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[發明專利]一種可視化鑒定美洲大蠊的方法及試劑盒在審

專利信息
申請號: 201410396082.6 申請日: 2014-08-12
公開(公告)號: CN104651486A 公開(公告)日: 2015-05-27
發明(設計)人: 胡佳;岳巧云;邱德義;陳健;吳可量;劉德星;魏曉雅 申請(專利權)人: 岳巧云
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68
代理公司: 代理人:
地址: 528403 廣東省中山市東區*** 國省代碼: 廣東;44
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 可視化 鑒定 美洲 方法 試劑盒
【權利要求書】:

1.一種可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于包括如下步驟:

(1)設計美洲大蠊的可視化探針序列,如下:

探針I,方向為5’-3’:

AACTTTATTACTAGCTAGTAGTATAGTAGAAAGAGGTGCCGGA

其中,方框框住部分為前綴序列;與劃橫線部分序列反向互補,起到沉默空白的作用;粗體字部分為G-四聯結構;

(2)模板DNA的提取:提取待檢標本的基因組DNA;

(3)COI序列的制備:以步驟(2)得到的基因組DNA為模板,以LCO1490和HCO2198為引物對進行PCR反應,再將PCR產物純化,得到COI序列;

LCO1490:5’-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3’;

HCO2198:5’-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3’;

(4)可視化擴增:以步驟(3)得到的COI序列為模板,以LCO1490和探針I為引物對進行PCR反應;

(5)顯色和結果判斷:向步驟(4)得到的可視化擴增產物中加入NaCl溶液,變性和復性;接著加入氯鐵血紅素反應,再加入H2O2和ABTS2-,觀察顏色變化;顏色變為綠色,表示待檢樣品為美洲大蠊;顏色沒有發生變化,表示待檢樣品非美洲大蠊。

2.根據權利要求1所述的可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于:步驟(3)中所述PCR反應的體系為:10×PCR?buffer5μl,每種脫氧核苷酸濃度為2.5mM的dNTP2μl,濃度為5U/μl的EX?Taq酶0.5μl,20μM的LCO14901μl、20μM的HCO21981μl,基因組DNA3μl,ddH2O補足至50μl;

步驟(3)中所述的PCR反應的條件為:94℃3min;94℃30s、50℃30s、72℃30s,20個循環;72℃10min。

3.根據權利要求1所述的可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于:步驟(3)中所述的將PCR產物純化通過如下步驟實現:將PCR產物進行凝膠電泳,切下含目的基因條帶的凝膠,提取目的基因。

4.根據權利要求1所述的可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于:步驟(4)中所述可視化擴增的體系為10×PCR?buffer5μl,每種脫氧核苷酸濃度為2.5mM的dNTP2μl,濃度為5U/μl的DNA?Polymerase?I酶0.5μl,20μM的LCO14901μl,20μM的探針I4μl,COI序列1μl,ddH2O補足至50μl;

步驟(4)中所述可視化擴增的條件為94℃3min;94℃30s、50℃30s、72℃45s,30個循環。

5.根據權利要求1所述的可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于:步驟(5)中所述的空白沉默液為濃度為1.714M的NaCl溶液。

6.根據權利要求1所述的可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于:步驟(5)中所述的變性的條件為:95℃保溫5min;

步驟(5)中所述的復性的條件為:變性后以1℃/min的速度降溫至25℃保溫30min;

步驟(5)中所述的反應的條件為25℃保溫60min;

步驟(5)中所述的觀察顏色變化的觀察時間為2min。

7.根據權利要求1所述的可視化鑒定美洲大蠊的方法,其特征在于:步驟(5)中各成分的用量如下:每50μl可視化擴增產物加入0.012mol?NaCl、0.108μmol?hemin、0.126mmol?H2O2和0.126mmol?ABTS2-

8.一種實現上述可視化鑒定美洲大蠊的方法的試劑盒,其特征在于:包含探針I;探針I的序列如下:

5’-AACTTTATTACTAGCTAGTAGTATAGTAGAAAGAGGTGCCGGA-3’;

其中,方框框住部分為前綴序列;與劃橫線部分序列反向互補,起到沉默空白的作用;粗體字部分為G-四聯結構。

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