[發明專利]類病斑表型的抑制子SLM1

在審

• 申請號: 201480018854.0
• 申請日: 2014-01-30
• 公開（公告）號: CN105143455A
• 公開（公告）日: 2015-12-09
• 發明（設計）人: J.S.賈奎斯;J.季;G.喬哈;A.倫納德;李柏林
• 申請（專利權）人: 納幕爾杜邦公司;普渡研究基金會
• 主分類號: C12N15/82
• 分類號: C12N15/82;C07K14/415;C12Q1/68;A01H5/00
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 鄒雪梅;李炳愛

技術領域

本發明領域涉及植物育種和遺傳學，并且具體地，涉及用于植物改良的重組DNA構建體。

相關申請的交叉引用

本申請要求提交于2013年1月31日的美國臨時申請61/758937的權益，其全部內容以引用方式并入本文。

背景技術

玉米類病斑突變體(Johal等人1995BioEssays17(8)：685-692)為研究在很大程度上仍然難懂的植物細胞死亡的遺傳機制提供了極佳的模型。在不同的遺傳背景下許多類病斑的表型是不同的，表明天然變體可被用于遺傳分析這一現象的過程以搜尋修飾物。先前的研究(Penning等人2004Genome47：961-969)在玉米近交系Mo20W的2號染色體上鑒定了一個抑制隱性類病斑突變les23的主要數量性狀座位(被命名為slm1，類病斑-1的抑制子)。

發明內容

本公開包括了用于調節Slm1活性的方法和組合物。本發明提供了用于調節Slm1在宿主植物或植物細胞中的表達以調節農學特性的方法。

附圖說明和序列表

根據以下的詳細描述和附圖以及序列表，可以更全面地理解本公開，以下的詳細描述和附圖以及序列表形成本申請的一部分。

圖1A-圖1C示出了在玉米中圖位克隆slm1和在slm1處的四個突變等位基因。圖1A：F2和BC群體的slm1遺傳圖譜。標記的上方顯示了以厘摩為單位的遺傳距離，并且標記的下方顯示了重組體的數量。圖1B：對來自野生型和Mo20W的在slm1區間的BAC克隆進行測序和注釋。圖1C：在玉米slm1中的四個突變等位基因的基因結構和分子表征。

圖2：在玉米中les23的基因結構和突變等位基因。

圖3示出了在SLM1和LES23之間的物理相互作用。LES23的全長蛋白質與來自Va35的N末端(1-187位氨基酸)有物理相互作用，但與來自Va35的全長SLM1或來自Mo20W的預測截短產物沒有物理相互作用。

圖4示出了slm1的精細作圖步驟。

圖5示出了來自BC8F2種群包含2、1、0個Slm1-Mo20W拷貝的les23-ref純合植物(分別為從左至右)。

圖6A-6B示出了來自各種植物種類的LES23同源物的多重比對。所述比對使用ClustalW比對方法進行，多重比對的默認參數是：GAPPENALTY＝10，GAPLENGTHPENALTY＝0.2，DelayDivergentSequences＝30％，DNATransitionWeight＝0.5，ProteinWeightMatrix＝Gonnet系列，DNAWeightMatrix＝IUB。在所有植物種類中在位置19處的脯氨酸是保守的，但在les23-ref突變體中變成了亮氨酸。

圖7示出了slm1和les23相互作用的工作模型。

序列描述以及所附序列表遵循如37C.F.R.§1.821-1.825所列出的關于專利申請中核苷酸和/或氨基酸序列公開的規定。

SEQIDNO：1-SEQIDNO：46是本研究所用的引物。

SEQIDNO：47是來自Va35的野生型Slm1基因座的基因組核苷酸序列。

SEQIDNO：48是來自Va35的野生型Slm1基因座的編碼蛋白質的核苷酸序列。

SEQIDNO：49是來自Va35的野生型SLM1蛋白質的氨基酸序列。

SEQIDNO：50是來自Mo20W的突變體slm1基因座的基因組核苷酸序列。

SEQIDNO：51來自Mo20W的突變體slm1基因座的核苷酸序列，其對應于SEQIDNO：48，蛋白質編碼區。

SEQIDNO：52是SEQIDNO：51的翻譯產物，存在多個翻譯終止密碼子。突變體slm1基因座編碼截短的蛋白質(SEQIDNO：73)。

SEQIDNO：67是野生型Les23基因座的基因組核苷酸序列。

SEQIDNO：68是野生型Les23基因座的編碼蛋白質的核苷酸序列。

SEQIDNO：69是野生型LES23蛋白質的氨基酸序列。