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[發(fā)明專利]一種利用流式細胞儀測定土壤中噬菌體豐度的方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201410595919.X 申請日: 2014-10-30
公開(公告)號: CN104483290A 公開(公告)日: 2015-04-01
發(fā)明(設(shè)計)人: 魏云林;孫策;季秀玲;李珊;林連兵;張琦 申請(專利權(quán))人: 昆明理工大學
主分類號: G01N21/47 分類號: G01N21/47;G01N35/00
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 650093 云*** 國省代碼: 云南;53
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 利用 細胞 測定 土壤 噬菌體 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種利用流式細胞儀測定土壤中噬菌體豐度的方法,其特征在于按如下步驟進行:

(1)稱取1~10?g土樣,加入10~30?ml?經(jīng)過0.02?μm濾膜過濾的pH=8的TE?buffer,渦旋震蕩1~10?min后,加入體積百分比10~15%的Tween80?50~100μl、1~10?mM的焦磷酸鈉1~10ml,充分震蕩混勻后超聲30~45s,停止30~60s,重復(fù)3~5次,離心前充分震蕩,1000~1500?g離心1~5?min,2500~3000?g進行二次離心1~10?min,上清液經(jīng)過布氏漏斗過濾,收集濾液;按終濃度為1μg/ml的比例向濾液中加入DNAse?I和RNAse?A,在37℃或室溫中消化30?min后,按樣品終濃度為0.5%?v/v的比例在分裝有樣品的凍存管中加入質(zhì)量百分比濃度為25%的戊二醛,4℃避光固定15~20?min后,放入液氮迅速冷凍后,于-80℃保存;

(2)用濾過的pH=8的TE?buffer將10000×SYBR?Gold和10000×SYBR?Green?I分別稀釋到100×SYBR?Gold、100×SYBR?Green?I,將步驟(1)樣品取出后,37℃水浴解凍,按終濃度為0.5×染液的比例將100×染液加入到步驟(1)樣品中,常溫避光染色5?min后,80℃水浴鍋中孵育10?min,避光冷卻到室溫;流式細胞儀檢測時,選擇側(cè)向角SSC-H和通道FL1-H進行檢測;

(3)將已染色的樣品進行上樣,在分析軟件中建立SSC-H/FL1-H散點圖,調(diào)整并確定流式細胞儀的前向角散射光FL1-H和側(cè)向角散射光SSC-H,進樣量設(shè)定在散點圖上持續(xù)打出10000個點,在SSC-H/FL1-H散點圖上根據(jù)核酸含量圈定噬菌體范圍,通過與BD流式細胞儀相連的WinMDI?2.9計算機分析軟件分析散點圖上噬菌體范圍和計數(shù)。

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