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[發明專利]一種檢測診斷主動脈夾層病致病基因的DNA文庫及其應用有效

專利信息
申請號: 201610004089.8 申請日: 2016-01-05
公開(公告)號: CN105442052B 公開(公告)日: 2018-05-18
發明(設計)人: 汪道文;李宗哲 申請(專利權)人: 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院
主分類號: C40B40/06 分類號: C40B40/06;C12Q1/6883;C12Q1/6874
代理公司: 北京中政聯科專利代理事務所(普通合伙) 11489 代理人: 謝磊
地址: 430030 湖*** 國省代碼: 湖北;42
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 檢測 診斷 主動脈 夾層 致病 基因 dna 文庫 及其 應用
【權利要求書】:

1.一種基于Ion TorrentTM高通量測序技術診斷主動脈夾層的DNA文庫,其特征在于,該文庫包括33個主動脈夾層致病相關基因,其中,所述33個主動脈夾層致病相關基因如下表所示:

2.權利要求1所述的DNA文庫在制備診斷試劑盒中的應用,其特征在于,所述試劑盒用于診斷主動脈夾層。

3.權利要求1所述的DNA文庫在制備診斷裝置中的應用,其特征在于,所述診斷裝置用于診斷主動脈夾層。

4.如權利要求3所述的應用,其特征在于,所述診斷裝置是測序芯片。

5.如權利要求2-4任一權利要求所述的應用,其特征在于,所述應用包括下列步驟:

(1)提供受試者樣本的基因組DNA;

(2)利用權利要求1所述的DNA文庫從Ion TorrentTM高通量測序平臺自動合成覆蓋全部33個致病基因的擴增引物文庫,對目標區域進行超多重PCR擴增;

(3)對步驟(2)得到的擴增產物進行酶切;

(4)對步驟(3)得到的酶切產物加Barcode接頭;

(5)對步驟(4)得到的連接產物進行純化;

(6)對步驟(5)得到的純化產物用通用引物進行二次擴增;

(7)對步驟(6)得到的二次擴增產物進行片段選擇及濃度測定,即建成患者目標區域擴增文庫;

(8)對步驟(7)所得到的文庫經過油包水PCR擴增反應后,將待測序目的片段連接于ISP珠子,得到反應液;

(9)將步驟(8)得到的包含ISP珠子的反應液點入芯片,上Ion TorrentTM高通量測序進行測序;

(10)將步驟(9)得到的堿基序列信息進行生物信息學比對處理,得到與疾病相關的突變位點;

(11)對步驟(10)得到的突變位點進行Sanger測序法驗證。

6.如權利要求5所述的應用,其特征在于,所述樣本來自受試者的外周血、體液、組織器官樣本。

7.一種診斷試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1所述的DNA文庫。

8.一種診斷裝置,其特征在于,所述裝置包括權利要求1所述的DNA文庫。

9.如權利要求8的診斷裝置,其特征在于,所述診斷裝置是測序芯片。

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