[發明專利]一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因及其剪切突變體的方法在審
| 申請號: | 201410725610.8 | 申請日: | 2014-12-05 |
| 公開(公告)號: | CN104630343A | 公開(公告)日: | 2015-05-20 |
| 發明(設計)人: | 高廣勛 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍第四軍醫大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 無 | 代理人: | 無 |
| 地址: | 710032 *** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 快速 檢測 慢性 粒細胞 白血病 bcr abl 融合 基因 及其 剪切 突變體 方法 | ||
技術領域
本發明涉及血液病分子生物學領域,尤其涉及一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因及其剪接突變體的方法。
背景技術
慢性粒細胞白血病是造血組織的惡性腫瘤,BCR/ABL融合基因及其不同突變體的檢測是該病診斷、病情監測、預后及指導治療的一個關鍵指標。目前的檢測方式很難同時檢測該基因的不同突變體,大多只能檢測其中一個基因,且檢出率低,耗費時間較長。
因此,現有技術有待于改進。
發明內容
本發明為了解決現有技術的不足,提供一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,采用多重巢式PCR方法,短時間內快速檢測出BCR/ABL融合基因及其不同突變體。
為解決上述技術問題,本發明實施例提供的一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,采用如下技術方案:
一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,其特征在于,包括如下步驟:
(1)A液:特異性逆轉錄引物
引物ABL(RT)及E2A(RT)等比例用DEPC水稀釋混勻,濃度為2.5pmol/μl;
B液:巢式第一輪PCR反應液500μl(20測試):
包含引物為:BCR-1、BCR-3、ABL-1、E2A-1、E2A-3;
第一輪多重PCR引物100pmol/條,緩沖體系為:Tris-HCL(PH8.3)8.8MM、KCL?44MM、dNTPs?0.16MM/each、MgCL21.32MM。儲存于-20℃,備用;
C液:巢式第二輪PCR反應液500μl(20測試):
包含引物為:BCR-2、BCR-4、ABL-2、E2A-2、E2A-4;
各組第二輪多重PCR引物125pmol/條,反應緩沖體系為:Tris-HCL(PH?8.3)9.6MM、KCL?48MM、dNTPs?0.192MM/each、MgCL21.44MM,儲存于-20℃,
D液:陰性對照(陽性內對照)健康人外周血單個核細胞cDNA溶液,
E液:陽性對照-BCR/ABL?b3a2陽性K562細胞系cDNA溶液,
F液:陽性對照-BCR/ABL?e1a2陽性患者cDNA溶液,
G液:陽性對照-BCR/ABL?b2a2陽性患者cDNA溶液;
(2)采用廣泛表達的轉錄因子增強子結合因子基因(E2A)的mRNA作為陽性內對照;
(3)巢式第一輪PCR(25μl體系):各取患者cDNA、陰性對照D液和陽性對照E液2μl,各取B液22ul,Taq?DNA聚合酶0.5μl(1.25U),PCR條件為:95℃5min后,95℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸10min,共30個循環,結束反應;
(4)巢式第二輪PCR(25ul體系):各取C液22μl,相應的第1輪PCR產物2μl,Taq?DNA聚合酶0.5μl(1.25U)。PCR反應條件同第一輪。
本發明提供的一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,采用特異性的反轉錄引物,提高轉錄效率,采用多重巢式PCR方式增加PCR效果,較短時間內快速檢測出BCR/ABL融合基因及其不同突變體,為疾病的早期診斷及靶向治療提供依據。
附圖說明
圖1為BCR/ABL融合基因PCR產物瓊脂糖凝膠電泳EB染色后紫外燈下成像結果。
具體實施方式
下面結合本發明實施例提供的快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因的方法進行詳細描述。
如圖1所示,本發明實施例提供的一種快速檢測慢性粒細胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,其特征在于,包括如下步驟:
(1)A液:特異性逆轉錄引物
引物ABL(RT)及E2A(RT)等比例用DEPC水稀釋混勻,濃度為2.5pmol/μl,
B液:巢式第一輪PCR反應液500μl(20測試):
包含引物為:BCR-1,BCR-3,ABL-1,E2A-1,E2A-3,
第一輪多重PCR引物100pmol/條,緩沖體系為:Tris-HCL(ph?8.3)8.8MM、KCL?44MM、dNTPs?0.16MM/each、MgCL21.32MM。儲存于-20℃,備用,
C液:巢式第二輪PCR反應液500μl(20測試):
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