[發明專利]熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的引物、探針及試劑盒在審
| 申請號: | 201510824467.2 | 申請日: | 2015-11-24 |
| 公開(公告)號: | CN105400873A | 公開(公告)日: | 2016-03-16 |
| 發明(設計)人: | 王秀娟;梁惠;段衛濤;趙平鋒 | 申請(專利權)人: | 武漢海吉力生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京匯澤知識產權代理有限公司 11228 | 代理人: | 張瑾;程殿軍 |
| 地址: | 430000 湖北省武漢市東湖技術*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 熒光 定量 pcr 檢測 top2a 基因 表達 引物 探針 試劑盒 | ||
1.熒光定量檢測TOP2A基因mRNA的引物對A和Taqman探針A,其特征在于,引物對A的核苷酸序列如SEQIDNO:1~2所示,Taqman探針A的核苷酸序列如SEQIDNO:3所示。
2.根據權利要求1所述的熒光定量檢測TOP2A基因的引物對A和Taqman探針A,其特征在于,Taqman探針A的核苷酸序列5’端標記的熒光報告基團為FAM,3’端標記的淬滅基團為MGB。
3.一種熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒,其特征在于,包括權利要求1或2所述的熒光定量檢測TOP2A基因的引物對A和Taqman探針A。
4.根據權利要求3所述的熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒,其特征在于,還包括用于檢測內參基因B2MmRNA的引物對B和Taqman探針B,引物對B的核苷酸序列如SEQIDNO:4~5所示,Taqman探針B的核苷酸序列如SEQIDNO:6所示。
5.根據權利要求4所述的熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒,其特征在于,還包括TOP2A標準品、B2M標準品和陰性對照品,TOP2A標準品為含有梯度濃度TOP2A基因組質粒DNA的溶液,B2M標準品為含有梯度濃度B2M基因組質粒DNA的溶液。
6.根據權利要求5所述的熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒,其特征在于,還包括第一鏈cDNA合成體系,具體包括反轉錄酶1~5U、反轉錄10×RTBuffe適量、dNTPs1~2mM、TOP2A基因反轉錄引物對1~10pM、內參基因B2M反轉錄引物對1~10pM,用DEPC水補足至19.5μL;使用時加入樣本RNA0.5μg。
7.根據權利要求6所述的熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒,其特征在于,試劑盒內共有五管試劑,分別為:
第一鏈cDNA合成體系;
熒光定量PCR檢測反應液:含有TaqDNA聚合酶1~2U、2.0~5.0mmolMgCl2和0.2~0.8mmoldNTPs的Premix;引物對A1~10pM;Taqman探針A1~10pM;引物對B1~10pM;Taqman探針B1~10pM;DEPC水適量;
TOP2A標準品;
B2M標準品;
陰性對照品:DEPC水。
8.權利要求4~7任一所述的熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒的使用方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)以腫瘤組織和癌旁正常組織為待檢樣品,提取待檢樣品中的RNA,反轉錄成樣品cDNA;
(2)以樣品cDNA作為模板,用引物對A、Taqman探針A、引物對B和Taqman探針B進行熒光定量PCR反應;TOP2A標準品和B2M標準品也分別進行與樣品cDNA同樣的操作,并根據TOP2A標準品和B2M標準品繪制標準曲線;
(3)結果分析:分析標準曲線的R2在0.99以上,TOP2A基因和B2M基因擴增效率應在94-100%范圍,再根據熒光定量PCR儀器給出的Ct值,進行如下計算:
△Ct(腫瘤組織)=Ct(待檢腫瘤組織樣品)-Ct(B2M基因);
△Ct(癌旁正常組織)=Ct(待檢癌旁正常組織樣品)-Ct(B2M基因);
△△Ct=△Ct(腫瘤組織)-△Ct(癌旁正常組織);
相對表達率>1判斷為乳腺癌TOP2A基因高表達。
9.根據權利要求8所述的熒光定量PCR法檢測TOP2A基因表達的試劑盒的使用方法,其特征在于,步驟(2)中熒光定量PCR反應程序為:95℃預變性2min;95℃15s,60℃30s40個循環;當熒光基團選擇FAM時在60℃30s時采集熒光信號。
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