[發明專利]一種預測細胞表型不穩定性的方法

有效

• 申請號: 201580027265.3
• 申請日: 2015-04-02
• 公開（公告）號: CN106662574B
• 公開（公告）日: 2018-07-17
• 發明（設計）人: B·湯普森;D·詹姆斯;J·克利福德
• 申請（專利權）人: 瓦里泰細胞有限公司
• 主分類號: C12Q1/02
• 分類號: C12Q1/02;G01N33/50
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 江側燕

1.一種預測細胞系表型穩定的方法，包括步驟：

在測定期培養細胞系；

在測定期的多個不同時間點產生細胞系的環境響應指紋，其中每個環境響應指紋通過在至少三種不同的化學細胞應激源中的每種存在時測定細胞的環境響應產生；以及

比較多個環境響應指紋以檢測在測定期環境響應指紋的改變，其中在測定期環境響應指紋的改變程度指示細胞系中預測的表型不穩定性的程度。

2.根據權利要求1所述的方法，其中比較多個環境響應指紋以檢測在測定期環境響應指紋的改變的步驟包括：在所述至少三種不同的化學細胞應激源中的每種的環境響應指紋中檢測改變的步驟。

3.根據權利要求1所述的方法，其中所述環境響應是生長響應、產量響應或糖基化響應。

4.根據權利要求1所述的方法，其中所述多個不同時間點跨越測定期的一代或多代。

5.根據權利要求1所述的方法，其中所述環境響應指紋在測定期內的三個或更多個時間點產生。

6.根據權利要求1所述的方法，其中所述環境響應指紋在測定期內的四個或更多個時間點產生。

7.根據權利要求1所述的方法，其中每個所述環境響應指紋通過在至少三種不同的化學細胞應激源中的每種存在時測定細胞的環境響應產生。

8.根據權利要求1所述的方法，其中每個環境響應指紋通過在至少五種不同的化學細胞應激源中的每種存在時測定細胞的環境響應產生。

9.根據權利要求1所述的方法，其中所述化學細胞應激源選自氨基酸轉運抑制劑、細胞周期抑制劑、碳源、滲透壓應激源、氧化應激源、細胞凋亡引發劑、代謝效應物、pH調節劑、醣酵解抑制劑，以及毒素。

10.根據權利要求1所述的方法，其中所述細胞系是哺乳動物的生產細胞系。

11.根據權利要求1所述的方法，其中測定期環境響應指紋的改變通過選自歐幾里得距離、馬哈拉諾比斯距離、LDA距離、PCA距離的方法來確定。

12.根據權利要求1所述的方法，其中至少三種不同的化學細胞應激源中的每種的濃度設置為0.5到2倍IC50。

13.一種鑒定細胞的系統，該系統包括：

包括多個反應室的裝置；

單獨設置在該反應室內的至少三種不同的化學細胞應激源；

在三種不同的化學細胞應激源中的每種存在時測定細胞環境響應的測定系統；

存儲多個環境響應指紋的存儲系統，每個環境響應指紋對應細胞的多個環境響應；

配置用于比較多個環境響應指紋中的至少一些以檢測環境響應指紋改變的比較系統；以及

顯示比較步驟輸出的顯示系統。

14.根據權利要求13所述的系統，其中所述環境響應指紋是生長響應指紋、產量響應指紋或糖基化響應指紋。

15.根據權利要求13所述的系統，其中所述裝置是微量滴定板。

16.根據權利要求13所述的系統，其中所述比較系統包括計算模型，配置用于輸入在測定期的多個不同時間點的細胞環境響應指紋的計算模型，比較生長響應指紋、產量響應指紋或糖基化響應指紋以檢測指紋的改變，以及輸出部分基于指紋的改變的內容。