[發明專利]分析和解釋抗微生物敏感性測試的自動化方法

有效

• 申請號: 201580054127.4
• 申請日: 2015-10-05
• 公開（公告）號: CN107002115B
• 公開（公告）日: 2021-11-30
• 發明（設計）人: J-M·羅朗;D·拉烏特;S·萊帕赫;S·巴菲特
• 申請（專利權）人: 地中海傳染基金會;埃克斯-馬賽大學;公共援助馬賽醫院;國家科學研究中心;國家健康科學研究所
• 主分類號: C12Q1/04
• 分類號: C12Q1/04;C12Q1/18;G06T7/00
• 代理公司: 北京戈程知識產權代理有限公司 11314
• 代理人: 程偉;韓文華

本發明涉及一種用于解釋抗微生物敏感性測試的不同圖像的方法。根據所述方法，可以通過使用參照抗微生物敏感性測試的照片圖像庫比較照片，來識別抗生素抗性表型，而不需要根據EUCAST或CA?SFM解釋數據解釋所述圖像；條件是對于給定的表型，可獲得相同菌種的幾種細菌的照片集合以及可獲得相同表型。

技術領域

本發明涉及在化學微生物學領域中用于自動化讀取和解釋微生物對抗微生物劑的敏感性的測試的方法。

背景技術

本發明可主要在細菌學中用于細菌對抗生素的敏感性的測試，該測試被稱為“抗菌譜(antibiogrammes)”，以及在感染性疾病的研究中的其它領域，比如真菌對抗真菌劑的敏感性的顯微測試，該測試可以稱為抗真菌譜。

在本說明書中，術語“抗菌譜”用作測試細菌針對抗生素化合物和測試真菌針對抗真菌化合物的總稱。

抗菌譜是一種實驗室技術，試圖通過評估細菌生長被抑制的程度來測試細菌菌株對一種或多種潛在或已知抗生素的敏感性。原理在于在一種或多種抗生素的存在下，放置細菌培養物并觀察培養物的發育和存活的結果。為此，例如可以將多個抗生素浸漬的薄片放置在沉積在固體培養介質上的細菌菌株上。然后，抗生素從薄片擴散，由此在薄片周圍產生濃度梯度，其生長抑制區域對于裸眼是可見的，如果細菌對抗生素敏感，則薄片周圍出現暗圓環的形式。根據構成抗生素薄片的盤周圍的抑制區域的圓的直徑，存在三種類型的解釋：菌株或細菌可以是敏感的、中等的或抗性的。

這種薄片及其不同劑量的抗生素根據歐洲抗微生物敏感性測試委員會(EuropeanCommittee on Antimicrobial Susceptibility Testing，EUCAST)：www.eucast.org[T.Winstanley,P.Courvalin(2011),Expert systems in clinical microbiologyClin.Microbiol.Rev.24:pp.515-556.24/3/515[pli]；10.1128/CMR.00061-101,andR.Leclercq,R.Canton,D.F.Brown,C.G.Giske,P.Heisig,A.P.MacGowan,J.W.Mouton,P.Nordmann,A.C.Rodloff,G.M.Rossolini,C.J.Soussy,M.Steinbakk,T.G.Winstanley,and G.Kahlmeter(2013),EUCAST Expert rules in antimicrobial susceptibilitytestingClin.Microbiologie Infect.19:141-160.10.1111/j.1469-0691.2011.03703.x]和/或法國微生物學會的法國抗菌素委員會(French Comitéde l'Antibiogramme de la Société de Microbiologie，CA-SFM):www.sfm-microbiologie.org專家系統的建議進行標準化。抗生素薄片由基底材料制成，所述基底材料含有已知濃度的抗生素，并且適合擴散抗生素，比如浸漬有已知濃度的抗生素的吸水紙，依據抗生素，所述浸漬的抗生素大約范圍在1微克(μg)至500微克，并且它們由供應商i2a(Montpellier,法國)、BD(Becton Dickinson,美國)、Bio-Rad(Hercules,美國)、Biomerieux(Marcy l'Etoile,法國)銷售。

在固相瓊脂上用于進行抗菌譜的各種抗生素薄片帶有縮寫形式的抗生素的名稱，以在薄片的頂面標記一到三個字母代碼的形式標準化。

結果的讀取基本上由測量圓環(微生物菌株的生長被抑制的區域)的直徑組成。抑制直徑越大，細菌對被測試抗生素的敏感性越高，反之亦然。確定薄片的劑量以便獲得圓環直徑，所述圓環直徑與所討論的抗生素對被測試細菌的最小抑制濃度(CMI)成比例。

抑制直徑以毫米(mm)計，用尺子手工測量或通過使用能夠自動讀取直徑的讀數器測量。自動讀數器包含掃描儀，其具有照相機和抗生素薄片和位于這些盤周圍的抑制區域的探測器。