加入250μl異丙醇,輕輕混勻后4℃靜置至少10min;
4)輕輕吹打混合液,并將混合液轉(zhuǎn)移至離心柱,12000rpm離心1-2min,棄收集管內(nèi)的液體;
5)加入500μl去蛋白液,12000rpm離心1min,棄收集管內(nèi)廢液;
6)加入600μl的漂洗液,12000rpm離心1min,棄收集管內(nèi)廢液,并重復一次操作,本步驟操作前,須預先在漂洗液中加入3倍體積的無水乙醇;
7)打開蓋子,24-26℃至少風干10–15min;
8)加入75℃預熱的去離子水30-50μl洗脫DNA;
9)將收集的DNA液加入離心柱內(nèi),相同條件下再次洗脫。
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