[發明專利]一種檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒及其方法在審
| 申請號: | 201510036682.6 | 申請日: | 2015-01-26 |
| 公開(公告)號: | CN104611431A | 公開(公告)日: | 2015-05-13 |
| 發明(設計)人: | 李積鳳;王辰;王軍;楊媛華;翟振國;梁燕;張云霞 | 申請(專利權)人: | 首都醫科大學附屬北京朝陽醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 四川君士達律師事務所 51216 | 代理人: | 芶忠義 |
| 地址: | 100020*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 纖維蛋白原 snp 試劑盒 及其 方法 | ||
1.一種檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒,其特征在于,包括2.500μl的10×DNA聚合酶緩沖液,2.000μl的dNTP混合物,0.125μl的DNA聚合酶,1.000μl的上游引物,1.000μl的下游引物,1.0ug的基因組模板DNA,1μl的ScaI,2μl的ScaI?buffer,1μl的DNA上樣緩沖液;其中,上游引物為5’cag?agt?gga?agg?cat?taa?cag?a?3’;下游引物為5’ggg?ttt?tgg?ttt?cca?gta?ctt?c?3’。
2.一種檢測纖維蛋白原SNP的方法,其特征在于,具體按照以下步驟實施:
步驟1、基因組DNA提取:用購自天根生物技術有限公司的基因組DNA提取試劑盒,從0.75ml人體血細胞中提取基因組DNA;
步驟2、利用步驟1中提取的基因組DNA為模板進行特異性PCR擴增;
步驟3、將酶切產物進行瓊脂糖凝膠中電泳,對基因型進行判定。
3.根據權利要求2所述的檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒的方法,其特征在于,所述步驟2中PCR體系為2.500μl的10×DNA聚合酶緩沖液、2.000μl的dNTP混合物、0.125μl的DNA聚合酶、1.000μl的上游引物、1.000μl的下游引物、1.0ug的基因組模板DNA,補充去離子水至25.000μl。
4.根據權利要求3所述的檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒的方法,其特征在于,所述步驟2中25.000μl?PCR體系的程序設定如下:94℃5min;94℃40s→52℃40s→72℃40s,25個循環;72℃10min。
5.根據權利要求2所述的檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒的方法,其特征在于,所述步驟2中使用的特異性引物為上游引物和下游引物,由Sigma公司合成,序列如下所示:上游引物5’cag?agt?gga?agg?cat?taa?cag?a?3’;下游引物5’ggg?ttt?tgg?ttt?cca?gta?ctt?c?3’。
6.根據權利要求2所述的檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒的方法,其特征在于,所述步驟3在酶切體系中進行,所述25.000μl的酶切體系為:20μl的PCR產物、1μl的ScaI、2μl的ScaI?buffer、補去離子水至25.000μl。
7.根據權利要求2所述的檢測纖維蛋白原SNP的試劑盒的方法,其特征在于,所述步驟3中所述的酶切產物的酶切位點如下:5’AGT’ACT3’,3’TCA’TGA5’,序列中間的單引號表示酶切位點;根據上述酶切位點脫氧核糖核苷酸是野生型A還是突變型T對基因型進行判定:
如果酶切產物為176bp、78bp及39bp三種片段,顯示檢測個體基因型為AA基因型,為野生型純合體,電泳結果為三條帶;
如果酶切產物為176bp、117bp、78bp及39bp四種片段,顯示檢測個體基因型為AG基因型,為雜合體,電泳結果為四條帶;
如果酶切產物為176bp及117bp兩種片段,顯示檢測個體基因型為GG基因型,為突變型純合體,電泳結果為兩條帶。
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