[發(fā)明專利]微陣列底物上的生物材料的選擇性處理

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410532711.3
• 申請日: 2009-09-18
• 公開（公告）號: CN104328109A
• 公開（公告）日: 2015-02-04
• 發(fā)明（設(shè)計）人: N.阿迪;A.阿利凡特;W.敖
• 申請（專利權(quán)）人: 霍夫曼－拉羅奇有限公司
• 主分類號: C12N15/10
• 分類號: C12N15/10;C07K1/14;C12M1/00;C12Q1/68;C12N15/11;G01N33/50;C40B50/00
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 權(quán)陸軍;石克虎

在先申請

????本申請是國際申請日為2009年9月18日的國際PCT/US2009/057539進入中國、申請?zhí)枮?00980145609.5的題為“微陣列底物上的生物材料的選擇性處理”的發(fā)明專利申請的分案申請。本申請要求2008年9月22日提交的美國臨時申請系列號61/099,035和2008年10月16日提交的美國臨時專利申請系列號61/106,083的權(quán)益，二者通過引用方式并入本文。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及在微陣列載玻片表面上的生物材料的處理。因此，本發(fā)明涉及分子生物學(xué)和化學(xué)領(lǐng)域。

背景技術(shù)

微陣列是一種高通量技術(shù)，其由被稱作“特征”的排列的一系列數(shù)以千計的生物材料的精微的斑點組成。例如，DNA微陣列包括含有特定DNA序列的DNA片段的特征。這可以包括基因或其它DNA元件的短的部分，其被用作可以在適當?shù)臈l件下與cDNA或cRNA樣品（有時稱作靶標）雜交的探針。使用基于熒光的檢測法通過檢測熒光團標記的靶標來測定核酸序列的相對豐度，從而可以檢測并定量探針-靶標的雜交。在標準的微陣列中，探針與固體表面例如玻璃或硅共價偶聯(lián)。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明提供了用于從微陣列載玻片上的一個或多個獨特的和/或不連續(xù)的空間位置上選擇性洗脫生物材料的方法和系統(tǒng)。例如，在一個方面，用于回收與微陣列載玻片偶聯(lián)的生物材料的方法可以包括：選擇要從微陣列載玻片回收的生物材料，在微陣列載玻片表面上的獨特或不連續(xù)空間區(qū)域內(nèi)找到該生物材料，并且從所述獨特的空間區(qū)域洗脫至少一部分所選擇的生物材料，但不從所述獨特或不連續(xù)空間區(qū)域之外的微陣列載玻片區(qū)域洗脫實質(zhì)數(shù)量的非選擇的生物材料。在一個具體方面，洗脫進一步包括向所述獨特或不連續(xù)空間區(qū)域施加洗脫緩沖液。在另一個具體方面，所述洗脫緩沖液是變性緩沖液，其作用是從微陣列載玻片表面釋放該部分的生物材料。在另一個具體方面，將至少一部分的不連續(xù)空間區(qū)域加熱以促進從微陣列表面釋放至少一部分所選擇的生物材料。預(yù)期多種類型的生物材料用于本發(fā)明，包括但不限于，DNA、cDNA、RNA、肽、及其組合。

在本發(fā)明的另一個方面，提供了用于從微陣列回收核酸材料的方法。此方法可以包括：選擇已經(jīng)在獨特或不連續(xù)空間區(qū)域內(nèi)的微陣列載玻片表面上雜交的核酸材料，向所述獨特空間區(qū)域施加變性緩沖液以使所選擇的核酸材料至少部分變性，以及使用惰性回收緩沖液沖洗所述微陣列表面以回收所選擇的核酸材料的變性的部分。在更具體的方面，該方法還可以包括從所述惰性回收緩沖液中收集所選擇的核酸材料的變性的部分。在另一個更具體的方面，該方法還可以包括向所述獨特空間區(qū)域施加熱量以促進至少一部分所選擇的核酸材料的變性。

本發(fā)明另外提供了用于從微陣列載玻片上的獨特空間位置選擇性洗脫生物材料的系統(tǒng)。例如，在一個方面，用于從微陣列回收核酸材料的系統(tǒng)可以包括：微陣列掃描器，其配置為掃描微陣列表面并鑒定待回收的核酸材料的位置；分配器，其配置為接收來自所述微陣列掃描器的輸入并將洗脫緩沖液在由所述微陣列掃描器指定的位置處分配在所述微陣列表面的不連續(xù)分配區(qū)；和回收器，其配置為從所述微陣列表面回收所述洗脫緩沖液。還有可能接受來自另一個來源例如不同陣列的信息輸入，以確定從哪個區(qū)域進行洗脫。在更具體的方面，所述系統(tǒng)還可以包括加熱器，其配置為加熱所述不連續(xù)分配區(qū)。在另一個更具體的方面，所述加熱器是激光。