[發明專利]一種構建茶樹DNA指紋圖譜的方法有效
| 申請號: | 201510089500.1 | 申請日: | 2015-02-27 |
| 公開(公告)號: | CN104651515A | 公開(公告)日: | 2015-05-27 |
| 發明(設計)人: | 孫威江;林志坤;陳志丹 | 申請(專利權)人: | 福建農林大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 福州元創專利商標代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡學俊 |
| 地址: | 350002 福*** | 國省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 構建 茶樹 dna 指紋 圖譜 方法 | ||
1.一種構建茶樹DNA指紋圖譜的方法,其特征在于:采用ISSR分子標記技術和二維碼技術構建茶樹DNA指紋圖譜,將指紋圖譜信息通過二維碼技術處理,轉化成二維碼圖形。
2.根據權利要求1所述的構建茶樹DNA指紋圖譜的方法,其特征在于:所述方法具體實施如下:
采用改良CTAB法提取供試茶樹品種的總DNA,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測其濃度和純度,并將DNA樣本稀釋至100?ng/uL,利用優化后的ISSR反應體系和篩選的引物對茶樹DNA樣本進行PCR擴增,將擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳,分離ISSR分子標記,拍攝電泳圖片;根據ISSR圖譜條帶的有無,對PCR擴增產物進行統計分析,將電泳圖譜轉換成“0-1”形式的原始字符串,利用二維碼技術處理原始字符串,將原始字符串轉化成為二維碼圖形。
3.根據權利要求2所述的構建茶樹DNA指紋圖譜的方法,其特征在于:所述對PCR擴增產物進行統計分析,是根據ISSR圖譜條帶的有無,利用人工方法統計讀帶,將電泳圖上穩定出現的條帶,無論強弱均賦值為“1”,同一位置無條帶賦值為“0”,?輸入讀帶數據,建立原始字符串。
4.根據權利要求2所述的構建茶樹DNA指紋圖譜的方法,其特征在于:優化后的ISSR反應體系為:在20μL體系中,Ex-Buffer用1×Ex-Buffer,1U/μL?Ex-Taq酶,0.2mM/μL?dNTPs,0.5mM/μL?ISSR引物,2ng/μL?DNA模板。
5.根據權利要求2所述的構建茶樹DNA指紋圖譜的方法,其特征在于:篩選的引物如SEQ?ID?NO.1-12所示。
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