[發(fā)明專利]可避免假陰性的沙門氏菌恒溫?zé)晒鈾z測引物組、試劑盒及檢測方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201510739814.1 | 申請日: | 2015-11-02 |
| 公開(公告)號: | CN105219870A | 公開(公告)日: | 2016-01-06 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 曹東林;胡亮杉;林茂銳;石磊;周旋;鐘麗梅;方曉琳;陳洵;唐大運(yùn);張璜;申洪杰;雷達(dá);張知洪;田軍章 | 申請(專利權(quán))人: | 廣東省第二人民醫(yī)院;廣州迪澳生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/42 |
| 代理公司: | 廣州市深研專利事務(wù)所 44229 | 代理人: | 姜若天 |
| 地址: | 510317 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 避免 陰性 沙門氏菌 恒溫 熒光 檢測 引物 試劑盒 方法 | ||
1.用于檢測沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測引物組合物,其包含一組檢測引物和一組內(nèi)標(biāo)引物,其中,所述檢測引物組包括一對外引物、一對內(nèi)引物和一對環(huán)引物,其核苷酸序列分別如下所示:
SPI-F3:5’-TTTACGGTTCCTTTGACGG-3’;
SPI-B3:5’-GCCCCATATTATCCGTATCG-3’;
SPI-FIP:5’-AGTAGACAGGGCGGAGGACTATTGGCGGTATTTCGGTG-3’;
SPI-BIP:5’-ACCATGCTGACCATTGGTGATGCGGCACTAATCGCAATCA-3’;
SPI-LF:5’-AATCCATACCATGGCGAGTC-3’;
SPI-LB:5’-GTCTTGTCGCCCAGATCC-3’;
所述內(nèi)標(biāo)引物組包括一對外引物、一對內(nèi)引物和一對環(huán)引物,其核苷酸序列分別如下所示:
SPF-F3:5’-TGAGTGGCGGTACTATTCA-3’;
SPF-B3:5’-GTGTTATCTGCCTGACCAG-3’;
SPF-FIP:5’-GCCGTAAAGCTGGCGGTACACTAAATCCGCCGATCAA-3’;
SPF-BIP:5’-GATTGGTGATACGACCGCACATTTCGGATCGCAGTCATTC-3’;
SPF-LoopF:5’-TATTGACCCAACGTCACCG-3’;
SPF-LoopB:5’-TGCCTTTCACCATCGTCC-3’。
2.一種沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測試劑盒,其特征在于,檢測試劑盒包括權(quán)利要求1所述的檢測引物組和內(nèi)標(biāo)引物組。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測試劑盒,其特征在于,所述檢測引物組及內(nèi)標(biāo)引物組中,外引物、內(nèi)引物、環(huán)引物的摩爾比為:1-2:4-8:2-4。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測試劑盒,其特征在于,包括以下成分:(1)DNA聚合酶;(2)反應(yīng)液;(3)內(nèi)標(biāo)靶標(biāo)片段;(4)陽性對照和陰性對照。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測試劑盒,其特征在于,所述DNA聚合酶為BstDNA聚合酶。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測試劑盒,其特征在于,所述恒溫?zé)晒夥磻?yīng)液含有:10mMdNTP、10×ThermoPol反應(yīng)緩沖液、160mMMgSO4水溶液、三者的體積比是7:4:3。
7.根據(jù)權(quán)利要求4所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測試劑盒,其特征在于,陽性對照為含有沙門氏菌SPI基因片段的T載體克隆,陰性對照為超純水,內(nèi)標(biāo)靶標(biāo)片段為含有沙門氏菌SPJ基因片段的T載體克隆。
8.一種沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測方法,包括如下步驟:
(1)提取待檢樣品DNA;
(2)利用權(quán)利要求1的恒溫?zé)晒庖锝M合物對待檢樣品DNA進(jìn)行恒溫擴(kuò)增;
(3)結(jié)果判斷:將反應(yīng)管中置于恒溫?zé)晒鈾z測儀或熒光PCR儀中,實(shí)時讀取熒光信號,根據(jù)SPI基因檢測結(jié)果和內(nèi)標(biāo)基因SPF檢測結(jié)果進(jìn)行判斷:
SPI基因檢測結(jié)果為陽性內(nèi)標(biāo)基因SPF檢測結(jié)果全為陽性時,檢測結(jié)果為陽性;
SPI基因檢測結(jié)果為陰性內(nèi)標(biāo)基因SPF檢測結(jié)果全為陽性時,檢測結(jié)果為陰性;
SPI基因檢測結(jié)果為陽性內(nèi)標(biāo)基因SPF檢測結(jié)果全為陰性時,檢測結(jié)果為陽性;
SPI基因檢測結(jié)果為陰性內(nèi)標(biāo)基因SPF檢測結(jié)果全為陰性時,檢測結(jié)果可能為假陰性,建議重新提取DNA進(jìn)行檢測。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測方法,其特征在于,恒溫擴(kuò)增的25μl反應(yīng)體系含有:SPI-F30.2μM,SPI-B30.2μM,SPI-FIP1.6μM,SPI-BIP1.6μM,SPI-LF0.8μM,SPI-LB0.8μM,SPF-F30.2μM,SPF-B30.2μM,SPF-FIP1.6μM,SPF-BIP1.6μM,SPF-LoopF0.8μM,SPF-LoopB0.8μM,反應(yīng)液12.5μl,DNA聚合酶8U,10×SYBRGreenI0.5μl,待檢樣品2μl,內(nèi)標(biāo)2μl,用超純水補(bǔ)齊到25μl。
10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的沙門氏菌的恒溫?zé)晒鈾z測方法,其特征在于,恒溫擴(kuò)增的程序?yàn)椋?3~65℃反應(yīng)30~45min,并在80℃持續(xù)2min。
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