[發明專利]一種用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒在審
| 申請號: | 201510282511.1 | 申請日: | 2015-05-28 |
| 公開(公告)號: | CN104946792A | 公開(公告)日: | 2015-09-30 |
| 發明(設計)人: | 黃曦;胡勝鋒 | 申請(專利權)人: | 中山大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 | 代理人: | 胡輝;鄭瑩 |
| 地址: | 510080 廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 快速 鑒定 登革熱 病毒 rt lamp 試劑盒 | ||
1.一種用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,包括以下組分:(1)用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP特異性引物組;(2)逆轉錄酶;(3)DNA聚合酶;(4)RT-LAMP反應液;(5)顯色劑;(6)陽性對照和陰性對照;其中,所述用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP特異性引物組包括:
內引物1:5’-?CGTTATTGGCGGAGCTACAGGGAGGCTATTGAAGTCAGGC-3’(SEQ?ID?No.1);
內引物2:5’
-GTGGACTAGCGGTTAGAGGAGAGAGACTACAGCTTCATCTCAC-3’?(SEQ?ID?No.2);
外引物1:5’-?GCTCCTTTCGAGAGTGAAG?-3’(SEQ?ID?No.3);
外引物2:5’-GGTCTCCTCTAACCTCTAGTC-3’(SEQ?ID?No.4);
環引物1:5’-CAGCACGGTTTGCTCAAG-3’(SEQ?ID?No.5);
環引物2:5’-?CCTTACAAATCGCAGCAACAA-3’(SEQ?ID?No.6)。
2.根據權利要求1所述的用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述引物組中,內引物、外引物、環引物的摩爾比為6~8:1:3~4。
3.根據權利要求1所述的用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述逆轉錄酶為AMV逆轉錄酶;所述DNA聚合酶為Bst?DNA聚合酶。
4.根據權利要求1所述的用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述RT-LAMP反應液含有:10mM?dNTP、10×ThermoPol反應緩沖液、150mM?MgSO4溶液、5mM?甜菜堿,四者的體積比為6~8:4~5:2~3:8~10。
5.根據權利要求1所述的用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述顯示劑為SYBR?GREENⅠ。
6.根據權利要求1所述的用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,其特征在于,所述陽性對照為含有4型登革熱病毒NS1基因片段(SEQ?ID?NO.7)的質粒,陰性對照為DEPC水。
7.一種快速鑒定登革熱病毒4型的方法,其特征在于,采用權利要求1~6任一項所述的試劑盒,加入模板RNA,在60~65℃,等溫擴增60~90分鐘,具體包括如下步驟:
(1)提取模板RNA;
(2)環介導等溫基因擴增反應:25μl反應體系含有:內引物1、2各7~9pmol/μl,外引物1、2各1~2?pmol/μl,環引物1、2各3~5?pmol/μl,反應液?12~13μl,DNA聚合酶7~9U,待檢RNA?1~100ng,逆轉錄酶1~2U,用滅菌去離子水補齊到25μl,然后加入18~22μl的密封液,將上述反應管于60~65℃反應60~90min;
(3)結果判斷:在上述反應管中加入1-2μl顯色劑10×SYBR?GREENⅠ,混勻后觀察反應液的顏色,若呈現綠色則為登革熱4型病毒,橙色則為非登革熱4型病毒。
8.根據權利要求7所述的方法,其特征在于,環介導等溫基因擴增反應的25μl反應體系含有:內引物1、2各8pmol/μl,外引物1、2各1?pmol/μl,環引物1、2各4?pmol/μl,反應液?12.5μl,DNA聚合酶8U,待檢RNA?1~100ng,逆轉錄酶1U,用滅菌去離子水補齊到25μl。
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