[發(fā)明專利]在樣品制備和測(cè)序期間使用鐵載體螯合劑減少DNA損傷有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201580070229.5 | 申請(qǐng)日： | 2015-10-26 |
| 公開(kāi)（公告）號(hào)： | CN107250358B | 公開(kāi)（公告）日： | 2021-03-30 |
| 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人： | V.P.史密斯;S.德羅齊雷斯 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人： | 伊盧米納劍橋有限公司 |
| 主分類號(hào)： | C12N15/10 | 分類號(hào)： | C12N15/10;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京市柳沈律師事務(wù)所 11105 | 代理人： | 張文輝 |
| 地址： | 美國(guó)加利*** | 國(guó)省代碼： | 暫無(wú)信息 |
| 權(quán)利要求書(shū)： | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū)： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 樣品 制備 期間 使用 載體 螯合劑 減少 dna 損傷 | ||
1.制備核酸文庫(kù)的方法，其包括：
從樣品提供多個(gè)核酸分子；并且
在包含去鐵胺B(DFO-B)甲磺酸鹽的試劑中操作所述多個(gè)核酸分子，且所述試劑不含有EDTA。
2.權(quán)利要求1的方法，其中操作所述多個(gè)核酸分子包括將所述多個(gè)核酸分子與多個(gè)寡核苷酸探針雜交。
3.權(quán)利要求2的方法，其中將所述多個(gè)核酸分子和/或所述多個(gè)寡核苷酸探針固定化在支持物上。
4.權(quán)利要求3的方法，其中通過(guò)結(jié)合配偶對(duì)將所述多個(gè)核酸分子和/或所述多個(gè)寡核苷酸探針固定化在所述支持物上。
5.權(quán)利要求3或權(quán)利要求4的方法，其中所述支持物是磁珠。
6.權(quán)利要求1-4中任一項(xiàng)的方法，其中操作所述多個(gè)核酸分子包括除去未特異性結(jié)合至所述多個(gè)核酸分子的寡核苷酸探針。
7.權(quán)利要求1-6中任一項(xiàng)的方法，其包括修飾特異性結(jié)合至所述多個(gè)核酸分子的寡核苷酸探針。
8.權(quán)利要求1-7中任一項(xiàng)的方法，其包括將所述多個(gè)核酸分子片段化。
9.權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)的方法，其包括將銜接頭添加到所述多個(gè)核酸分子。
10.權(quán)利要求9的方法，其中通過(guò)擴(kuò)增將所述銜接頭添加到所述多個(gè)核酸分子。
11.用于減少對(duì)核酸分子的氧化損傷的方法，所述方法包括在不存在EDTA的情況下且在存在去鐵胺B(DFO-B)甲磺酸鹽的情況下制備所述核酸分子。
12.權(quán)利要求11的方法，其中制備所述核酸分子包括將所述核酸分子暴露于Fe(III)。
13.權(quán)利要求11或12的方法，其中所述氧化損傷包含所述核酸分子中的點(diǎn)突變。
14.權(quán)利要求13的方法，其中所述點(diǎn)突變是C至A顛換。
15.用于增加測(cè)序反應(yīng)的Q(phred)得分的方法，所述方法包括在不存在EDTA的情況下且在存在去鐵胺B(DFO-B)甲磺酸鹽的情況下制備核酸分子。
16.權(quán)利要求15的方法，其中所述Q得分大于34。
17.權(quán)利要求15或16的方法，其中所述Q得分大于38。
18.權(quán)利要求15-17中任一項(xiàng)的方法，其中所述Q得分大于42。
19.權(quán)利要求15-18中任一項(xiàng)的方法，其中所述測(cè)序反應(yīng)是深度測(cè)序應(yīng)用。
20.權(quán)利要求19的方法，其中所述深度測(cè)序應(yīng)用是癌癥相關(guān)深度測(cè)序應(yīng)用。
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