[發明專利]一種鑒定中國明對蝦遺傳性別的DNA序列標簽及其應用有效
| 申請號: | 201510944785.2 | 申請日: | 2015-12-16 |
| 公開(公告)號: | CN105349691B | 公開(公告)日: | 2018-12-25 |
| 發明(設計)人: | 李詩豪;李富花;相建海 | 申請(專利權)人: | 中國科學院海洋研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 沈陽科苑專利商標代理有限公司 21002 | 代理人: | 馬馳 |
| 地址: | 266071*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 鑒定 中國 對蝦 遺傳性 別的 dna 序列 標簽 及其 應用 | ||
1.一種鑒定中國明對蝦遺傳性別的DNA序列標簽,其特征在于:中國明對蝦雌性個體基因組DNA中的序列為特征性的seqFcF序列,序列為序列表SEQ ID NO:1中核苷酸序列;中國明對蝦雄性個體基因組DNA中序列為特征性的seqFcM序列,序列為序列表SEQ ID NO:2中核苷酸序列。
2.按照權利要求1所述的DNA序列標簽,其特征在于:所述的雌性個體DNA中的seqFcF序列為:
seqFcF:
TTCTGCCTCCAGAGGGAAAGCCATGGCTGAATTTGGCTCAAAACCACGGCAGCTGAATGTGAGTTATGTGATGAGGATTTGATTGTCCAATTACCTTTTGATTAATATCTGAATTTCAAAGGCTCATGGTGTAAATTTAGGTAATTTTTAAAATAAAGGATTCCTGAAGAAAACTTTAAATAAAGAATTCTCTGAAAAACTTTCAACT[C/T]GTGATTAAACGCAAGATCACTTATGTAGAGGAGAATAATGTTAATTGATTAGGCCCTTGGGATATCAAAACTTACGATTTATTGATTTTTTAAATGTATTGTTAGCTTTACATTAGATTAACAAGTATGTTTTAAGAAAGTTAGTGTTGATATATTTTTTATTCATATGATCCAT[T/A]ACTTTTATTACATATTTTCTCAATATACCATCAAATGATAAAGGTATGTACTGCTGAAGAAGAGGACGAAGATTTTGGTGACTTTATGGGGCCTGATGCAGGG;
在雌性個體DNA中第209bp位點均為C與T雜合,在雌性個體DNA中第385bp位點為T與A雜合。
3.按照權利要求1所述的DNA序列標簽,其特征在于:所述的雄性個體DNA中的seqFcM序列為:
seqFcM:
TTCTGCCTCCAGAGGGAAAGCCATGGCTGAATTTGGCTCAAAACCACGGCAGCTGAATGTGAGTTATGTGATGAGGATTTGATTGTCCAATTACCTTTTGATTAATATCTGAATTTCAAAGGCTCATGGTGTAAATTTAGGTAATTTTTAAAATAAAGGATTCCTGAAGAAAACTTTAAATAAAGAATTCTCTGAAAAACTTTCAACTTGTGATTAAACGCAAGATCACTTATGTAGAGGAGAATAATGTTAATTGATTAGGCCCTTGGGATATCAAAACTTACGATTTATTGATTTTTTAAATGTATTGTTAGCTTTACATTAGATTAACAAGTATGTTTTAAGAAAGTTAGTGTTGATATATTTTTTATTCATATGATCCATAACTTTTATTACATATTTTCTCAATATACCATCAAATGATAAAGGTATGTACTGCTGAAGAAGAGGACGAAGATTTTGGTGACTTTATGGGGCCTGATGCAGGG。
4.一種權利要求1-3任一所述的DNA序列標簽序列標簽的應用,其特征在于:所述序列標簽可用于中國明對蝦遺傳性別鑒定;
雌性個體的DNA序列seqFcF和雄性個體的DNA序列seqFcM的性別差異位點為第209bp和第385bp的兩個堿基位點,在雌性個體DNA中第209bp位點均為CT雜合,在雄性個體DNA中第209bp位點為T純合;在雌性個體DNA中第385bp位點為TA雜合,在雄性個體DNA中第385bp位點為A純合。
5.按照權利要求4所述的DNA序列標簽序列標簽的應用,其特征在于:進行中國明對蝦遺傳性別鑒定的過程為,對蝦個體提取DNA后,使用FcSDF:TTCTGCCTCCAGAGGGAAAGCCAT,FcSDR:CCCTGCATCAGGCCCCATAAAGTC擴增上述seqFcF或seqFcM序列,獲得的序列進行Sanger測序,測序峰圖文件使用Bioedit軟件讀取上述序列第209bp和第385bp的兩個位置的堿基序列,如果第209bp和第385bp位置分別為CT雜合和TA雜合,則鑒定的個體為雌性,如果第209bp和第385bp位置分別為T純合和A純合,則鑒定個體為雄性。
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