[發明專利]基于miR1511的大豆分子標記iSIndel及其應用

在審

• 申請號: 201510471008.0
• 申請日: 2015-08-04
• 公開（公告）號: CN105002288A
• 公開（公告）日: 2015-10-28
• 發明（設計）人: 邱麗娟;羅中欽;南美樸先崔;金龍國
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院作物科學研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;任鳳華

1.大豆分子標記或其多態性在鑒定或輔助鑒定野生大豆原生境中的應用；

所述大豆分子標記，為以大豆的基因組DNA為模板，采用由與SEQ?ID?No.1的第190位上游特異結合的單鏈DNA和與SEQ?ID?No.1的第386位下游特異結合的單鏈DNA組成的引物對進行擴增得到的DNA分子。

2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述大豆分子標記的多態性為所述大豆分子標記對應于SEQ?ID?No.1的第190-386位為下述A1)、A2)或A3)：

A1)SEQ?ID?No.1的第190-386位；

A2)SEQ?ID?No.2的第190-314位；

A3)SEQ?ID?No.3的第190-239位。

3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于：所述大豆分子標記的多態性為所述大豆分子標記對應于SEQ?ID?No.1為SEQ?ID?No.1、SEQ?ID?No.2或SEQ?ID?No.3。

4.根據權利要求1-3中任一所述的應用，其特征在于：所述應用包括如下B1)或B2)：

B1)以待測野生大豆的基因組DNA為模板，采用所述引物對進行擴增，得到擴增產物，根據所述擴增產物的序列按照下述方法鑒別所述待測野生大豆的原生境：所述擴增產物的序列含有權利要求2所述A1)，所述待測野生大豆的原生境為或候選為東經97.29°-132.3°、北緯23.57°-51.43°；所述擴增產物的序列含有權利要求2所述A2)，所述待測野生大豆的原生境為或候選為東經109.26°-111.50°、北緯29.28°-31.52°；所述擴增產物的序列含有權利要求2所述A3)，所述待測野生大豆的原生境為或候選為東經104.41°-122.24v、北緯30.12°-40.50°或東經119.47°-122.43°、北緯38.54°-42.03°；

B2)檢測野生大豆的總RNA中是否含有SEQ?ID?No.4，如所述待測野生大豆的總RNA含有SEQ?ID?No.4所示的RNA，所述待測野生大豆的原生境為或候選為東經97.29°-132.3°、北緯23.57°-51.43°；如所述待測野生大豆的總RNA不含SEQ?ID?No.4所示的RNA，所述待測野生大豆的原生境為或候選為東經109.26°-111.50°、北緯29.28°-31.52v或東經104.41°-122.24°、北緯30.12°-40.50°或東經119.47°-122.43°，北緯38.54°-42.03°。

5.根據權利要求1-4中任一所述的應用，其特征在于：所述引物對為由SEQ?ID?No.1的第1-25位所示的單鏈DNA和與SEQ?ID?No.1的第532-555位反向互補的單鏈DNA組成的引物對；

和/或，

所述擴增為PCR擴增。

6.權利要求1-5中任一所述大豆分子標記。

7.檢測權利要求1-5中任一所述大豆分子標記的多態性的系統，含有權利要求1-5中任一所述引物對。

8.根據權利要求7所述系統，其特征在于：所述系統為權利要求1-5中任一所述引物對。

9.權利要求1-5中任一所述大豆分子標記或其多態性在鑒定或輔助鑒定大豆是栽培大豆或是野生大豆中的應用。

10.下述任一應用：

X1、權利要求7或8所述系統在鑒定或輔助鑒定野生大豆原生境中的應用；

X2、權利要求7或8所述系統在制備鑒定或輔助鑒定野生大豆原生境的產品中的應用；

X3、權利要求7或8所述系統在鑒定或輔助鑒定大豆是栽培大豆或是野生大豆中的應用；

X4、權利要求7或8所述系統在制備鑒定或輔助鑒定是栽培大豆或是野生大豆的產品中的應用。