[發(fā)明專利]一種MUC13和FUT1基因的分子標記輔助選擇方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201510272566.4
• 申請日: 2015-05-25
• 公開（公告）號: CN104982387B
• 公開（公告）日: 2018-01-23
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 吳珍芳;楊明;王青來;蔡更元;曾海玉;楊懷古
• 申請（專利權(quán)）人: 廣東溫氏食品集團股份有限公司;廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;A01K67/027
• 代理公司: 廣州番禺容大專利代理事務(wù)所(普通合伙)44326
• 代理人: 劉新年

1.一種MUC13和FUT1基因的分子標記輔助選擇方法，其特征在于，包括以下步驟：

1)分析MUC13基因和FUT1基因在現(xiàn)有群體中的基因頻率；

2)分析現(xiàn)有群體的兩個基因組合基因型個體數(shù)量及頻率分布情況：對現(xiàn)有群體的兩個基因組合基因型個體數(shù)量及頻率分布情況進行分析，若優(yōu)勢等位基因組合基因型在現(xiàn)有核心群中頻率大于0.7時，則同時在公豬及母豬的選留中選擇優(yōu)勢組合基因型個體；若優(yōu)勢等位基因組合基因型在現(xiàn)有核心群中頻率為0.3-0.7時，則僅要求在公豬選留時選擇優(yōu)勢組合基因型個體；若優(yōu)勢等位基因組合基因型在現(xiàn)有核心群中頻率小于0.3時，則僅要求選留時測定表型同等表現(xiàn)下，優(yōu)先選留優(yōu)勢組合基因型個體；

3)分析現(xiàn)有群體中兩個基因的組合基因型與傳統(tǒng)育種主選性狀的相關(guān)性；

4)制定適應(yīng)的分子標記輔助方法。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的MUC13和FUT1基因的分子標記輔助選擇方法，其特征在于，步驟1)為：利用plink軟件進行MUC13基因和FUT1基因在現(xiàn)有群體中的基因頻率分析，若最小等位基因頻率MAF<0.05，說明此位點基本純合，不需進行分子標記輔助選擇；若MAF>0.05，說明群體存在變異，則進行分子標記輔助選擇。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的MUC13和FUT1基因的分子標記輔助選擇方法，其特征在于，步驟3)為：分析現(xiàn)有群體中兩個基因的組合基因型與傳統(tǒng)育種主選性狀的相關(guān)性，所述傳統(tǒng)育種主選形狀為日增重、料肉比、背膘厚、瘦肉率、父系指數(shù)、母系指數(shù)、和體型外貌；若兩個基因的組合基因型與日增重、瘦肉率、父系指數(shù)、母系指數(shù)、體型外貌正相關(guān)或無相關(guān)性，與料肉比、背膘厚負相關(guān)或者無相關(guān)性，則說明兩個基因分子育種選擇與現(xiàn)場選育目標一致，在選留時將優(yōu)勢等位基因型作為選擇的必要條件；

若是與上述情況不同，與有些選育性狀相矛盾，則采取先以現(xiàn)場測定性狀的選育為第一參考，抗腹瀉基因型為第二參考，選留時同等性能表現(xiàn)的種豬，優(yōu)先選留優(yōu)勢組合基因型個體，不做必要條件進行選留，長期堅持選擇，逐步完成抗腹瀉基因的優(yōu)化。

4.根據(jù)權(quán)利要求1～3任一項所述的MUC13和FUT1基因的分子標記輔助選擇方法，其特征在于，步驟1)-3)中所述現(xiàn)有群體的規(guī)模大于500頭。