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[發明專利]用于富集循環腫瘤DNA的方法有效

專利信息
申請號: 201580058989.4 申請日: 2015-10-29
公開(公告)號: CN107209190B 公開(公告)日: 2021-07-16
發明(設計)人: J.V.米卡萊夫;M.赫佐格;M.E.埃克萊斯頓 申請(專利權)人: 比利時意志有限責任公司
主分類號: G01N33/68 分類號: G01N33/68
代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 彭昶;黃希貴
地址: 比利*** 國省代碼: 暫無信息
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摘要:
搜索關鍵詞: 用于 富集 循環 腫瘤 dna 方法
【權利要求書】:

1.組蛋白H3.1和/或H3.2和/或H3t結合劑在制備用于從生物樣品中檢測、分離和/或純化腫瘤來源的無細胞核小體或循環腫瘤DNA (ctDNA)的試劑盒中的用途。

2.一種通過親和純化從生物樣品中分離腫瘤來源的循環無細胞核小體的方法,其中所述方法包括步驟:

(i)使所述樣品與組蛋白H3.1和/或H3.2和/或H3t結合劑接觸;

(ii)從所述樣品中分離結合的核小體;和

(iii)分析所述分離的核小體和/或相關DNA。

3.根據權利要求2的方法,其中所述分析所述分離的核小體和/或相關DNA的步驟包括免疫測定法。

4.根據權利要求2的方法,其中所述分析所述分離的核小體和/或相關DNA的步驟包括蛋白組學法。

5.根據權利要求2的方法,其中所述分析所述分離的核小體和/或相關DNA的步驟包括質譜法。

6.一種用于從生物樣品中分離純化的循環腫瘤DNA (ctDNA)的方法,其中所述方法包括步驟:

(i)分離含組蛋白3.1和/或H3.2和/或H3t的循環無細胞核小體;

(ii)從在步驟(i)中產生的核小體樣品中提取DNA;和

(iii)分析所述提取的DNA。

7.根據權利要求6的方法,其中所述分析所述提取的DNA的步驟包括:DNA測序、甲基化DNA測序分析、PCR、BEAMing、NGS (靶定基因組或全基因組)、數字PCR、冷PCR (較低變性溫度下的共擴增-PCR)、MAP (MIDI-激活的焦磷酸解)、PARE (重排末端的個性化分析)或質譜法。

8.根據權利要求1-7中任一項的用途或方法,其中所述生物樣品包括血液、血清或血漿樣品。

9.試劑在制備用于診斷癌癥的試劑盒中的用途,所述試劑用于在獲自人類或動物受試者的生物樣品中檢測循環無細胞核小體相關的組蛋白變體H3.1和/或H3.2和/或H3t。

10.根據權利要求9的用途,其中所述試劑盒另外包括用于檢測一種或多種組蛋白修飾、修飾核苷酸、組蛋白變體或同種型或核小體加合物的試劑。

11.根據權利要求10的用途,其中所述組蛋白修飾包括H3K27Ac和/或5-甲基胞嘧啶。

12.根據權利要求1-11中任一項的用途或方法,其中所述組蛋白H3.1和/或H3.2和/或H3t結合劑包括H3.1結合劑。

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