[發明專利]用于癌癥診斷、預后和治療選擇的著絲粒/動粒蛋白基因

有效

• 申請號: 201580036201.X
• 申請日: 2015-05-18
• 公開（公告）號: CN106661624B
• 公開（公告）日: 2021-04-06
• 發明（設計）人: 張衛國;加里·卡彭;毛建華
• 申請（專利權）人: 加利福尼亞大學董事會
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/53;G01N33/574;C12N15/11
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204
• 代理人: 王達佐;洪欣

1.為患有乳腺癌、肺癌、胃癌或卵巢癌腫瘤的患者評估疾病進展的可能性的試劑盒，其使用包括以下的方法：

檢測來自所述患者的腫瘤樣本中一組14種基因或所述組的至少9種基因的子集中各成員的RNA表達水平，其中所述14種基因是：CENP-A、HJURP、M1S18B、CENP-N、CENP-M、CENP-W、CENP-U、CENP-L、CENP-K、ZWINT、NDC80、NUF2、SPC24和SPC25；以及

將所述表達水平與所述疾病進展的可能性相關聯，其包括確定所述組中各成員的所述表達水平相對于由正常細胞確定的參考水平的標準化值；并將各基因表達的所述標準化值相加以產生風險評分，其中在來自與所述患者具有相同癌癥的參考對象群體的組的基因表達評分的參考標度前5％、前10％、前15％、前20％、前25％、前30％、前35％、前40％、前45％、前50％或前60％的高風險評分指示所述患者具有疾病進展的可能性。

2.評估患有乳腺癌、肺癌或卵巢癌腫瘤的患者中響應化療或放療的可能性的試劑盒，其使用包括以下的方法：

檢測來自所述患者的腫瘤樣本中一組9種生物標志物的RNA表達水平，其中所述9種生物標志物是：CENP-A、HJURP、MIS18B、CENP-N、CENP-M、CENP-U、ZWINT、NDC80和SPC25；以及

將所述表達水平與響應的可能性相關聯，其包括確定所述組中各成員的所述表達水平相對于由正常細胞確定的參考水平的標準化值；并將各生物標志物表達的所述標準化值相加以產生風險評分，其中在來自與所述患者具有相同癌癥的參考對象群體的組的基因表達評分的參考標度前5％、前10％、前15％、前20％、前25％、前30％、前35％、前40％、前45％、前50％或前60％的高風險評分指示所述患者具有響應化療或放療的可能性。

3.如權利要求1或2所述的試劑盒，其中檢測所述RNA表達水平包括進行擴增分析、雜交分析、測序分析或陣列。

4.評估患有乳腺癌、肺癌、胃癌或卵巢癌腫瘤的患者中疾病進展的可能性的試劑盒，其使用包括以下的方法：

檢測來自所述患者的腫瘤樣本中一組14種生物標志物或所述組的至少9種生物標志物的子集的表達水平，其中所述14種生物標志物是：CENP-A、HJURP、M1S18B、CENP-N、CENP-M、CENP-W、CENP-U、CENP-L、CENP-K、ZWINT、NDC80、NUF2、SPC24和SPC25；以及

將所述表達水平與所述疾病進展的可能性相關聯，其包括確定所述組中各成員的所述表達水平相對于由正常細胞確定的參考水平的標準化值；并將各生物標志物表達的所述標準化值相加以產生風險評分，其中當所述風險評分在來自與所述患者具有相同癌癥的參考對象群體的組的基因表達評分的參考標度的最高三分位數中時，所述患者具有疾病進展的可能性。

5.評估患有乳腺癌、肺癌或卵巢癌腫瘤的患者中響應化療或放療的可能性的試劑盒，其使用包括以下的方法：

檢測來自所述患者的腫瘤樣本中一組9種生物標志物的表達水平，其中所述9種生物標志物是：CENP-A、HJURP、MIS18B、CENP-N、CENP-M、CENP-U、ZWINT、NDC80和SPC25；以及

將所述表達水平與所述響應相關聯，其包括確定所述組中各成員的所述表達水平相對于由正常細胞確定的參考水平的標準化值；并將各生物標志物表達的所述標準化值相加以產生風險評分，其中當所述風險評分在來自與所述患者具有相同癌癥的參考對象群體的組的基因表達評分的參考標度的最高三分位數中時，所述患者具有響應化療或放療的可能性。

6.如權利要求4或5所述的試劑盒，其中所述表達水平是蛋白表達水平。

7.如權利要求6所述的試劑盒，其中檢測所述蛋白表達水平包括進行免疫分析。

8.如權利要求4或5所述的試劑盒，其中所述表達水平是RNA表達水平。