[發(fā)明專利]分析和解釋抗微生物敏感性測試的自動化方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201580054127.4
• 申請日: 2015-10-05
• 公開（公告）號: CN107002115B
• 公開（公告）日: 2021-11-30
• 發(fā)明（設(shè)計）人: J-M·羅朗;D·拉烏特;S·萊帕赫;S·巴菲特
• 申請（專利權(quán)）人: 地中海傳染基金會;埃克斯-馬賽大學(xué);公共援助馬賽醫(yī)院;國家科學(xué)研究中心;國家健康科學(xué)研究所
• 主分類號: C12Q1/04
• 分類號: C12Q1/04;C12Q1/18;G06T7/00
• 代理公司: 北京戈程知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11314
• 代理人: 程偉;韓文華

1.一種自動分析和解釋分析的細(xì)菌樣本的抗菌譜的方法，所述方法用于確定對至少一種抗微生物化合物的抗性或敏感性的表型，所述表型選自多種不同種類的參照細(xì)菌中的每種參照細(xì)菌種類的多種不同的參照表型，其中：

a)使用確定的方法，在固體培養(yǎng)介質(zhì)上，制備分析的細(xì)菌樣本的抗菌譜，所述方法包括：

·在所述固體培養(yǎng)介質(zhì)上，沉積確定濃度的細(xì)菌樣本，所述細(xì)菌樣本的濃度單位為CFU/mL；

·在所述固體培養(yǎng)介質(zhì)上，沉積確定數(shù)量n的多個基底，其中n在5至20的范圍，所述基底以確定的排列和確定的形式，每個含有確定濃度的確定的抗微生物化合物，并且對于n個所述基底中的每一個適合于擴(kuò)散一種確定的抗微生物化合物；和

·在確定的條件下以及確定的持續(xù)時間，孵育沉積在所述固體培養(yǎng)介質(zhì)上的細(xì)菌樣本；和

b)獲取在步驟a)中獲得的抗菌譜的照片圖像；和

c)通過使用圖像識別軟件將步驟b)中獲得的照片圖像與由參照圖像組成的數(shù)據(jù)庫中的參照抗菌譜的參照圖像進(jìn)行比較，確定分析的細(xì)菌樣本的所述表型，對于每種參照細(xì)菌種類的每種參照表型，所述數(shù)據(jù)庫包含多種相同細(xì)菌的p種不同菌株的抗菌譜的至少p種不同的參照圖像，其中p在6至42的范圍，其中所述圖像識別軟件用于比較對應(yīng)于基底周圍的抑制區(qū)域的圓環(huán)輪廓的形狀。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，在步驟c)中，所有參照抗菌譜使用與分析的細(xì)菌樣本的抗菌譜相同方法制備，并且所述參照圖像和分析的圖像是用相同的照片圖像捕獲裝置和在相同條件下拍攝的，所述相同條件是相同的距離、相同的亮度、相同的背景，以及相同分辨率。

3.根據(jù)權(quán)利要求1至2中任一項所述的方法，其特征在于，在步驟c)中，其中所述基底是抗生素薄片，且在抗生素薄片上指定抗生素代碼字母和劑量數(shù)字。

4.根據(jù)權(quán)利要求1至2中任一項所述的方法，其特征在于，確定分析的圖像和參照圖像之間的最小可接受的相似性百分比，下文稱為相似性閾值，如果識別軟件評估分析樣本的細(xì)菌抗菌譜的圖像與對應(yīng)于所述參照細(xì)菌菌種的所述參照表型的參照圖像之間的相似性百分比不小于70％，則確定分析樣本的細(xì)菌表現(xiàn)所述參照細(xì)菌的所述參照表型。

5.根據(jù)權(quán)利要求1至2中任一項所述的方法，其特征在于，確定每種參照細(xì)菌菌種的每種參照表型的p種不同菌株的不同抗菌譜的所述不同的 參照圖像之間的最小閾值相似性百分比，下文稱為參照相似性閾值，確定參照相似性閾值百分比，其對應(yīng)于每種參照細(xì)菌菌種的每種參照表型的兩種最不同的參照圖像之間的最低相似性百分比，如果識別軟件評估分析樣本的細(xì)菌抗菌譜的圖像與對應(yīng)于所述參照細(xì)菌菌種的所述參照表型的參照圖像之間的相似性百分比不小于參照相似性閾值，則分析樣本的細(xì)菌被確定為表現(xiàn)所述參照細(xì)菌的所述參照表型。

6.根據(jù)權(quán)利要求1至2中任一項所述的方法，其特征在于，所述參照表型是給定的抗生素或抗生素組合抗性或敏感性分類。

7.根據(jù)權(quán)利要求1至2中任一項所述的方法，其特征在于，參照表型是多種抗生素和/或抗生素組合的抗性或敏感性分類。

8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，其特征在于，所述參照表型包括兩種抗生素間的協(xié)同作用表型，所述兩種抗生素對應(yīng)于這樣兩種抗生素，即當(dāng)兩種抗生素單獨使用時對于參照細(xì)菌是抗性的，并且當(dāng)兩種抗生素組合使用時對于參照細(xì)菌是敏感的。