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[發明專利]基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物及制備方法與應用有效

專利信息
申請號: 201510611772.3 申請日: 2015-09-23
公開(公告)號: CN105154070B 公開(公告)日: 2017-04-19
發明(設計)人: 邢達;張濤;吳云霞 申請(專利權)人: 華南師范大學
主分類號: C09K11/06 分類號: C09K11/06;C07D405/14;C07D405/04;C12Q1/68
代理公司: 廣州市華學知識產權代理有限公司44245 代理人: 裘暉
地址: 510631 廣東省*** 國省代碼: 廣東;44
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摘要:
搜索關鍵詞: 基于 點擊 反應 具有 熒光 響應 dna 標記 制備 方法 應用
【說明書】:

技術領域

發明屬于核酸標記領域,特別涉及一種基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物及制備方法與應用。

背景技術

核酸是一類由核苷酸單體聚合而成的生物大分子,是生物細胞最基本和最重要的成分。目前,核酸修飾技術是醫學和生物學領域中的常用研究工具,且已經被廣泛地用,核酸分子的修飾在分子識別的基礎研究、生物醫學診斷和DNA納米結構構建起重要作用。

早期傳統的DNA修飾方法是直接在DNA上修飾熒光分子,此方法對技術和設備要求較高操作復雜,純化手段復雜,不利于大規模推廣。近些年生物正交反應備受關注,尤其是應用于核酸和蛋白質的修飾。生物正交反應具有操作簡單,反應物易于合成、特異性高等優點,其在分子識別和醫學診斷領域應用廣泛。

近期基于點擊化學的生物正交反應備受關注,尤其是利用點擊反應對蛋白和核酸的修飾。點擊化學是一種疊氮化合物和炔烴的環化加成反應,它是2001年,由諾貝爾化學獎獲得者Sharpless報道出來的。它有反應速度快、反應條件較溫和、產率高、副產物少和立體選擇性高等特點,因此該方法自提出以來在化學、生物醫藥、分子識別、高分子合成等領域都有廣泛應用。

目前常用的基于點擊化學反應的DNA標記方法有:銅離子催化的疊氮化合物和炔烴的環化加成反應(CuAAC),此方法微量的銅離子就能催化該反應的發生,反應速度快,但是有報道過渡態金屬催化劑銅(I)可以誘導病毒或寡核苷酸的降解,并且銅(I)作為催化劑具有細胞毒素,因此不適合在生物體內的應用。此外還有非銅催化的疊氮化合物和炔烴的環化加成反應,此反應速度慢,反應時間長,降低了該方法的推廣及普及性。

近幾年基于光點擊的生物正交反應被廣泛報道,如基于光點擊反應實現對蛋白質的修飾,是一種光控的且有熒光響應的蛋白質修飾方法。該方法是具有實時光控的生物正交反應,具有光誘導實時可控,非金屬催化,無毒,反應速度快,產率高、操作方便簡單,應用性廣等優點。

有文獻報道了一種基于光點擊反應的DNA修飾方法,該方法首次將光點擊反應應用于核酸修飾中,利用LED燈就可以實現核酸的標記,操作方便簡單,反應速度快等優點。但是該方法只實現了DNA的修飾,反應后沒有熒光響應,不具備多方面的應用。因此開發一種基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物在實際應用中仍具有重要意義。

發明內容

為了克服現有技術的缺點與不足,本發明的首要目的在于提供一種基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物,該標記物具有實時光控的,具有光誘導實時可控、具有熒光響應、應用性廣等優點。

本發明的另一目的在于提供上DNA標記物的制備方法。

本發明的再一目的在于提供上述DNA標記物的應用。

本發明的目的通過下述技術方案實現:

一種基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物,為化合物W-3和W-4中的至少一種;所述的W-3和W-4結構式如式Ⅰ和Ⅱ所示:

所述的基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物的制備方法,包括如下步驟:

(1)將四唑化合物W-1(Methyl4-(2-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)-2H-tetrazol-5-yl)benzoate)與氫氧化鋰在四氫呋喃甲醇和水的混合液中加熱攪拌反應,反應終止后調節溶液的pH值至出現紫色沉淀;得到中間體W-2;

(2)將步驟(1)制得的W-2與NHS(N-羥基丁二酰亞胺)、EDC(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺鹽酸鹽)在DMF(N,N-二甲基甲酰胺)中攪拌反應以活化W-2;反應終止后,加入飽和食鹽水至沉淀析出,得到化合物W-3,即為具有熒光響應的DNA標記物基于光點擊反應且具有熒光響應的DNA標記物;

(3)將乙胺加入二氯甲烷中,然后再加入步驟(2)制得的W-3攪拌反應,減壓蒸餾,得到W-4;

步驟(1)中所述的W-1與氫氧化鋰的摩爾比優選為1:(15~20);

步驟(1)中所述的W-1與氫氧化鋰的摩爾比進一步優選為1:20;

步驟(1)中所述的甲醇、四氫呋喃和水的混合液中,甲醇、四氫呋喃和水的體積比優選為1:(2~3):1;

步驟(1)中所述的甲醇、四氫呋喃和水的混合液中,甲醇、四氫呋喃和水的體積比進一步優選為1:2:1;

步驟(1)中所述的加熱攪拌反應的溫度優選為45℃~55℃;

步驟(1)中所述的加熱攪拌反應的溫度進一步優選為50℃;

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