[發(fā)明專(zhuān)利]下一代測(cè)序分析系統(tǒng)及其下一代測(cè)序分析方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201410748830.2 | 申請(qǐng)日: | 2014-12-09 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN105733921A | 公開(kāi)(公告)日: | 2016-07-06 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 鄭少樺;邱育賢;莊曜宇;盧子彬;董恒元 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 財(cái)團(tuán)法人資訊工業(yè)策進(jìn)會(huì) |
| 主分類(lèi)號(hào): | C12M1/00 | 分類(lèi)號(hào): | C12M1/00;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海專(zhuān)利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 31100 | 代理人: | 胡林嶺 |
| 地址: | 中國(guó)臺(tái)灣臺(tái)北市*** | 國(guó)省代碼: | 中國(guó)臺(tái)灣;71 |
| 權(quán)利要求書(shū): | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū): | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 下一代 分析 系統(tǒng) 及其 方法 | ||
1.一種用于一下一代測(cè)序(NextGenerationSequencing)分析系統(tǒng)的下一代測(cè)序分析方法,該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)與一基因數(shù)據(jù)庫(kù)連線(xiàn),包含:
(a)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)接收一目標(biāo)基因輸入;
(b)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)根據(jù)該基因數(shù)據(jù)庫(kù)的一基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),決定該目標(biāo)基因輸入的至少一基因群組;
(c)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)根據(jù)該至少一基因群組,將該基因數(shù)據(jù)庫(kù)的一標(biāo)準(zhǔn)基因參考序列調(diào)整為一特征基因參考序列;
(d)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)將多份待測(cè)基因片段數(shù)據(jù)與該特征基因參考序列進(jìn)行比對(duì);
(e)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)分析該等待測(cè)基因片段數(shù)據(jù)與該特征基因參考序列的一基因變異率。
2.如權(quán)利要求1所述的下一代測(cè)序分析方法,其中,該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)包含一基因家族(GeneFamily)數(shù)據(jù),步驟(b)更包含:
(b1)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)根據(jù)該基因數(shù)據(jù)庫(kù)的該基因家族數(shù)據(jù),決定該目標(biāo)基因輸入的該至少一基因群組。
3.如權(quán)利要求1所述的下一代測(cè)序分析方法,其中,該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)包含一基因路徑(GenePathway)數(shù)據(jù),步驟(b)更包含:
(b1)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)根據(jù)該基因數(shù)據(jù)庫(kù)的該基因路徑數(shù)據(jù),決定該目標(biāo)基因輸入的該至少一基因群組。
4.如權(quán)利要求1所述的下一代測(cè)序分析方法,其中,步驟(b)更包含:
(b1)令該下一代測(cè)序分析系統(tǒng)根據(jù)該基因數(shù)據(jù)庫(kù)的該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),透過(guò)一分組演算法決定該目標(biāo)基因輸入的該至少一基因群組。
5.一種下一代測(cè)序(NextGenerationSequencing)分析系統(tǒng),包含:
一傳輸接口,用以與一基因數(shù)據(jù)庫(kù)連線(xiàn),其中,該基因數(shù)據(jù)庫(kù)具有一基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)以及一標(biāo)準(zhǔn)基因參考序列;
一輸入接口,用以接收一目標(biāo)基因輸入;
一存儲(chǔ)器,存有多份待測(cè)基因片段數(shù)據(jù);
一處理單元,用以:
根據(jù)該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),決定該目標(biāo)基因輸入的至少一基因群組;
根據(jù)該至少一基因群組,將該標(biāo)準(zhǔn)基因參考序列調(diào)整為一特征基因參考序列;
將該等待測(cè)基因片段數(shù)據(jù)與該特征基因參考序列進(jìn)行比對(duì);
分析該等待測(cè)基因片段數(shù)據(jù)與該特征基因參考序列的一基因變異率。
6.如權(quán)利要求5所述的下一代測(cè)序分析系統(tǒng),其中,該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)包含一基因家族(GeneFamily)數(shù)據(jù),該處理單元系根據(jù)該基因家族數(shù)據(jù)決定該目標(biāo)基因輸入的該至少一基因群組。
7.如權(quán)利要求5所述的下一代測(cè)序分析系統(tǒng),其中,該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)包含一基因路徑(GenePathway)數(shù)據(jù),該處理單元系根據(jù)該基因路徑數(shù)據(jù)決定該目標(biāo)基因輸入的該至少一基因群組。
8.如權(quán)利要求5所述的下一代測(cè)序分析系統(tǒng),其中,該處理單元系根據(jù)該基因數(shù)據(jù)庫(kù)的該基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),透過(guò)一分組演算法決定該目標(biāo)基因輸入的該至少一基因群組。
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