[發明專利]一種用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒在審
| 申請號: | 201510282511.1 | 申請日: | 2015-05-28 |
| 公開(公告)號: | CN104946792A | 公開(公告)日: | 2015-09-30 |
| 發明(設計)人: | 黃曦;胡勝鋒 | 申請(專利權)人: | 中山大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 | 代理人: | 胡輝;鄭瑩 |
| 地址: | 510080 廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 快速 鑒定 登革熱 病毒 rt lamp 試劑盒 | ||
技術領域
本發明涉及病原微生物的檢測與鑒定,具體涉及一種用環介導等溫基因擴增技術(LAMP技術)快速鑒定4型登革熱病毒的方法。
背景技術
登革熱病毒(Dengue?virus,DENV)是一種黃病毒類RNA病毒,主要包括1~4型病毒(DENV?1~4)。登革熱病毒主要通過埃及伊蚊(Aedes?aegypti)和白紋伊蚊(Aedes?albopictus)傳播,登革熱病毒的感染可以引起登革熱(dengue?fever,DF),嚴重的還可導致登革出血熱(Dengue?hemorrhagic?fever,DHF)或登革休克綜合征(Dengue?shocksyndrome,DSS)等。DENV廣泛流行于全球的熱帶和亞熱帶地區,我國主要分布于廣東、海南、廣西、福建、臺灣等?。ㄗ灾螀^)。ENV-4型1979年從海南島儋縣北部白馬鎮開始沿西海岸向南北蔓延,波及堪江、佛山、廣州、汕頭、韶關等地區以及廣西的北海、合浦,連續流行3年。
目前登革熱病毒的鑒定方法主要為PCR,ELISA、免疫膠體金等方法。登革熱檢測常用的ELISA、免疫膠體金方法耗時長,通常需要5~7?d血清中才能達到抗體能夠檢測水平,同時登革熱抗體與其他黃病毒存在交叉反應,出現假陽性率較高,故血清學檢測作為登革熱病毒檢測局限性較大;DENV的分離可以很好的鑒定登革熱病毒,但同樣耗時長,敏感度又很低,也不可以作為早期檢測登革熱病毒的手段。近10?多年發展起來的DENV核酸檢測技術,為登革熱的早期診斷提供了可能,但PCR以及RT-PCR都需要昂貴的PCR儀作為基礎,也在一定程度上限制了PCR方法在鑒定登革熱病毒上的發展。
以上各種方法雖然可能在臨床上提供較好的價值,但因耗時長、繁瑣的操作過程、靈敏度低、需要昂貴的儀器設備等不同的原因未能在臨床上大規模推廣使用。環介導等溫基因擴增技術(Loop-Mediated?Isothermal?Amplification,以下簡稱LAMP法)是日本榮研化學株式會社于2000年前后開發出的基因擴增技術,其具有快速簡便、操作準確、容易普及、安全可靠的優點,目前尚未有將LAMP法應用于快速鑒定4型登革熱病毒。
發明內容
本發明的目的在于提供一種用于快速鑒定3型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒、以及一種用環介導等溫基因擴增技術(LAMP技術)快速鑒定4型登革熱病毒的方法。本鑒定方法方便快捷、價格低廉,適于推廣應用。
本發明所采取的技術方案是:
一種用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP試劑盒,包括以下組分:(1)用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP特異性引物組;(2)逆轉錄酶;(3)DNA聚合酶;(4)RT-LAMP反應液;(5)顯色劑;(6)陽性對照和陰性對照;其中,所述用于快速鑒定4型登革熱病毒的RT-LAMP特異性引物組包括:
內引物1:5’-?CGTTATTGGCGGAGCTACAGGGAGGCTATTGAAGTCAGGC-3’(SEQ?ID?No.1);
內引物2:5’
-GTGGACTAGCGGTTAGAGGAGAGAGACTACAGCTTCATCTCAC-3’?(SEQ?ID?No.2);
外引物1:5’-?GCTCCTTTCGAGAGTGAAG?-3’(SEQ?ID?No.3);
外引物2:5’-GGTCTCCTCTAACCTCTAGTC-3’(SEQ?ID?No.4);
環引物1:5’-CAGCACGGTTTGCTCAAG-3’(SEQ?ID?No.5);
環引物2:5’-?CCTTACAAATCGCAGCAACAA-3’(SEQ?ID?No.6)。
所述引物組中,內引物、外引物、環引物的摩爾比為6~8:1:3~4。
所述逆轉錄酶為AMV逆轉錄酶;所述DNA聚合酶為Bst?DNA聚合酶。
所述RT-LAMP反應液含有:10mM?dNTP、10×ThermoPol反應緩沖液、150mM?MgSO4溶液、5mM?甜菜堿,四者的體積比為6~8:4~5:2~3:8~10。
所述顯示劑為SYBR?GREENⅠ。
所述陽性對照為含有4型登革熱病毒NS1基因片段(SEQ?ID?NO.7)的質粒,陰性對照為DEPC水。
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