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[發(fā)明專利]一種以1,4,7,10-四氮雜環(huán)十二烷為骨架的手性順磁探針在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201510033470.2 申請日: 2015-01-23
公開(公告)號: CN104592200A 公開(公告)日: 2015-05-06
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 蘇循成;楊峰;趙宇 申請(專利權(quán))人: 南開大學(xué)
主分類號: C07D401/06 分類號: C07D401/06;G01N24/10
代理公司: 天津佳盟知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 12002 代理人: 侯力
地址: 300071*** 國省代碼: 天津;12
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 10 四氮雜環(huán) 十二 骨架 手性 探針
【說明書】:

技術(shù)領(lǐng)域

?本發(fā)明屬于化學(xué)生物學(xué)研究中的高性能探針,特別是一種以1,4,7,10-四氮雜環(huán)十二烷(cyclen)為骨架的手性順磁探針。

背景技術(shù)

蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)是其生物功能的基礎(chǔ)。順磁效應(yīng)下的核磁共振由于其獨(dú)特的性質(zhì),近年來在生物大分子(如蛋白質(zhì)、DNA、RNA等)的結(jié)構(gòu)和功能研究中發(fā)揮著越來越強(qiáng)大的作用;順磁效應(yīng)能夠提供其它技術(shù)手段難以獲得的大分子長程結(jié)構(gòu)信息;功能化的順磁標(biāo)簽則是順磁技術(shù)中修飾蛋白質(zhì)最為重要的技術(shù)手段之一。

順磁標(biāo)簽的質(zhì)量對利用順磁核磁研究生物大分子的結(jié)構(gòu)與動態(tài)學(xué)關(guān)系起著決定性的作用。順磁標(biāo)簽一般均是一些具有雙功能團(tuán)的小分子探針,一端用于順磁金屬離子的螯合,另一端則用于與蛋白質(zhì)連接。將順磁標(biāo)簽與生物大分子連接后,利用順磁效應(yīng)可以揭示生物大分子的作用機(jī)制和作用構(gòu)象變化、小分子與大分子作用的高分辨結(jié)構(gòu)(參見:J.?Biomol.?NMR,?2010,?46:?101-112),這將對有效藥物先導(dǎo)分子進(jìn)行篩選與優(yōu)化起到重要的導(dǎo)向作用。

一個好的標(biāo)簽通常需要需要滿足以下條件:1)標(biāo)簽連接的剛性。當(dāng)標(biāo)簽與順磁金屬離子結(jié)合后,若此順磁標(biāo)簽和蛋白質(zhì)的相對位置發(fā)生變化,會使PCS(贋接觸化學(xué)位移)和RDC(殘余偶極耦合)明顯降低;2)光學(xué)純度單一,金屬離子和具有多個潛在手性中心的標(biāo)簽結(jié)合后,會產(chǎn)生對映異構(gòu)體,導(dǎo)致出現(xiàn)多套NMR信號,進(jìn)而使圖譜變得復(fù)雜而難以解析;3)標(biāo)簽與蛋白鏈接的穩(wěn)定性。

Su等(Chembiochem,?2006,?7:?1599–1604.),首先用Ellman’s試劑5,5'-二硫代雙(2-硝基苯甲酸)(DTNB)活化蛋白質(zhì)的巰基形成二硫鍵,過量的DTNB通過透析除去;之后加入等量的標(biāo)簽,標(biāo)簽中的巰基即和活化的二硫鍵反應(yīng)生成新的二硫鍵,最終把多肽標(biāo)簽和蛋白質(zhì)連接起來(反應(yīng)過程見圖1)。離去的5-巰基-2-硝基苯甲酸(TNB)呈現(xiàn)明顯黃色,這為反應(yīng)過程的檢測提供了很大的便利。這種標(biāo)記方法產(chǎn)率較高(>70%),因?yàn)長BT多肽標(biāo)簽酸性很強(qiáng),與蛋白質(zhì)連接之后其pI值會明顯改變,所以可以通過離子交換色譜柱將連接產(chǎn)物和未連接蛋白質(zhì)分離。然而,二硫鍵不穩(wěn)定,這阻礙了此類標(biāo)簽的廣泛應(yīng)用。

Prudencio等(Chem.?Eur.?J.,?2004,?10(3):?3252~3260.)報(bào)道了具有兩個活性巰基的化合物L(fēng)-1(見圖2),其由DTPA雙酸酐和S-(2-氨乙基)甲烷硫代磺酸反應(yīng)得到,合成方法簡單。此標(biāo)簽可以和蛋白質(zhì)上距離8~10?的兩個半胱氨酸殘基同時反應(yīng),形成兩個二硫鍵,增加了標(biāo)簽的剛性,限制了標(biāo)簽相對于蛋白質(zhì)的運(yùn)動,避免了PCS的平均化,在距離順磁金屬離子4nm處仍有明顯的PCS。但是由于其存在多個手性中心,與蛋白質(zhì)連接以后,滴加順磁金屬離子,會產(chǎn)生至少5個順磁信號峰,致使1H-15N?HSQC譜圖非常復(fù)雜。

Li等(Chem.?Commun.?,?2012,?48:?2704–2706.)首次報(bào)道了利用末端烯鍵與蛋白質(zhì)側(cè)鏈巰基的邁克爾加成反應(yīng)將化合物L(fēng)-2(見圖2)定點(diǎn)標(biāo)記到蛋白質(zhì)上,加成產(chǎn)物含有硫醚鍵,它可以在還原性環(huán)境和堿性條件下穩(wěn)定存在。然而化合物L(fēng)-2只有三個配位點(diǎn),鑭系金屬離子和其配位以后,還能結(jié)合其他配位原子。

Vlasie等(Chem.?Eur.?J.,?2007,?13(6):?1715~1723.)報(bào)道了化合物L(fēng)-3(見圖2),它通過兩個二硫鍵和蛋白質(zhì)上的兩個巰基連接,這種連接方式增加了標(biāo)簽的剛性,降低了順磁標(biāo)簽相對于蛋白質(zhì)的運(yùn)動。但是作者發(fā)現(xiàn)L-2和蛋白質(zhì)連接以后,滴加順磁金屬離子,HSQC中部分殘基有兩個順磁信號,說明標(biāo)簽和順磁金屬離子配位以后,存在不止一種構(gòu)象。

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