[發明專利]一種肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記及其應用有效
| 申請號: | 201510015900.8 | 申請日: | 2015-01-13 |
| 公開(公告)號: | CN104593363B | 公開(公告)日: | 2017-04-12 |
| 發明(設計)人: | 林浴霜;王丹丹;胡瑋;曹頂國;周艷;雷秋霞 | 申請(專利權)人: | 山東大學 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 肉食 優良 屠宰 性狀 分子 遺傳 標記 及其 應用 | ||
技術領域
本發明屬于分子生物技術領域,涉及一種肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記及其在輔助篩選或預測具備優良屠宰性狀的肉食雞品種中的應用。
背景技術
DNA標記,又稱DNA多態性標記、DNA分子標記,是DNA水平上遺傳多態性的直接反映,也是遺傳標記的重要組成部分。DNA分子標記與形態標記、細胞學標記和蛋白質標記相比具有很多優點:不受環境條件的影響,不受發育階段的限制,也不受個體和生物組織器官的限制;同時基因組DNA變異非常豐富,可供選擇的分子標記數量大大超過形態標記、細胞學標記和蛋白質標記的數量。單核苷酸多態性標記(single?nucleotide?polymorphism,SNP)是DNA遺傳標記中的一種類型,是同一物種不同個體基因組DNA的等位序列上單個核苷酸存在差別的現象,屬于最為常見的一種遺傳變異。SNPs在生物基因組中的分布是不均勻的,主要表現為在非編碼區多于編碼區,同義突變的概率低于其他方式突變的概率。SNPs在生物學諸多領域的研究中具有特殊的應用價值,如基因組結構與功能的闡明、遺傳改良操作、生物遺傳多樣性分析、基因連鎖圖譜構建和關聯分析等。隨著相關檢測技術的不斷創新及完善,SNP作為一類新型的分子標記方法將擁有更廣闊的發展空間。目前SNPs的檢測和篩選方法大致可以分為兩類:一類是直接查找法,即運用現代生物信息學手段,從已有的核苷酸數據庫中尋找SNPs;另一種是實驗法,又可分為四種類型,即直接測序法、DNA分子構象法、基因芯片技術以及限制性酶切法。其中使用限制性酶切檢測SNPs具備了簡便、快速、靈敏和經濟的特點,非常適用于大批量樣品的分析。其核心在于正確選擇所使用合適的內切酶,使得基因中的單堿基改變通過瓊脂糖凝膠電泳中的片段差異體現出來,就可以初步獲悉基因的單核苷酸多態性特征。
在多種生物中,plin基因編碼的脂滴包被蛋白(perilipin,PLIN)屬于脂滴包被蛋白PAT家族中最具代表性的一員,是一種受激素調控的包被在脂滴表面含量最為豐富的可磷酸化蛋白。它參與了調節脂肪細胞內脂質代謝的過程,對于脂滴內甘油三酯的儲存和動員具有關鍵性的調節作用。在基礎狀態下,PLIN蛋白可以保護脂滴內的脂質免于脂肪組織三酰甘油水解酶(adipose?triglyceride?lipase,ATGL)和激素敏感脂酶(hormoral?sensentive?lipase,HSL)的降解;在兒茶酚胺等激素的刺激下PLIN蛋白發生磷酸化,從而使脂滴暴露于ATGL和HSL下,加快脂解;同時,PLIN蛋白還介導了HSL向脂滴內的轉運過程,并與脂滴核心的酯類結合,從而增加了脂解程度。目前,對PLIN蛋白的研究證明該蛋白對多種生物的脂質代謝和脂肪性狀形成有重要的調控作用。敲除了plin基因的小鼠脂肪組織明顯減少,肌肉組織增加,并且高脂飲食導致的肥胖被明顯抑制;plin被視為人類動脈粥樣硬化噬斑穩定性的分子標志,其mRNA在嚴重肥胖者的皮下脂肪組織明顯低于非肥胖組織;plin基因的突變在糖尿病發生過程中與男人體質量的降低有關,可能增加女人糖尿病的患病風險;人類plin基因的SNPs位點對白人的肥胖和動脈粥樣硬化風險有重要的遺傳決定性;同時,plin的SNPs對于牛和雞等生物的脂肪沉積和脂肪形狀形成具有重要影響,可以作為影響肉質的候選基因用于肉牛和肉雞的評價與育種研究。
脂肪性狀是評價雞肉品質的重要指標,此類性狀的發育會直接影響其商品性能。因此,調控脂肪性狀發育基因的SNPs的表征對于通過肉雞的分子育種和輔助選擇提高其生產性能具有十分重要的作用。但經檢索,目前plin1基因SNPs作為遺傳標記,特別是作為肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記應用于篩選或預測具備優良屠宰性狀的肉食雞品種還未見報道。
發明內容
針對現有技術的不足,本發明要解決的問題是提供一種肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記及其在輔助篩選或預測具備優良屠宰性狀的肉食雞品種中的應用。
本發明所述的肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記是雞plin1基因單核苷酸多態性序列上的多態性位點,其特征在于:所述雞plin1基因單核苷酸多態性序列的多態性位點是在plin1基因序列第八外顯子的第49位為A或T的堿基多態性位點,表現為AA、AT或TT三種基因型,其中TT型為肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記。
本發明所述肉食雞的優良屠宰性狀分子遺傳標記在輔助篩選或預測具備優良屠宰性狀的肉食雞品種中的應用。
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