[發(fā)明專利]一種水稻種胚RNA的提取方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410379838.6 | 申請日: | 2014-08-05 |
| 公開(公告)號: | CN105316316A | 公開(公告)日: | 2016-02-10 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張建福;謝華安;魏毅東 | 申請(專利權(quán))人: | 張建福;謝華安;魏毅東 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 350003 福建省福州市五四*** | 國省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 水稻 rna 提取 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種生物技術(shù)領(lǐng)域水稻種胚RNA的提取方法。
背景技術(shù)
近年來,隨著生物技術(shù)的進步和發(fā)展,基因的克隆和表達研究,需要從植物材料中提取高純度的RNA。作為植物分子生物學(xué)的基本實驗技術(shù),盡管RNA的提取技術(shù)已經(jīng)很成熟,但在實際研究中經(jīng)常很難做到順利獲得高質(zhì)量的RNA。其中涉及到很多因素,包括材料保存是否合理,器具處理及操作是否嚴格等,這些因素都容易造成RNA降解。此外,有些植物組織中富含多糖、脂質(zhì)及酚類物質(zhì),往往不利于RNA的分離和純化。植物的種子中富含脂質(zhì)、儲存蛋白和酚類等次生代謝物質(zhì),這些物質(zhì)都不利于RNA的提取。目前市面上出售的植物總RNA提取試劑盒眾多,但均存在一定的缺陷,如提取時間長,提取所需條件較苛刻,提取率低,提取的總RNA完整性較差等缺點。
水稻(OryzaSativaL.)是全球重要糧食作物之一,世界上有超過50%的人口以大米為主食。為培育出高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗性好、環(huán)境適應(yīng)性強、營養(yǎng)利用率高的優(yōu)質(zhì)水稻新品種,分子生物學(xué)方法得到了廣泛的應(yīng)用。本發(fā)明提出了一種高效、高質(zhì)量提取水稻種胚RNA的方法,以期為水稻基因組學(xué)研究奠定重要的工作基礎(chǔ)。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明目的是提供一種水稻種胚RNA的提取方法。
本發(fā)明的技術(shù)方案在于:水稻種胚RNA的提取方法,其特征在于:按照一下步驟進行:
(1)將10粒種子剝胚,將胚裝入EP管中,立即加入200ulTripure(Roche),用尖頭玻璃棒快速捅碎,加入800ulTripure,迅速快速顛倒振蕩30s以上,室溫靜置10min;
(2)加入200ul的氯仿,顛倒振蕩使兩相充分混合,室溫靜置10min;
(3)4℃12000g離心10min,吸取上清約450ul加入等量冰異丙醇,輕輕顛倒振蕩充分混合,室溫靜置10min;
(4)4℃12000g離心15min,棄上清并加入1ml75%乙醇,輕輕吹打沉淀,使之飄起,4℃12000g離心3min,棄上清;
(5)重復(fù)步驟(4),500ul乙醇即可;
(6)將空管12000g離心2min,吸干余液,放置大約30s(時間太長RNA很難復(fù)溶),立即加入30-60ulRNase-freewater,輕輕吹打數(shù)次,使沉淀溶解,隨后水浴65℃5min使其充分溶解并打開二級結(jié)構(gòu);
(7)如果RNA不立即使用,步驟6加入乙醇后,放置-20℃保存(可存數(shù)月),待用時,取出4℃離心后棄上清進行步驟7;
(8)溶解的RNA最好立即測定OD,跑電泳,操作必需在冰上進行。RNA可保存在-20℃短期保存(三個月之內(nèi))或-80℃長期保存。如果RNA重新凍融必須吹打混勻后進行后續(xù)實驗。
上述操作步驟需要全程帶口罩,PE手套要經(jīng)常換。
所述步驟(1)前在提取區(qū)域用75%酒精噴灑,實驗臺用酒精棉擦拭。
所述步驟(1)中迅速快速顛倒振蕩30s以上,如果多個樣品,磨一個樣加一個。
所述步驟(3)中吸取的最多不超過550ul,以防DNA污染。
所述步驟(3)樣品太少可放置-80度或-20度,提高RNA產(chǎn)量。
2、本發(fā)明的優(yōu)點在于:提取的水稻種胚RNA中5S,18S和28S條帶清晰,完整性好,利用Nanodrop2000超微量分光光度計測獲得A260/A280比值均在1.95~2.1之間和A260/A230的比值均約2.0,表明提取的RNA質(zhì)量好,可以用于后續(xù)實驗。
附圖說明
圖1實施例的RNA電泳圖。
具體實施方式
下文通過具體實施案例對本發(fā)明做進一步說明。
實施案例1
水稻種胚RNA的提?。?/b>
實驗所需用品包括研缽,藥匙,鑷子,1.5mlEP管,PCR管,槍頭用0.1%DEPC水泡過夜,120℃高壓1h,烘干存放,研缽使用前用酒精燒或180高溫滅菌6h以上。具體操作步驟如下:
(1)取40粒水稻種子,分成四等份,每份10粒。用清水處理0h、3h、6h、12h;
(2)將上述四組種子依次剝胚,分別胚裝入EP管中,加入200ulTripure(Roche),用尖頭玻璃棒快速捅碎,加入800ulTripure,迅速快速顛倒振蕩40s以上,室溫靜置10min;
(3)加入200ul的氯仿,顛倒振蕩使兩相充分混合,室溫靜置10min;
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