[發(fā)明專利]小細(xì)環(huán)病毒及其獲得方法和應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201510924817.2
• 申請日: 2015-12-11
• 公開（公告）號: CN106867972A
• 公開（公告）日: 2017-06-20
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 張羽;馮希平;李飛;單同領(lǐng)
• 申請（專利權(quán)）人: 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院
• 主分類號: C12N7/00
• 分類號: C12N7/00;C12N15/34;C12N15/10;C12Q1/70;C12Q1/68;C07K16/08;G01N33/569;A61K45/00;A61P31/20;A61P1/02;C12R1/93
• 代理公司: 上海序倫律師事務(wù)所31276
• 代理人: 周東萍

1.一種小細(xì)環(huán)病毒，其特征在于，該病毒包含：編碼SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的小細(xì)環(huán)病毒，其特征在于，所述病毒具有SEQ ID NO.2所示的全長核苷酸序列。

3.一種重組載體，其特征在于，包含權(quán)利要求1所述小細(xì)環(huán)病毒的全部或部分核苷酸序列。

4.一種抗小細(xì)環(huán)病毒的抗體，其特征在于，該抗體與SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列或其部分片段特異性結(jié)合。

5.一種檢測小細(xì)環(huán)病毒的試劑盒，其特征在于，包含特異性針對SEQ ID NO.2所示全部或部分核苷酸序列設(shè)計(jì)的引物對。

6.一種檢測小細(xì)環(huán)病毒的試劑盒，其特征在于，包含權(quán)利要求4所述的抗體。

7.一種小細(xì)環(huán)病毒的獲得方法，其特征在于，包括以下步驟：

取牙周炎患者牙齦組織樣品，提取該樣品中的病毒基因組；

將所述病毒基因組反轉(zhuǎn)錄成病毒cDNA，再用隨機(jī)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增后的產(chǎn)物通過高通量測序，構(gòu)建測序文庫；

將高通量測序結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理后，把長度大于100bp的短序列拼接為重疊群；

將拼接的序列與數(shù)據(jù)庫中的已知序列數(shù)據(jù)進(jìn)行比對，找出序列之間的相似性；

分析比對結(jié)果，依據(jù)已知序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物，通過巢式PCR擴(kuò)增，獲得未知病毒的全長基因序列，該基因序列編碼SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列；

經(jīng)系統(tǒng)進(jìn)化樹分析，對未知病毒進(jìn)行物種分類，將該未知病毒歸類為小細(xì)環(huán)病毒。

8.權(quán)利要求1所述小細(xì)環(huán)病毒的應(yīng)用，其特征在于，用于篩選預(yù)防或治療牙周病的藥物。

9.一種抗權(quán)利要求1所述小細(xì)環(huán)病毒的藥物。

10.權(quán)利要求9所述藥物的應(yīng)用，其特征在于，用于制備預(yù)防或治療牙周病的藥物。