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[發明專利]一種DNA測序的圖像識別的預處理方法及裝置有效

專利信息
申請號: 201510909564.1 申請日: 2015-12-10
公開(公告)號: CN105551034B 公開(公告)日: 2018-06-05
發明(設計)人: 劉元杰;陳哲;張睿;范東雨;高科;王者馥;王緒敏;殷金龍;任魯風 申請(專利權)人: 北京中科紫鑫科技有限責任公司
主分類號: G06T7/30 分類號: G06T7/30;G06T7/10;G06T7/136;G06T7/194;G06F19/20
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 101111 北京市大興區經濟技術*** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 像素 圖像識別 拉伸 預處理 圖譜 反應芯片 圖像采集 方差 取樣時間間隔 灰度線性 堿基類型 圖譜信息 圖像分割 誤識別 灰度 預設 全局 判定 分割
【權利要求書】:

1.一種DNA測序的圖像識別的預處理方法,其特征在于,包括:

獲取圖譜信息,在對每個圖譜的取樣時間間隔內分別獲取DNA圖譜;

對所述圖譜進行灰度線性拉伸,獲得拉伸后的DNA圖譜;

獲取所述拉伸后DNA圖譜的第一像素和第二像素,其中,第一像素A為目標像素,第一像素A的灰度值大于或等于初始分割閾值T0,像素總數為N;第二像素B為背景像素,第二像素B的灰度值小于初始分割閾值T0,像素總數為M;拉伸后的DNA圖譜矩陣f(i,j)的最大值為Vmax,最小值為Vmin

其中,T0=1/2(Vmin+Vmax) (1);

計算第一像素和第二像素的灰度均值的全局閾值T:

T = 1 / 2 ( Σ f ( i , j ) ≥ T 0 f ( i , j ) N + Σ f ( i , j ) < T 0 f ( i , j ) M ) - - - ( 2 ) ; ]]>

計算第一像素A和第二像素B的方差σ2

σ2=(PA+PB)(T-T0)2 (3);

其中,第一像素A的概率為:

P A = Σ k = 1 M + N N M + N - - - ( 4 ) ; ]]>

第二像素B的概率為:

P B = Σ k = 1 M + N M M + N - - - ( 5 ) ; ]]>

若方差σ2在預設范圍內,則以T為全局閾值對所述拉伸后的DNA圖譜進行分割。

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