[發(fā)明專利]對在人類血清中指示人類肺組織的病理學(xué)狀態(tài)的蛋白質(zhì)的鑒定

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410482100.2
• 申請日: 2008-09-11
• 公開（公告）號: CN104297490A
• 公開（公告）日: 2015-01-21
• 發(fā)明（設(shè)計）人: R·T·斯特里佩;E·伊茲比卡;S·H·貝克
• 申請（專利權(quán)）人: 癌癥預(yù)防和治療有限公司
• 主分類號: G01N33/68
• 分類號: G01N33/68;G01N30/88
• 代理公司: 上海專利商標事務(wù)所有限公司 31100
• 代理人: 余穎

本申請是申請日為2008年9月11日、申請?zhí)枮?00880113342.7、發(fā)明名稱為“對在人類血清中指示人類肺組織的病理學(xué)狀態(tài)的蛋白質(zhì)的鑒定”的發(fā)明專利申請的分案申請。

發(fā)明人：Robert?T.STREEPER,Elzbieta?IZBICKA和Sung?H.BAEK

背景技術(shù)

這是要求2007年9月11日提交的美國臨時申請60/971,422的權(quán)益最初的非臨時申請，在此將上述美國臨時申請引入以作參考。

1.技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明主要涉及對人類肺組織的病理學(xué)狀態(tài)(pathology)的診斷。更具體地，本發(fā)明涉及使用液相色譜-質(zhì)譜以鑒定在人類血清中存在的蛋白質(zhì)來診斷非小細胞肺癌和哮喘，當與正常群體中發(fā)現(xiàn)的相同蛋白相比在人類血清中在表達的相對強度方面改變時，所述蛋白質(zhì)指示與人類肺組織和人類呼吸系統(tǒng)相關(guān)的病理學(xué)狀態(tài)。通過鑒定與此類病理學(xué)狀態(tài)相關(guān)的蛋白質(zhì)，確定代表性的表達強度，并且將這些表達強度與在患者的血清中呈現(xiàn)的表達強度比較，可以通過簡單的血液測試在其發(fā)展早期檢測病理學(xué)狀態(tài)的存在并且區(qū)分所述病理學(xué)狀態(tài)。

2.相關(guān)技術(shù)的描述

呼吸系統(tǒng)的病理學(xué)狀態(tài)，例如哮喘和肺癌，影響數(shù)以百萬計的美國人。實際上，美國肺科協(xié)會(American?Lung?Association)報道幾乎2千萬的美國人遭受哮喘痛苦。美國癌癥協(xié)會(American?Cancer?Society)估計僅在2007年就有229,400例呼吸系統(tǒng)的新的癌癥病例，164,840例死于呼吸系統(tǒng)的癌癥。因此，當檢測出癌癥盡管仍然為局部時，癌癥病例的五年存活率為46％，肺癌患者的五年存活率僅為13％。相應(yīng)地，在肺癌已經(jīng)擴散前僅16％的該疾病被發(fā)現(xiàn)。基于癌細胞的病理學(xué)狀態(tài)通常將肺癌分類為兩種主要類型。各類型以被轉(zhuǎn)化從而變得癌化的細胞的類型而命名。小細胞肺癌源自在人類肺組織中的小細胞，而非小細胞肺癌通常包括不是小細胞類型的所有肺癌。因為對于所有的非小細胞類型治療通常相同，所以將非小細胞肺癌歸類在一起。非小細胞肺癌或NSCLC一起占所有肺癌的約75％。

降低肺癌患者的存活率的主要因素為肺癌難以早期診斷的事實。在人類中診斷肺癌或鑒定其存在的當前方法局限于采用X-射線、CT掃描和肺的類似掃描以物理上地確定腫瘤的存在或不存在。因此，肺癌的診斷常常僅應(yīng)答于已經(jīng)呈現(xiàn)一段顯著時間的癥狀，并且在所述疾病已經(jīng)在人類中呈現(xiàn)足夠長的時間以產(chǎn)生物理上可檢測的團塊(mass)之后進行。

類似地，檢測哮喘的當前方法典型地在癥狀例如反復(fù)哮喘、咳嗽和胸悶呈現(xiàn)后長時間進行。檢測哮喘的當前方法典型地局限于肺功能測試例如肺活量測試或激發(fā)測試(challenge?test)。此外，這些測試被醫(yī)生命令與許多其它測試一起進行以排除其它病理學(xué)狀態(tài)或疾病例如慢性阻塞性肺病(COPD)、支氣管炎、肺炎和充血性心力衰竭。

在現(xiàn)有技術(shù)中沒有在其發(fā)展早期診斷人類肺組織的病理學(xué)狀態(tài)的簡單可靠的方法。此外，現(xiàn)在不存在能夠指示特定肺組織病理學(xué)狀態(tài)的存在的可利用的血液測試。因此期望開發(fā)在疾病發(fā)展早期確定肺癌的存在的方法。同樣地期望開發(fā)在癥狀的出現(xiàn)的最早期診斷哮喘和非小細胞肺癌和使其相互區(qū)分開和與其它肺疾病例如感染區(qū)分開的方法。進一步期望鑒定在人類血液中存在的特定蛋白質(zhì)，其當在表達的相對強度方面改變時，指示非小細胞肺癌和/或哮喘的存在。

發(fā)明概述

本發(fā)明提供使用液相色譜電噴霧離子化質(zhì)譜(“LC-ESIMS”)，鑒定在人類血清中存在的蛋白質(zhì)的新方法，所述蛋白質(zhì)在正常個體和按照醫(yī)生診斷而已知患有非小細胞肺癌和哮喘的患者之間差異地表達。指示非小細胞肺癌和/或哮喘的蛋白質(zhì)的選擇通過將質(zhì)譜數(shù)據(jù)，即肽的質(zhì)量和在一維上隨時間表達的蛋白質(zhì)強度的圖解表示(graphical?indications)比較來進行。比較了數(shù)以千計的蛋白質(zhì)，導(dǎo)致11種蛋白質(zhì)的選擇，所述蛋白質(zhì)在不患有任何肺組織病理學(xué)狀態(tài)的個體的群體、按照醫(yī)生診斷患有哮喘的個體的群體和按照醫(yī)生診斷患有非小細胞肺癌的個體的群體之間以基本上不同的強度表達。

具體地，人類血清從“正常群體”、“哮喘群體”和“肺癌群體”獲得。本文所用的“正常群體”旨在定義已知未患有哮喘或肺癌的那些個體。本文所用的“哮喘群體”旨在定義已知患有哮喘并且被醫(yī)生診斷患有哮喘的那些個體。本文所用的“肺癌群體”旨在定義已知患有非小細胞肺癌并且被醫(yī)生診斷患有非小細胞肺癌的那些個體。