[發明專利]一步式真核細胞多基因修飾載體構建方法有效
| 申請號: | 201410785444.0 | 申請日: | 2014-12-16 |
| 公開(公告)號: | CN104531749B | 公開(公告)日: | 2018-10-26 |
| 發明(設計)人: | 彭魯英;劉暢;李麗;康志騫;王鐸 | 申請(專利權)人: | 同濟大學 |
| 主分類號: | C12N15/79 | 分類號: | C12N15/79;C12N15/66 |
| 代理公司: | 上海科盛知識產權代理有限公司 31225 | 代理人: | 葉敏華 |
| 地址: | 200092 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一步 真核細胞 多基因 修飾 載體 構建 方法 | ||
1.一步式真核細胞多基因修飾載體構建方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)構建過表達質粒:
1.1)確定欲過表達的基因個數為N;
1.2)將欲過表達的N個基因的CDS區按順序分別插入到N個質粒pOE-1、pOE-2直到pOE-N中,并轉化大腸桿菌感受態細胞,過夜培養;
1.3)使用定點突變的方法將基因CDS中的BsaI位點進行突變,同時保證其所編碼的氨基酸不變;
1.4)使用菌落PCR篩選出陽性克隆子并擴增;
1.5)分別提取N個質粒;
2)構建敲低質粒:
2.1)確定欲敲低的基因個數為N;
2.2)將欲敲低的N個基因的shRNA oligo按順序分別引入到N個質粒pSH-1、pSH-2直到pSH-N中,并轉化大腸桿菌感受態細胞,過夜培養;
2.3)挑選3個克隆子,并測序驗證;
3)構建過表達和敲低混合質粒:
3.1)將欲過表達的基因的CDS或欲敲低的基因的shRNA oligo分別引入pOE質粒和pSH質粒中;
3.2)通過測序和菌落PCR驗證序列的正確性,并將BsaI位點進行突變;
4)按體積比,在離心管中順序加入如下樣品:
5)將步驟4)混合體系混勻后置于PCR儀中,進行加熱反應;
6)反應結束后,取出反應物,并加入ATP和PlasmidSafe DNase,其中,反應產物、ATP與PlasmidSafe DNase體積比為16:2:2;
7)步驟6)所得體系在37℃條件下孵育,然后將反應產物轉化入感受態細胞中,并涂布于含有IPTG和X-gal的kana平板上,37℃孵育過夜;
8)第二天,挑取3個藍色菌落進行擴增;
9)第三天,提取質粒并鑒定;
所述的N為大于1的正整數,
pOE質粒均包含有一個CMV啟動子、一個多克隆位點、一個bGH polyA序列、一個ori復制區和一個四環素抗性基因,并且兩個BsaI位點分別位于CMV啟動子上游和bGH polyA序列下游;pOE-1~pOE-10質粒區別僅僅是BsaI切割位點序列不同,其余結構部分完全相同,其中質粒pOE-1~pOE-10用于基因的過表達;
pSH質粒均包含有一個U6啟動子、一個多克隆位點、一個ori復制區和一個四環素抗性基因,兩個BsaI位點分別位于U6啟動子上游和下游;pSH-1~pSH-10質粒區別僅僅是BsaI切割位點序列不同,其余結構部分完全相同,pSH-1~pSH-10用于基因的敲低;
pBL質粒均包含有一段100bp的非編碼stuffer序列、一個多克隆位點、一個ori復制區和一個四環素抗性基因,兩個BsaI位點分別位于非編碼stuffer序列的上游和下游;pBL-1~pBL-10質粒區別僅僅是BsaI切割位點序列不同,其余結構部分完全相同,pBL-1~pBL-10用于填補位置空缺;
pDV質粒均包含有一個CMV啟動子、一個EGFP編碼序列、一個SV40polyA序列、一個SV40啟動子、一個NeoR/KanaR序列、一個ori復制區和一個lacZ基因,兩個BsaI位點分別位于lacZ基因的上游和下游;pDV-1~pDV-10質粒區別僅僅是BsaI切割位點序列不同,其余結構部分完全相同,pDV-1~pDV-10為最終目的載體。
2.根據權利要求1所述的一步式真核細胞多基因修飾載體構建方法,其特征在于,所述的過表達質粒、敲低質粒或過表達和敲低混合質粒提取后,將質粒濃度調整到200ng/μl。
3.根據權利要求1所述的一步式真核細胞多基因修飾載體構建方法,其特征在于,所述的pDV-N質粒濃度為25ng/μl,所述的ATP濃度為10mM。
4.根據權利要求1所述的一步式真核細胞多基因修飾載體構建方法,其特征在于,步驟5)中,進行加熱反應的程序為:
37℃加熱5min,然后20℃加熱5min,進行20個循環后,再繼續37℃加熱5min,之后升溫到80℃加熱20min。
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