[發明專利]一種用于魚腥草分子鑒定的DNA條形碼，引物、試劑盒和鑒定方法

有效

• 申請號: 201510020393.7
• 申請日: 2015-01-15
• 公開（公告）號: CN104593365B
• 公開（公告）日: 2017-09-22
• 發明（設計）人: 鐘軍;熊興耀
• 申請（專利權）人: 湖南農業大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 長沙市融智專利事務所43114
• 代理人: 袁靖

1.一種用于魚腥草分子鑒定的方法，其特征在于：該方法用于區分魚腥草與白苞裸蒴，以正向序列F：GGAAGTAAAAGTAACAAGG，反向序列R：TCCTTCCGCTTATTGATATGC為引物，以待檢測樣品的基因組DNA為模板，進行PCR擴增，分別擴增出642bp和626bp大小的DNA片段，序列如SEQ NO:1和NO:2；將擴增出來的片段進行測序：

魚腥草在位點4上的堿基為A，位點5上的堿基為T，位點36上的堿基為C，位點41上的堿基為A，位點46-48上的堿基為TCG，位點56-57上的堿基都為GG，位點67-68上的堿基為CC，位點71上的堿基為G，位點76-78上的堿基為CCA，位點84-86上的堿基為CCC，位點96-97上的堿基為GA，位點102-103上的堿基為CG，位點107-108上的堿基為GA，位點111上的堿基為C，在位點131上的堿基為G，位點136-138上的堿基為ATT，位點141-143上的堿基為CCA，位點155上的堿基為A，位點159上的堿基為C，位點170上的堿基都為C，位點176上的堿基為G，位點185-186上的堿基為CG，位點208上的堿基為C，位點376-377上的堿基為GC，位點383-384上的堿基為GA，位點392-393上的堿基為CC，位點396-398上的堿基為GCC，位點405-407上的堿基為GAG，位點414-415上的堿基為CT，位點423-424上的堿基為GG，位點429-430上的堿基為GT，位點433-437上的堿基為GACGT，位點443上的堿基為G，位點448上的堿基為A，位點452-455上的堿基為CCCT，位點462上的堿基為C，位點465-467上的堿基為CCG，位點474上的堿基為T，位點482上的堿基為A，位點495上的堿基都為C，位點508上的堿基為G，位點515-516上的堿基為GT，位點523-524上的堿基為GA，位點530上的堿基為G，位點532上的堿基為A，位點539上的堿基為G，位點554上的堿基為C，位點562-563上的堿基為AC，位點565-567上的堿基為AGC，位點572上的堿基為T，在位點576-578上的堿基為ATA，位點581上的堿基為C，位點592上的堿基為G，位點595上的堿基為C，位點597上的堿基為A，位點600上的堿基都為G；而白苞裸蒴在位點4上的堿基為C，位點5上的堿基為C，位點36上的堿基為G，位點41上的堿基為G，位點46-48上的堿基為GTC，位點56-57上的堿基都為AT，位點67-68上的堿基為GT，位點71上的堿基為T，位點76-78上的堿基為GTG，位點84-86上的堿基為ATG，位點96-97上的堿基為CT，位點102-103上的堿基為TA，位點107-108上的堿基為AT，位點111上的堿基為A，在位點131上的堿基為A，位點136-138上的堿基為CCC，位點141-143上的堿基為TCC，位點155上的堿基為C，位點159上的堿基為T，位點170上的堿基都為T，位點176上的堿基為C，位點185-186上的堿基為AC，位點208上的堿基為T，位點376-377上的堿基為TA，位點383-384上的堿基為CG，位點392-393上的堿基為AG，位點396-398上的堿基為TTG，位點405-407上的堿基為CCC，位點414-415上的堿基為GG，位點423-424上的堿基為TT，位點429-430上的堿基為CC，位點433-437上的堿基為ACGTG，位點443上的堿基為T，位點448上的堿基為C，位點452-455上的堿基為TTGC，位點462上的堿基為T，位點465-467上的堿基為GTA，位點474上的堿基為C，位點482上的堿基為G，位點495上的堿基都為T，位點508上的堿基為A，位點515-516上的堿基為AC，位點523-524上的堿基為CC，位點530上的堿基為A，位點532上的堿基為C，位點539上的堿基為A，位點554上的堿基為G，位點562-563上的堿基為GA，位點565-567上的堿基為CCG，位點572上的堿基為G，在位點576-578上的堿基為GCC，位點581上的堿基為T，位點592上的堿基為T，位點595上的堿基為G，位點597上的堿基為C，位點600上的堿基都為A。

2.根據權利要求1所述的用于魚腥草分子鑒定的方法，其特征在于：

PCR體系包括10×Buffer、0.25mmol/L dNTP、2.5mmol/L MgCL₂、0.2U TaqDNA聚合酶、50ng模板DNA、引物0.2μmol/L。