[發明專利]一種快速檢測鯉皰疹病毒III型的方法在審
| 申請號: | 201510767327.6 | 申請日: | 2015-11-11 |
| 公開(公告)號: | CN105256071A | 公開(公告)日: | 2016-01-20 |
| 發明(設計)人: | 汪開毓;歐陽萍;陳俊杰;周立新;王定國;耿毅;陳德芳;尹立子;曹成易 | 申請(專利權)人: | 四川農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京眾合誠成知識產權代理有限公司 11246 | 代理人: | 裴娜 |
| 地址: | 611130 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 快速 檢測 皰疹病毒 iii 方法 | ||
技術領域
本發明涉及魚類病毒的快速檢測方法,具體涉及一種快速檢測鯉皰疹病毒III型的方法,尤其是采用非致死性方法采集樣品后提取DNA進行LAMP反應檢測的方法。
背景技術
錦鯉皰疹病毒病(KoiHerpesvirusDisease,KHVD)是由錦鯉皰疹病毒(KoiHerpesvirus,KHV)感染引起鯉魚、錦鯉以及普通變種鰓壞死、間質性腎炎的一種高致病性,高傳染性,高死亡率的疾病。該病發病率高、流行范圍廣,致死率高達80%-100%。自1998年以來,KHVD在世界范圍內許多鯉魚和錦鯉養殖場發生,死亡率極高,該病的爆發給鯉魚和錦鯉養殖業造成了嚴重的經濟損失。KHVD是OIE(Worldorganizationforanimalhealth)和中國農業部必須要求上報的Ⅱ類動物疫病
目前KHV的檢測診斷方法有細胞分離法、電鏡觀察法、中和實驗、ELISA、PCR、組織病理學觀察。聚合酶鏈式反應(PCR)和細胞培養技術是OIE推薦的診斷方法。《一種錦鯉皰疹病毒LAMP檢測試劑盒及檢測方法》中采用的是致死性采樣方法,采樣步驟繁瑣,不適用于活體檢測價值昂貴的觀賞性錦鯉,并且LAMP擴增反應液的添加復雜,易發生污染,在野外臨床檢測中存在各種限制,比如儀器、技術等方面。
因此需要設計一種新的快速檢測鯉皰疹病毒III型的方法,以解決現有技術的問題。
發明內容
本發明的目的在于克服現有技術中的缺陷,設計一種快速檢測鯉皰疹病毒III型的方法,在引物設計方面選取了特異性和穩定性很高的Sphi區域作為目的條帶設計引物;使用非致死性的拭子采樣,操作快速簡單;采用了快速DNA提取方法,只需煮沸組織樣,靜置冷卻取上清即可完成,具有快速、簡便的特點;引入一對環狀引物,進一步縮短了反應時間;反應體系由LAMPmix和模板DNA兩部分組成,操作簡單,減少了假陽性;具有極高的檢測準確性和效率,不會對采樣活體帶來傷害,具有極佳的應用前景。
為實現上述目的,本發明所采用的技術方案是一種快速檢測鯉皰疹病毒III型的方法,所述方法通過設計鯉皰疹病毒III型Sphi基因編碼區域的特異性擴增引物,采用非致死性方法對鯉魚采樣后提取樣品DNA進行LAMP反應,通過對擴增產物的檢測,從而確定樣品中是否存在鯉皰疹病毒III型。
優選的,特異性擴增引物包括以下引物:
(1)上游內部引物(ForwardInnerPrimer,FIP):
5’-GCTGTGGTAGGTGTTGCTGAGATTTTCACCACATCTGCAAGGAGT-3’
(2)上游外部引物(ForwardOuterPrimer,F3):
5’-GCTGTTTGCCTGCAGGAA-3’
(3)下游內部引物(BackwardInnerPrimer,BIP):
5’-GAGCATCGTGGGGTTCCAGACTTTTAGGCTCTTGTAGCGGTCC-3’
(4)下游外部引物(BackwardOuterPrimer,B3):
5’-TGAACGACTGCGACTGTTG-3’
(5)上游環引物(ForwardLOOPPrimer,LF):
5’-CAGCTTGTTCGAGC-3’
(6)下游環引物(BackwardLOOPPrimer,LB):
5’-ATGGACCTCGCATACGC-3’。
優選的,提取樣品DNA中采用的DNA提取液包含以下成分:
10mmol·L-1Tris-HCl,1mmol·L-1EDTA,15mmol·L-1氯化鈉,0.5%SDS,pH8.0。
優選的,LAMP擴增體系中,每25ul的LAMP擴增體系包含以下成分:
23ulLAMPmix,2ul模板DNA;
其中23ulLAMPmix包含:1μL上游外部引物F3(10μM),1μL下游外部引物B3(10μM),1μL上游內部引物FIP(50μM),1μL下游內部引物BIP(50μM),1uL下游環引物LB(25uM),1uL上游環引物LF(25uM),3.5μLdNTPs(25mM),3μL10×Thermopolbuffer,8UBstDNA聚合酶,3μLBetaine(8μM),3μLMgCl2(25mM)和2.5μLddH2O;
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