[發明專利]一種用于檢測番茄斑萎病毒的NASBA方法有效
| 申請號: | 201410798148.4 | 申請日: | 2014-12-21 |
| 公開(公告)號: | CN104404173A | 公開(公告)日: | 2015-03-11 |
| 發明(設計)人: | 吳興海;陳長法;封立平;王簡;尼秀媚;王英超;張云霞;余冬冬 | 申請(專利權)人: | 山東出入境檢驗檢疫局檢驗檢疫技術中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94 |
| 代理公司: | 青島海昊知識產權事務所有限公司 37201 | 代理人: | 曾慶國 |
| 地址: | 266002 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 檢測 番茄 病毒 nasba 方法 | ||
1.一種檢測番茄斑萎病毒的NASBA擴增引物對,其特征在于,所述的引物對的上游引物、下游引物的序列分別為SEQ?ID?NO:1~2。
2.權利要求1所述的引物對在檢測植物樣品中番茄斑萎病毒的應用。
3.一種檢測番茄斑萎病毒的NASBA擴增試劑盒,包括如下組分:
1)NASBA擴增反應液A:
每25μL包括10×AMV?buffer?2.5μl,6.25mmol/L?NTPs?3μL,10mmol/L?dNTPs?1.5μL,10μmol/L引物NA-P1、NA-P2各0.5μL,雙蒸水9ml;其中引物NA-P1、NA-P2為權利要求1所述的上游引物、下游引物;
其中10×AMV?buffer為含40mmol/L?PH8.5的Tris-HCL,70mmol/L?KCL,12mmol/L?MgCL2,5mmol/L?DTT的緩沖液;
2)NASBA擴增反應液B:
所述的NASBA擴增反應液B包含有:0.5U?RNaseH,32U?T7RNA聚合酶,6.4U?AMV反轉錄酶,2μL?DMSO,0.1μL1mol/L二硫蘇糖醇,0.25μL?10mg/mL?BSA,20U?RNA酶抑制劑。
4.權利要求3所述的試劑盒在檢測植物樣品中番茄斑萎病毒的應用。
5.一種使用權利要求3所述的試劑盒檢測植物樣品中番茄斑萎病毒的方法,其特征在于,所述的方法包括如下的步驟:
1)樣品RNA的提取
A、取0.1g樣品,加液氮研磨成粉末狀,將研磨物迅速移入1.5mL離心管中,加入1mL?Trizol?Reagent,顛倒混勻,2℃~8℃,12000g,離心10min,
B、取上清,15℃~30℃,放置5min;加入0.2mL氯仿,用手劇烈震蕩,約15s,15℃~30℃,放置2min~3min;2℃~8℃,12000g,離心15min,
C、小心吸取約為600μL的上層水相,勿擾動中間相和下層相,加500μL異丙醇混合上清液,15℃~30℃,放置10min,2℃~8℃,12000g,離心10min;
D、去除上清液,沉淀中加入1mL?75%乙醇,洗滌;2℃~8℃,7500g,離心5min;
E、去除上清液,沉淀自然干燥后,將其溶于30μL~50μL無RNase的水中,即為待檢模板RNA;
2)進行TSWV的NASBA擴增
A、在裝有14μL環介導等溫擴增反應液A的反應管中加入3μL待檢模板RNA,
B、在DNA擴增儀或水浴鍋上65℃溫浴5min,立即轉入41℃溫浴5min,;
C.在反應管中迅速加入4μL反應液B;
D.于41℃溫育2h;
E.將金屬浴調到4℃中止反應,3min后取出;
3)電泳檢測
取3g瓊脂糖,于100mL電泳緩沖液中加熱,充分溶化,加入溴化乙錠貯存液至終濃度為0.5μg/mL,制膠,在電泳槽中加入電泳緩沖液,使液面剛剛沒過凝膠;將3μL~6μL?PCR擴增產物分別和適量加樣緩沖液混合,點樣;9V/cm恒壓電泳,直至溴酚藍指示劑遷移至凝膠中部;紫外檢測儀下觀察電泳結果并記錄。
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