[發明專利]一種無創人肝癌早期檢測與鑒別診斷方法及系統

無效

• 申請號: 201410522229.1
• 申請日: 2014-09-30
• 公開（公告）號: CN104313136A
• 公開（公告）日: 2015-01-28
• 發明（設計）人: 朱克卿;邢同京;徐洪濤;徐祖龍;朱霞;胡月;薄世平;陸思嘉;王春香
• 申請（專利權）人: 江蘇億康基因科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C40B50/06
• 代理公司: 北京方圓嘉禾知識產權代理有限公司 11385
• 代理人: 董芙蓉

1.一種無創人肝癌早期檢測與鑒別診斷方法，包括下述步驟：1)從離體血漿中提取血漿游離DNA，構建基因組測序文庫；2)對其進行測序，測定基因組DNA順序并進行序列比對；3)以不同的基因組順序長度為基本分析單元，進行染色體拷貝數變異CNV分析并構建染色體CNV圖觀察是否有目視可觀察到的拷貝數改變；4)以不同的基因組順序長度為基本分析單元，進行染色體拷貝數變異Z分值CNV的分析。

2.根據權利要求1的方法，其特征在于基本分析單元為0.05-5.0M的基因組順序長度。

3.根據權利要求1的方法，其特征在于測序方法為高通量基因組測序或PCR測序。

4.根據權利要求1的方法，其特征在于所述步驟3)的操作為使用基因組測序數據測得的小片段數，按GC含量做標準化處理，計算每個染色體上每個基本分析單元測得的相對片段數，再與正常人對照組比較，計算CNV比值；將各染色體各基本分析單元的CNV比值與染色體位置作CNV圖。

5.根據權利要求1的方法，其特征在于步驟4)是將樣品每個基本分析單元與正常人對照組相比，以兩組的均數差與對照組標準差之間的比例關系，計算樣品基本分析單元測得順序片段數的偏離正常群體的程度從而進行Z分值CNV分析。

6.根據權利要求5的方法，其特征在于Z分值CNV的判斷標準為：一條染色體的長臂或短臂有兩個或兩個以上的基本分析單元Z分值或都大于4.0或都小于負4.0，或一個基本分析單元Z分值大于4.0或小于負4.0同時有其它4個基本分析單元Z分值或都大于3.0或都小于負3.0(同向)。上述界定值4.0也可以是3.0到6.0之間的其它數值。符合這個標準的Z分值CNV改變出現在人染色體1q或7q或19q，表現為拷貝數增加，或同時出現在人染色體1p，9q，14q，表現為拷貝數減少。

7.一種無創人肝癌早期檢測與鑒別診斷系統，其特征在于包括試劑盒、DNA測序儀和計算機，所述試劑盒用來對提取的血漿游離DNA構建基因組測序文庫，所述DNA測序儀進行基因組DNA測序；所述計算機基于測序數據進行CNV分析并構建染色體CNV圖和進行Z分值CNV分析并輸出分析結果。