[發明專利]折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒及其檢測方法有效
| 申請號: | 201510078743.5 | 申請日: | 2015-02-13 |
| 公開(公告)號: | CN104911254B | 公開(公告)日: | 2017-11-14 |
| 發明(設計)人: | 黃天誼;黃雨婷;張念恒;佘丹婭 | 申請(專利權)人: | 貴州省疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/90 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產權代理有限公司11002 | 代理人: | 谷慶紅 |
| 地址: | 556000 貴州*** | 國省代碼: | 貴州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 折疊 引物 多重 pcr 瘧疾 分子 診斷 試劑盒 及其 檢測 方法 | ||
1.一種折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒,所述診斷試劑盒由模板緩沖液和PCR單一組合試劑組成;其中所述的模板緩沖液為1×含鎂模板緩沖液1.0ml×2支,或1×含鎂模板緩沖液1.0ml×1支和0.1×模板緩沖液預裝0.5ml管×20支,所述預裝管每管400μl;其中所述的單一組合試劑為折疊引物PCR無鎂單一組合試劑200μl×1支或預裝PCR管折疊引物PCR無鎂單一組合試劑每管10μl×20支;其特征在于:
所述的1×含鎂模板緩沖液包含以下組分:30mmol Tris-HCl;30mmol KCl;15mmol(NH4)2SO4;6.6mmol MgCl2;
所述的無鎂單一組合試劑包含以下組分:具有不同退火與折疊溫度的折疊引物6條;Tris-HCl 30mmol/L;KCl 30mmol/L;NH4SO4 15mmol/L;TMAC 0.001mmol/L;4種核苷酸-4dNTP各200μmol/L;DNA聚合酶-Taq酶0.5U;石蠟油15μl;
所述的具有不同退火與折疊溫度的折疊引物,包括瘧原蟲屬特異公共引物一對,編號Uf-1865、Ur-2855;惡性瘧原蟲(PF)種特異正向引物1條,編號Ff-2545;間日瘧原蟲(PV)、三日瘧原蟲(PM)、卵形瘧原蟲(PO)種特異反向引物各1條,編號Vr-2343、Mr-2520、Or-2748;
所述引物的設計是在每條引物的5’端添加與3’端互補的核苷酸序列,所述3’端即第2~4堿基起至第8~18堿基,具體序列如下:
Uf-1865 5'GTCAAATGGCGTGGAAACACACTTCCCTTCTCGCCATTTGATAG 3'
Ur-2855 5'CTAAGAAGGTTCGATAACCTGTTATCCCCGGCGAACCTTCTTAC 3'
Ff-2545 5'GCTTCTGGATATTATGATAGATAACATACCAGAAG 3'
Vr-2343 5'CGGTGATGCTACTTACTTGGAGAATGTTTTGCATCACCT 3'
Mr-2520 5'GGTATAAAGGATTTTAGTTTATCTCCATGTCCTTTATACG 3'
Or-2748 5'CGGAAGGATGTAAAAGCACATTTAATATCTTATCCTTCCA 3'
所述的折疊引物中,每條屬、種特異引物最佳初始退火溫度間至少相差2~3℃;各條引物3’5’端互補退火的折疊溫度比引物與模板靶序列的初始退火溫度低1~2℃,各擴增片段之間的大小相差150bp以上。
2.如權利要求1所述的折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒,其特征在于,所述的折疊引物中,屬和種特異引物Uf-1865、Or-2748、Mr-2520、Vr-2343的濃度均為87nmol/μL;Ur-2855和Ff-2545的濃度均為70nmol/μL。
3.權利要求1或2所述的折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒在制備同時檢測和鑒定臨床、流行病學樣本中存在的4種瘧原蟲單獨或混合感染產品中的用途,所述4種瘧原蟲為惡性瘧原蟲、間日瘧原蟲、三日瘧原蟲和卵形瘧原蟲,其中卵形瘧原蟲包括經典型和變異型。
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