[發明專利]一種快速鑒定恙蟲病立克次體的LAMP引物組、試劑盒及方法在審
| 申請號: | 201510358423.5 | 申請日: | 2015-06-24 |
| 公開(公告)號: | CN104988143A | 公開(公告)日: | 2015-10-21 |
| 發明(設計)人: | 黃曦;劉澤霞 | 申請(專利權)人: | 中山大學 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 | 代理人: | 胡輝;鄭瑩 |
| 地址: | 510080 廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 快速 鑒定 恙蟲病 立克次體 lamp 引物 試劑盒 方法 | ||
1.用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP特異性引物組,其特征在于,包括:
內引物1:5’-?TTGCTACACCAAGTGCTCCTGATATGCTGGTCTTGGTGC-3’(SEQ?ID?No.1);
內引物2:5’-?TTAATGCTGCTGAGGGTGTGTCGCATTTACCGAGTACTTATCT-3’(SEQ?ID?No.2);
外引物1:5’-?TTGATCTGAGTATGATTGTCGG?-3’(SEQ?ID?No.3);
外引物2:5’-GAAGTTATAGCGTACACCTACA-3’(SEQ?ID?No.4);
環引物1:5’-?GCAACCATACCTGTATGCC-3’?(SEQ?ID?No.5);
環引物2:5’-?ATGTGGACATAGAAGGTGGTT-3’?(SEQ?ID?No.6)。
2.一種用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,包括權利要求1所述的引物組。
3.根據權利要求3所述的用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述引物組中,內引物、外引物、環引物的摩爾比為8:1:4。
4.根據權利要求2或3所述的用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,還包括以下成分:逆轉錄酶、DNA聚合酶、RT-LAMP反應液、顯色劑、陽性對照和陰性對照。
5.根據權利要求4所述的用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述逆轉錄酶為AMV逆轉錄酶;所述DNA聚合酶為Bst?DNA聚合酶。
6.根據權利要求4所述的用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述RT-LAMP反應液含有:10mM?dNTP、10×ThermoPol反應緩沖液、150mM?MgSO4、5mM?甜菜堿,四者的體積比為6~8:4~5:2~3:8~10。
7.根據權利要求4所述的用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述顯示劑為SYBR?GREENⅠ。
8.根據權利要求4所述的用于快速鑒定恙蟲病立克次體的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述陽性對照為含有恙蟲病立克次體(SEQ?ID?NO.7)的質粒,陰性對照為DEPC水。
9.一種快速鑒定恙蟲病立克次體的方法,其特征在于,采用權利要求2~8所述的試劑盒,加入模板RNA,在60~65℃,等溫擴增60~90分鐘,具體包括如下步驟:
(1)提取模板RNA;
(2)利用權利要求1所述的引物組對模板RNA進行環介導等溫基因擴增反應;(3)結果判斷:在上述反應管中加入2μL顯色劑10×SYBR?GREENⅠ,混勻后觀察反應液的顏色,若呈現綠色則為恙蟲病立克次體,橙色則為非登恙蟲病立克次體。
10.根據權利要求9所述的方法,其特征在于,環介導等溫基因擴增反應的25μL反應體系含有:內引物1、2各8pmol/μL,外引物1、2各1?pmol/μL,環引物1、2各4?pmol/μL,反應液?12.5μL,DNA聚合酶8U,待檢RNA?1~100ng,逆轉錄酶1U,用滅菌去離子水補齊到25μL;環介導等溫基因擴增反應的條件為:60~65℃反應30~40min。
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