[發明專利]結直腸癌相關疾病的生物標志物

有效

• 申請號: 201580074801.5
• 申請日: 2015-01-30
• 公開（公告）號: CN108064273B
• 公開（公告）日: 2021-07-23
• 發明（設計）人: 馮強;梁穗莎;賈慧玨;王俊
• 申請（專利權）人: 深圳華大生命科學研究院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/689
• 代理公司: 中國貿促會專利商標事務所有限公司 11038
• 代理人: 林遠成

本發明提供了用于預測與微生物相關的疾病(特別是結直腸癌和結直腸中的進展性腺癌)的風險的生物標志物和方法。

相關申請的交叉引用

無

領域

本發明涉及用于預測與微生物相關的疾病，特別是結直腸癌和結直腸中的進展性腺瘤的風險的生物標志物和方法。

背景

結直腸癌(CRC)是全球前三位最常診斷的癌癥之一，是癌癥死亡的主要原因。其在較發達國家的發病率較高，但在諸如東亞、西班牙和東歐等歷史低風險地區，由于所謂的西方生活方式，發病率正在迅速上升。在結直腸癌的發展中，遺傳學改變累積了多年，通常涉及腫瘤抑制基因腺瘤性結腸息肉病基因(APC)的喪失，以及隨后分別發生在KRAS、PIK3CA和TP53中的激活或失活突變(Brenner,H.,Kloor,M.Pox,C.P.Colorectalcancer.Lancet383,1490-502(2014)，通過引用并入本文)。雖然大多數CRC病例是散發性的，但在其出現之前通常發生異常腺瘤，該異常腺瘤可進展為惡性形式，這稱為腺瘤-癌順序。結直腸腺瘤和結直腸癌的早期診斷不僅有助于防止死亡，而且也有助于降低手術干預的費用。

CRC是研究最多的與腸道微生物群相關的疾病之一。然而，該疾病的因果關系通常通過施用抗生素混合劑療法來研究，所述抗生素混合劑療法清除腸道微生物群而無法獲知起作用的確切微生物菌株和基因。相比于正常結腸組織，在結直腸癌中檢測到了梭桿菌屬(Fusobacterium)，并且發現其富集在腺瘤中。具核梭桿菌(Fusobacterium nucleatum)(一種牙周病病原體)，被發現能夠促進Apc^Min/+小鼠中腸道腫瘤的骨髓浸潤，并與小鼠和人中的促炎基因諸如Ptgs2(COX-2)、Scyb1(IL8)、Il6、Tnf(TNFα)和Mmp3的表達上調相關(Kostic,A.D.等,Fusobacterium nucleatum potentiates intestinal tumorigenesis andmodulates the tumor-immune microenvironment.Cell Host Microbe14,207-215(2013)，通過引用并入本文)。然而，目前尚不清楚，是否有更多的細菌或古細菌可作為結直腸癌病因的標志物或促成病因。

目前CRC的檢測，諸如可屈性乙狀結腸鏡檢查和結腸鏡檢查，都是侵入性的，并且患者可能會在該檢測過程和腸道準備過程中感到不舒服或不愉快。腸道微生物群與免疫系統之間的相互作用在腸內和腸外的許多疾病中具有重要作用(Cho,I.Blaser,M.J.Thehuman microbiome:at the interface of health and disease.Nature Rev.Genet.13,260-270(2012)，通過引用并入本文)。糞便DNA的腸道微生物群分析有潛力被用作無創性檢測，以發現可用作CRC患者早期診斷的篩選工具的特異性生物標志物，從而獲得更長的生存時間和更好的生活質量。

概要

本公開內容的實施方案旨在至少一定程度地解決現有技術中存在的至少一個問題。

本發明基于發明人的以下發現：