[發明專利]微陣列底物上的生物材料的選擇性處理

在審

• 申請號: 201410532711.3
• 申請日: 2009-09-18
• 公開（公告）號: CN104328109A
• 公開（公告）日: 2015-02-04
• 發明（設計）人: N.阿迪;A.阿利凡特;W.敖
• 申請（專利權）人: 霍夫曼－拉羅奇有限公司
• 主分類號: C12N15/10
• 分類號: C12N15/10;C07K1/14;C12M1/00;C12Q1/68;C12N15/11;G01N33/50;C40B50/00
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 權陸軍;石克虎

1.用于回收與微陣列載玻片偶聯的生物材料的方法，包括：

選擇要從微陣列載玻片回收的生物材料；

在微陣列載玻片表面上的獨特空間區域內找到該生物材料；和

從所述獨特空間區域洗脫至少一部分所選擇的生物材料，但不從所述獨特空間區域之外的微陣列載玻片區域洗脫實質數量的非選擇的生物材料，其中洗脫包括向至少所述獨特空間區域施加洗脫緩沖液。

2.權利要求1的方法，其中所述洗脫包括向僅僅所述獨特空間區域施加洗脫緩沖液。

3.權利要求2的方法，其中所述洗脫緩沖液是變性緩沖液，其作用是從微陣列載玻片表面釋放該部分的生物材料。

4.權利要求2的方法，其中將至少一部分的獨特空間區域加熱以促進從微陣列表面釋放至少一部分所選擇的生物材料。

5.權利要求1的方法，其中所選擇的生物材料為選自DNA、cDNA、RNA、肽、及其組合的成員。

6.用于從微陣列回收核酸材料的方法，包括：

選擇已經雜交至獨特空間區域內的微陣列載玻片表面的核酸材料；

向所述獨特空間區域施加變性緩沖液以使所選擇的核酸材料至少部分變性；和

使用惰性回收緩沖液沖洗所述微陣列表面以回收所選擇的核酸材料的變性的部分。

7.權利要求6的方法，還包括從所述惰性回收緩沖液中收集所選擇的核酸材料的變性的部分。

8.權利要求6的方法，還包括向所述獨特空間區域施加熱量以促進至少一部分所選擇的核酸材料的變性。

9.用于從微陣列回收核酸材料的系統，其包括：

微陣列掃描器，其配置為掃描微陣列表面并鑒定待回收的核酸材料的位置；

分配器，其配置為接收來自所述微陣列掃描器的輸入并將洗脫緩沖液在由所述微陣列掃描器指定的位置處分配在所述微陣列表面的不連續分配區，其中所述洗脫緩沖液不使來自陣列上的不想要的位置的片段變性；和

回收器，其配置為從所述微陣列表面回收所述洗脫緩沖液。

10.權利要求9的系統，還包括加熱器，其配置為加熱所述不連續分配區。

11.權利要求10的系統，其中所述加熱器是激光。

12.權利要求10的系統，其中所述回收器是帶電的表面。

13.使用生物材料作為原位雜交探針的方法，包括：

如權利要求1所述回收生物材料；

使用所述生物材料作為用于原位雜交的探針。

14.權利要求13的方法，其中不經過顯著擴增使用所述生物材料作為探針。

15.權利要求13的方法，其中在被用作探針之前，所述生物材料經過擴增。

16.權利要求13的方法，其中所述原位雜交是熒光原位雜交。

17.選擇性標記與微陣列載玻片偶聯的生物材料的方法，包括：

選擇待標記的生物材料；

確定該生物材料在微陣列載玻片表面上的獨特空間區域內的位置；和

標記至少一部分來自該獨特空間區域的所選擇的生物材料，而不標記來自所述獨特空間區域之外的微陣列載玻片區域的實質數量的非選擇的生物材料。

18.權利要求17的方法，其中所述標記進一步包括：

在獨特空間位置選擇性修飾生物材料；和

使用僅能與經過之前修飾的那些生物材料反應的試劑處理微陣列載玻片的一部分或整個微陣列載玻片。

19.權利要求18的方法，其中使用定向的光選擇性修飾所述生物材料。

20.權利要求18的方法，其中使用分配劑選擇性修飾所述生物材料。

21.權利要求17的方法，其中所述標記還包括：

向所述獨特空間區域施加緩沖液，所述區域不包括實質上在所述獨特空間區域之外的微陣列載玻片的區域；和

將標記物加入到所述獨特空間區域的緩沖液中，從而所述緩沖液內的至少一部分的生物材料摻入所述標記物。

22.權利要求17的方法，其中所選擇的生物材料為選自DNA、cDNA、RNA、肽、及其組合的成員。