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[發明專利]磁珠法提取細菌基因組DNA的試劑盒及其提取方法有效

專利信息
申請號: 201410388366.0 申請日: 2014-08-08
公開(公告)號: CN104212793B 公開(公告)日: 2017-04-19
發明(設計)人: 郝榮章;宋宏彬;李楊;趙榮濤;許金坤;盧曉;董世彪;邱少富;王勇;賈雷立;李鵬;謝靖;王立貴;吳志豪 申請(專利權)人: 中國人民解放軍疾病預防控制所
主分類號: C12N15/10 分類號: C12N15/10
代理公司: 杭州求是專利事務所有限公司33200 代理人: 邱啟旺
地址: 100071*** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 磁珠法 提取 細菌 基因組 dna 試劑盒 及其 方法
【權利要求書】:

1.一種磁珠法提取細菌基因組DNA的試劑盒,其特征在于:其包括緩沖液A、緩沖液B、緩沖液C、磁珠懸浮液D、緩沖液E、緩沖液F、緩沖液G七種組分;

所述緩沖液A終濃度組成為:20-50mmol/L葡萄糖、10-30mmol/L三羥甲基氨基甲烷鹽酸鹽、5-20mmol/L乙二胺四乙酸,溶劑為高壓滅菌水,緩沖液A終PH=8.0-8.5;

所述緩沖液B終濃度組成為:15-25mg/ml蛋白酶K、1-5mol/L鹽酸胍、5-25mmol/L檸檬酸鈉、1-2%曲拉通、0.5-5mmol/L EDTA,溶劑為高壓滅菌水,緩沖液B終PH=4.0-5.5;

所述緩沖液C成分組成為:無水乙醇溶液;

所述緩沖液E終濃度組成為:1-5mol/L醋酸鈉,體積分數為20-40%無水乙醇,溶劑為高壓滅菌水,緩沖液E終PH=4.0-5.5;

所述緩沖液F終濃度組成為:10-30mmol/L Tris-HCl、0.5-5mmol/L EDTA、5-25mmol/L檸檬酸鈉和0.3-0.7 L/L的無水乙醇,溶劑為高壓滅菌水 ,緩沖液F終PH=8.0-8.5;

所述緩沖液G終濃度組成為:10-30mmol/L Tris-HCl、0.5-5mmol/L EDTA,溶劑為高壓滅菌水,緩沖液G終PH=8.0-8.5;

所述磁珠懸浮液D成分組成為:每200mmol/L氯化鈉水溶液中含有50mg單分散Fe3O4@SiO2-AEAPS納米磁珠;

所述單分散Fe3O4@SiO2-AEAPS納米磁珠通過以下步驟制備得到:

(1)溶劑熱法制備單分散的四氧化三鐵納米球;

(2)采用改進的St?ber法,在四氧化三鐵納米球外包覆二氧化硅,得到單分散的Fe3O4@SiO2納米球,具體為:稱取0.1g步驟(1)制備得到的四氧化三鐵納米球,向其中依次加入20ml去離子水、80ml無水乙醇和1ml質量分數為28%的氨水,超聲混合均勻后向混合液中加入1ml正硅酸乙酯, 20°C下機械攪拌6小時;反應完畢后,將所得溶液離心,并依次用去離子水和乙醇清洗3次,制得單分散的二氧化硅包覆四氧化三鐵納米球,將所得產物在60°C烘箱中干燥待用;

(3)使用硅烷偶聯劑氨乙基氨丙基聚二甲基硅氧烷對步驟(2)獲得的Fe3O4@SiO2進行硅烷化處理,得到Fe3O4@SiO2-AEAPS;具體為:稱取0.1g步驟(2)得到的Fe3O4@SiO2納米球,加入到20ml二甲基甲酰胺中,超聲分散后得到溶液A;將10ml的氨乙基氨丙基聚二甲基硅氧烷和20ml的二甲基甲酰胺混合均勻后,加入一定量的丁二酸酐使得混合溶液pH值維持在3.9~4.1,60°C下機械攪拌3小時,得到溶液B;將溶液A、B混合后加入20ml去離子水,在60°C下繼續機械攪拌5小時后,將所得溶液離心,并依次用去離子水和乙醇清洗3次,制得單分散的硅烷化的二氧化硅包覆四氧化三鐵納米球Fe3O4@SiO2-AEAPS。

2.一種權利要求1所述的試劑盒提取細菌基因組DNA的方法,其特征在于,包括如下步驟:

(1)取待測細菌培養液1-1.5ml置于2.0ml EP管中,12000 rpm離心1-3min,收集菌體,加入150-300μl 緩沖液A;

(2)向步驟(1)EP管中加入150-300μl緩沖液B,45-65°C水浴孵育5-10min;

(3)向步驟(2)孵育后的EP管中加入150-300μl緩沖液C,混勻后靜置5-10min;

(4)向步驟(3)靜置后的EP管中加入10-50μl磁珠懸浮液D,將EP管置于磁力架上,靜置10-60s后去除液體;

(5)將步驟(4)EP管從磁力架上取下,加入200-600μl緩沖液E,混勻混勻后將EP管置于磁力架上,靜置10-60s后去除液體,再將EP管從磁力架上取下,加入200-1000μl緩沖液F,抽打混勻或振蕩混勻后將EP管置于磁力架上,靜置10-60s后去除液體,室溫靜置5-10min;

(6)將步驟(5)EP管從磁力架上取下,加入50-100μl緩沖液G,混勻后將EP管置于45-65°C水浴孵育5-10min,取出后將EP管置于磁力架上靜置10-60s后將上清液轉移至收集管中,完成細菌DNA的提取。

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