[發(fā)明專利]抗稻瘟病基因Pi9的特異性CAPS標(biāo)記Pi9caps及其應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201510062377.4 | 申請日： | 2015-02-05 |
| 公開（公告）號： | CN104630364A | 公開（公告）日： | 2015-05-20 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 朱立煌;呂啟明;黃志遠(yuǎn);盤毅;唐麗;李曉兵;周壯志;辛業(yè)蕓;趙炳然;符習(xí)勤 | 申請（專利權(quán)）人： | 中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所;湖南雜交水稻研究中心 |
| 主分類號： | C12Q1/68 | 分類號： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京紀(jì)凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245 | 代理人： | 關(guān)暢;陳曉慶 |
| 地址： | 100101 北*** | 國省代碼： | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 稻瘟病 基因 pi9 特異性 caps 標(biāo)記 pi9caps 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種鑒定或輔助鑒定水稻是否含有抗稻瘟病基因Pi9和/或是否具有稻瘟病抗性的方法，包括如下步驟：檢測待測水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸，根據(jù)水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸的種類進(jìn)行鑒定：如果待測水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸含T，則待測水稻為含有抗稻瘟病基因Pi9的水稻或候選為含有抗稻瘟病基因Pi9的水稻和/或具有稻瘟病抗性的水稻，如果待測水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸不含T，則待測水稻為不含有抗稻瘟病基因Pi9的水稻或候選為不含有抗稻瘟病基因Pi9的水稻。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述方法，其特征在于：所述檢測待測水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸的方法如下：以待測水稻的基因組DNA為模板，以稻瘟病抗性基因Pi9的分子標(biāo)記引物為引物，進(jìn)行PCR擴(kuò)增，得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物，該P(yáng)CR擴(kuò)增產(chǎn)物為所述稻瘟病抗性基因Pi9的分子標(biāo)記；用限制性核酸內(nèi)切酶XbaI酶切所述PCR擴(kuò)增產(chǎn)物，如果所述PCR擴(kuò)增產(chǎn)物能被酶切產(chǎn)生兩個DNA片段，則待測水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸含T，如果所述PCR擴(kuò)增產(chǎn)物不能被酶切，則待測水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40804位核苷酸不含T；
所述引物為能擴(kuò)增所述稻瘟病抗性基因Pi9的分子標(biāo)記的引物，所述稻瘟病抗性基因Pi9的分子標(biāo)記的核苷酸序列為如下A所示的序列：
A、位于水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第39933位至第41277位核苷酸所示的序列內(nèi)并含有第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40802位至第40807位核苷酸的序列。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于：所述A所示的序列為位于水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40205位至第41006位核苷酸所示的序列；
所述引物為SEQ?ID?No.1和SEQ?ID?No.2所示的DNA分子，所述兩個DNA片段分別為長度為599bp的DNA片段和203bp的DNA片段。
4.擴(kuò)增如下A所示的序列的引物：
A、位于水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第39933位至第41277位核苷酸所示的序列內(nèi)并含有第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40802位至第40807位核苷酸的序列。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的引物，其特征在于：所述A所示的序列為位于水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40205位至第41006位核苷酸所示的序列；
所述引物為SEQ?ID?No.1和SEQ?ID?No.2所示的DNA分子。
6.DNA片段，選自水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第39933位至第41277位核苷酸所示的序列內(nèi)并含有第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40802位至第40807位核苷酸的序列。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的DNA片段，其特征在于：所述DNA片段的核苷酸序列為水稻第6號染色體中75-1-127BAC12.1序列或其同源序列自5’末端起第40205位至第41006位核苷酸所示的序列。
8.一種鑒定或輔助鑒定水稻是否含有抗稻瘟病基因Pi9和/或是否具有稻瘟病抗性的試劑盒，該試劑盒包含權(quán)利要求4或5所述的引物。
9.權(quán)利要求4或5所述的引物、權(quán)利要求6或7所述的DNA片段或權(quán)利要求8所述的試劑盒在鑒定或輔助鑒定水稻是否含有抗稻瘟病基因Pi9和/或是否具有稻瘟病抗性中的應(yīng)用。
10.權(quán)利要求1-3任一所述的方法、權(quán)利要求4或5所述的引物、權(quán)利要求6或7所述的DNA片段或權(quán)利要求8所述的試劑盒在水稻育種中的應(yīng)用。
該專利技術(shù)資料僅供研究查看技術(shù)是否侵權(quán)等信息，商用須獲得專利權(quán)人授權(quán)。該專利全部權(quán)利屬于中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所;湖南雜交水稻研究中心;，未經(jīng)中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所;湖南雜交水稻研究中心;許可，擅自商用是侵權(quán)行為。如果您想購買此專利、獲得商業(yè)授權(quán)和技術(shù)合作，請聯(lián)系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/201510062377.4/1.html，轉(zhuǎn)載請聲明來源鉆瓜專利網(wǎng)。
- 一種水稻抗稻瘟病基因Pi9的功能分子標(biāo)記及其應(yīng)用
- 稻瘟病抗性基因Pi9基因特異性分子標(biāo)記Pi9SNP及制備與應(yīng)用
- 與稻瘟病Pi9基因緊密連鎖的分子標(biāo)記及其應(yīng)用
- 抗稻瘟病基因Pi9的特異性CAPS標(biāo)記Pi9caps及其應(yīng)用
- 稻瘟病抗性基因Pi9功能特異性分子標(biāo)記Pi9FNP及方法與應(yīng)用
- 一種稻瘟病抗性基因Pi9功能特異性分子標(biāo)記及其應(yīng)用
- 一種水稻抗瘟病基因Pi9的分子標(biāo)記及其應(yīng)用
- 水稻抗稻瘟病Pi9基因的共顯性功能分子標(biāo)記Pi9InDel2及其應(yīng)用
- 水稻抗稻瘟病Pi9基因的共顯性功能分子標(biāo)記Pi9InDel1及其應(yīng)用
- 水稻抗稻瘟病廣譜基因pi9的KASP分子標(biāo)記及其檢測方法和應(yīng)用
- 抗家畜和水產(chǎn)病原體的特異性IgY或復(fù)合IgY及其應(yīng)用
- 用于檢測多特異性結(jié)合物的結(jié)合搭檔的方法
- 雙特異性抗-半抗原/抗-血腦屏障受體的抗體、其復(fù)合物及它們作為血腦屏障穿梭物的應(yīng)用
- 抗CD3抗體、可活化抗CD3抗體、多特異性抗CD3抗體、多特異性可活化抗CD3抗體及其使用方法
- 抗體調(diào)控的雙抗原特異性T細(xì)胞及其制備方法和應(yīng)用
- 用于檢測多特異性結(jié)合物的結(jié)合搭檔的方法
- 用于LAMP擴(kuò)增以檢測HPV和分型的引物組合、試劑盒和方法
- 雙特異性抗-半抗原/抗-血腦屏障受體的抗體、其復(fù)合物及其作為血腦屏障穿梭物的應(yīng)用
- 與TfR結(jié)合的雙特異性抗體
- 抗原特異性TCR數(shù)據(jù)庫的建立方法及抗原特異性TCR的評估方法
